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雌性榧树种实性状和SSR标记的遗传变异

李柯豫 陈荣 刘琏 蔡晓郡 姜郑楚 谢前丹 俞晨良 喻卫武

孔德雷, 姜培坤. “双碳”背景下种植业减排增汇的途径与政策建议[J]. 浙江农林大学学报, 2023, 40(6): 1357-1365. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220742
引用本文: 李柯豫, 陈荣, 刘琏, 等. 雌性榧树种实性状和SSR标记的遗传变异[J]. 浙江农林大学学报, 2025, 42(1): 94−102 doi:  10.11833/j.issn.2095-0756.20240254
KONG Delei, JIANG Peikun. Approaches and policy recommendations for reducing emissions and increasing carbon sinks in crop industry under the background of carbon peak and carbon neutrality[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2023, 40(6): 1357-1365. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220742
Citation: LI Keyu, CHEN Rong, LIU Lian, et al. Genetic variation of seed traits and SSR markers in female Torreya grandis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2025, 42(1): 94−102 doi:  10.11833/j.issn.2095-0756.20240254

雌性榧树种实性状和SSR标记的遗传变异

DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20240254
基金项目: 浙江省果品育种重大专项(2021C02066-11)
详细信息
    作者简介: 李柯豫(ORCID: 0009-0000-2764-0007),从事经济林培育研究。E-mail: 1554106281@qq.com
    通信作者: 喻卫武(ORCID: 0000-0003-4246-4287),高级实验师,从事经济林栽培与产品分析研究。E-mail: yww888@zafu.edu.cn
  • 中图分类号: S722.3

Genetic variation of seed traits and SSR markers in female Torreya grandis

  • 摘要:   目的  探究不同种群雌性榧树Torreya grandis种实性状,基于简单重复序列标记(SSR)引物对榧树的种群遗传变异进行分析,比较榧树种群间、种群内种实表型、品质及遗传多样性的差异。  方法  以浙江富阳、嵊州、临安、建德及安徽黄山种群雌性榧树为材料,通过方差分析、主成分分析对榧树叶片及种实表型进行比较;以浙江富阳、嵊州、临安、淳安及安徽黄山种群雌性榧树为材料,通过SSR分子标记对榧树遗传多样性进行比较。  结果  榧树种实分析发现:叶质量、叶形指数、种实质量、种形指数、种核质量、核形指数、假种皮厚、种壳厚等8个指标在种群间和种群内个体差异极显著(P<0.01);脂肪相对含量及可溶性糖质量分数在种群间差异极显著(P<0.01),脂肪相对含量为29.36%~42.35%,榧树种实外观和种仁品质变异丰富。SSR引物分析发现:榧树种群的Nei’s遗传多样性指数(H)均值为0.400,Shannon’s信息指数(I)均值为0.650,多态性信息含量(PIC)均值为0.400。淳安种群的遗传多样性(H=0.410,I=0.658)最高,嵊州种群(H=0.369,I=0.565)最低。92%总遗传变异存在于种群内。  结论  榧树种实的表型、品质在种群间和种群内存在遗传变异,淳安种群遗传多样性最高,且种群内遗传变异大于种群间。图2表11参26
  • 全球气候变化是人类目前面临的最为严峻的挑战,威胁着人类的生存和发展。自工业化时期以来,由于人口大幅增加和经济快速增长,造成了大量人为温室气体排放,成为全球气候变暖的主要诱因。世界气象组织(WMO)最新数据显示,2020年大气二氧化碳(CO2)质量分数高达410 mg·kg−1,比工业革命前增长60%。联合国政府间气候变化专门委员会(IPCC)第6次评估报告指出:从未来20 a的平均气温变化来看,全球升温预计将达1.5 ℃。目前,应对气候变化已成为全球共识,减少温室气体排放是缓解全球气候变暖的有效途径[1]。在此背景下,中国政府在2020年第75届联合国大会上向世界承诺,力争于2030年前实现CO2排放达到峰值,努力争取2060年前实现碳中和。碳达峰碳中和(“双碳”)是一场广泛而深刻的经济社会系统性变革,碳达峰碳中和目标纳入中国生态文明建设整体布局,上升为国家战略。种植业是实现碳达峰碳中和目标的重要领域之一。与其他行业不同,种植业既是重要的温室气体排放源,又有着巨大的固碳增汇潜力,推进种植业领域减排增汇将在实现碳达峰碳中和目标进程中发挥举足轻重的作用[23]。本研究针对种植业碳达峰碳中和目标的实现途径进行梳理总结,并提出进一步的见解,从而为种植业助力国家实现碳达峰碳中和目标提供理论支撑和科学建议。

