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倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性

许在恩 俞瑜 李兵娟 陈虹君 郭小勤

许在恩, 俞瑜, 李兵娟, 陈虹君, 郭小勤. 倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性[J]. 浙江农林大学学报, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
引用本文: 许在恩, 俞瑜, 李兵娟, 陈虹君, 郭小勤. 倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性[J]. 浙江农林大学学报, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
XU Zaien, YU Yu, LI Bingjuan, CHEN Hongjun, GUO Xiaoqin. Single nucleotide polymorphism of non-ε 14-3-3 genes in Shibataeeae[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
Citation: XU Zaien, YU Yu, LI Bingjuan, CHEN Hongjun, GUO Xiaoqin. Single nucleotide polymorphism of non-ε 14-3-3 genes in Shibataeeae[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011

倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
基金项目: 

国家自然科学基金资助项目(30901155); 浙江省自然科学基金资助项目(Y307499)

详细信息
    作者简介: 许在恩,从事植物分子生物学研究。
    通信作者: 郭小勤,副教授,博士,从事植物生物技术研究。
  • 中图分类号: S795;Q75

Single nucleotide polymorphism of non-ε 14-3-3 genes in Shibataeeae

Funds: 

国家自然科学基金资助项目(30901155); 浙江省自然科学基金资助项目(Y307499)

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  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2015-03-04
  • 修回日期:  2015-04-02
  • 刊出日期:  2016-02-20

倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
    基金项目:

    国家自然科学基金资助项目(30901155); 浙江省自然科学基金资助项目(Y307499)

    作者简介:

    许在恩,从事植物分子生物学研究。

    通信作者: 郭小勤,副教授,博士,从事植物生物技术研究。
  • 中图分类号: S795;Q75

摘要: 为研究倭竹族Shibataeeae中14-3-3非类基因的结构及其编码区单核苷酸多态性,分别从倭竹族5个不同属的代表种中获得14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e,14-3-3f的基因全长。这些基因均包含5个外显子和4个内含子,编码序列(CDS)大小为771~789 bp。14-3-3b,14-3-3c,14-3-3e和14-3-3f编码区序列中分别有21,19,26和17个单核苷酸多态性(SNP)位点,SNP频率分别为1SNP/38 bp,1SNP/41 bp,1SNP/30 bp,1SNP/46 bp,基因核苷酸多样性()值分别为0.012 17,0.011 83,0.015 21,0.010 38。同一基因在不同竹种间氨基酸序列一致性均达99%以上,毛竹Phyllostachys edulis Pe14-3-3b,Pe14-3-3c,Pe14-3-3e,Pe14-3-3f蛋白的理化性质非常相似,均为亲水性蛋白,含量较多的是丙氨酸(ala),谷氨酸(glu),亮氨酸(leu),等电点为4.75~4.90,这4个蛋白的二级结构也非常相似,-螺旋结构含量最高,无规则卷曲其次,-转角和延伸链很少。上述研究为进一步探索竹类植物14-3-3生物学功能奠定基础。图3表3参27

English Abstract

许在恩, 俞瑜, 李兵娟, 陈虹君, 郭小勤. 倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性[J]. 浙江农林大学学报, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
引用本文: 许在恩, 俞瑜, 李兵娟, 陈虹君, 郭小勤. 倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性[J]. 浙江农林大学学报, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
XU Zaien, YU Yu, LI Bingjuan, CHEN Hongjun, GUO Xiaoqin. Single nucleotide polymorphism of non-ε 14-3-3 genes in Shibataeeae[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
Citation: XU Zaien, YU Yu, LI Bingjuan, CHEN Hongjun, GUO Xiaoqin. Single nucleotide polymorphism of non-ε 14-3-3 genes in Shibataeeae[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011

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