    种植业生态系统不仅是碳源同时也是碳汇。一方面,种植业生产活动会导致包括CO2、氧化亚氮(N2O)和甲烷(CH4)在内的温室气体排放,这部分温室气体约占全球碳排放总量的25%[45]。另一方面,种植业中的农田、森林和草地等生态系统通过光合作用进行生物固碳,每年固碳量能抵消全球30%的人为碳排放量[67]。可见种植业减排增汇是应对全球气候变暖,实现碳达峰碳中和目标不可或缺的重要组成部分。

    种植业是非二氧化碳温室气体(N2O和CH4)的主要排放源,在100 a时间尺度上,N2O和CH4的全球增温潜势分别是CO2的298和34倍[8]。全球人为温室气体排放量在过去几十年显著增加,其中种植业N2O排放占全球人为N2O排放总量的60%以上[9],种植业CH4排放贡献了全球人为CH4排放量的10%左右[10]

    N2O是硝化和反硝化作用的主要产物。硝化作用是指还原态氮[铵离子(NH4 +)、氨气(NH3)和有机氮(RNH2)]在微生物作用下变为氧化态氮[硝酸根(NO3 )和亚硝酸根(NO2 )]的过程。N2O是还原态氮在硝化微生物作用下被氧化为氧化态氮过程中产生的副产物。通常情况下,反硝化作用是指在厌氧条件下,NO3 或NO2 被硝化微生物还原为一氧化氮(NO)和N2O,然后进一步被还原为氮气(N2)的过程。反硝化过程是将自然界的活性氮转变为惰性氮的过程,因此反硝化过程对维持大气氮素平衡具有很重要的意义。农田土壤是最大的N2O排放源。过量施用氮肥造成土壤N2O排放增加,是导致大气N2O质量分数上升的主要因素。由于过量施用氮肥导致的土壤N2O排放量约为3.3 Tg·a−1,占全球人为N2O排放总量的65%[8]。同时,土壤N2O排放受土壤水分状况的影响,淹水稻田在中期烤田期会强烈刺激N2O的排放。近年来,随着全球水资源短缺以及节水灌溉措施的快速发展,节水灌溉稻田成为农业N2O新的排放源[1112]。此外,农作物秸秆不完全焚烧也会产生N2O,但数量极少。

    CH4主要在厌氧环境条件下产生,它的种植业排放源主要包括:一是长期处于淹水条件下的稻田,土壤中的产甲烷菌利用有机物料(如根系分泌物、动植物残体以及有机肥等)产生CH4,进而排放到大气中[1314]。稻田CH4排放量受到土壤水肥管理措施以及土壤有机质的影响。在一定范围内,稻田淹水高度越大,土壤中有机质越多,CH4排放量越大。二是作物秸秆不完全焚烧也会产生CH4

    除了上述直接排放,种植业生产过程中还会有大量的间接碳排放。农作物种植过程中使用的农机、农药、化肥和农膜等农业投入品在制造过程中也会排放大量温室气体[1516]。有研究报道:农用柴油、农药、化肥和农膜等农业生产资料引起的间接排放占中国农业温室气体排放总量的34%[17]。根据《中国农村统计年鉴》,1990年以来,中国农用柴油、农药、化肥和农膜等的投入量分别上升了115%、131%、137%和440%,由此导致农业间接温室气体排放量以年均2%的速度增长[18]

    种植业碳汇主要指农田土壤碳汇。土壤碳库是地球陆地生态系统中最大的碳库,其碳储量约为陆地植被碳库或大气碳库的2~4倍[19]。土壤具体是如何固碳的呢?土壤固定的碳最初都来源于大气。首先,植物通过光合作用将大气中CO2转化为有机物质,然后有机物质内的碳通过根系分泌物、死亡的根系以及枝叶凋落物进入土壤,并在土壤微生物的作用下,转化为土壤有机质储存于土壤中,形成土壤碳库。简单来说,土壤可以通过植物来吸收、转化、储存大气中的CO2。《第二次气候变化国家评估报告》指出:中国土壤碳库碳储量约为103 Pg。土壤碳库的微弱变化都有可能引起大气CO2浓度的巨大变化,从而影响全球气候变化。目前,中国农业发展水平较低,农田土壤固碳增汇潜力巨大。中国总耕地面积大约为1.3 亿hm2,土壤碳库尤其是主要农业区表层土壤有机碳质量分数较低。根据《2019年全国耕地质量等级情况公报》,全国耕地质量平均等级为4.76等,中低等级耕地占2/3以上,耕作层变浅、土壤退化以及耕地质量普遍较低是中国农业耕地的现状。全国耕地平均有机碳质量分数低于世界平均值30%以上,低于欧美等发达国家和地区50%以上[20]。美国著名土壤学家LAL[21]研究发现:美国土壤每年固碳潜力为7.5~20.8 Gg,中国农田土壤固碳潜力为22.0~37.0 Tg。在所有的碳中和负碳技术中,土壤固碳被公认为是成本最低、最具有潜力、最易实现和操作的,能有效冲抵能源、交通、工业等领域的碳排放。因此,只要技术合理,农田土壤固碳增汇潜力巨大,是实现中国碳达峰碳中和目标的重要支撑。

    2.1.1   农田土壤N2O减排

    农田土壤N2O减排可采用减少氮肥施用、优化施肥模式、使用新型肥料(如全元生物有机肥、生物质炭基肥)和抑制剂(如缓控释肥、硝化抑制剂)、提高水肥耦合等措施,在增加作物产量的同时,有效减少N2O排放,提高氮肥利用效率,降低肥料投入成本,实现增产与减排协同。李玥等[22]指出:合理施氮是农田土壤N2O减排的关键,并提出“4R”的施肥理念,即正确的施肥量、正确的肥料类型与配比、正确的施肥时间和正确的施肥方法。尽管有机肥施用存在增加土壤N2O排放的风险[23],但在合理施氮情况下利用有机肥部分替代化学氮肥既可以提高土壤肥力,改善土壤性状,又可以通过减少土壤氮底物有效性而降低农田土壤N2O排放[2425]。生物质炭基肥是将生物质炭与氮磷钾肥按照特定比例混合后造粒包膜制成,可以替代普通化肥施用,同时增施了有机质。大田试验研究表明:生物质炭基肥替代化学肥料可有效减少农田N2O排放17%~64%[26],部分试验结果还显示可减少稻田CH4排放[2728]。硝化抑制剂可以通过降低硝化速率实现农田土壤N2O减排。目前市面上常见的硝化抑制剂有3,4-二甲基磷酸盐(DMPP)、双氰胺(DCD)和四氮本啶(nitrapyin)等。施用硝化抑制剂可降低38%的农田土壤N2O排放,但不同地区土壤和硝化抑制剂种类的减排效果存在显著差异[29]。研究表明:施用硝化抑制剂可分别降低旱作农田和稻田N2O排放46%和32%[3031]。为了农田N2O减排,在考虑肥料施用的同时也要关注土壤水分状况,不同水分条件对土壤N2O排放影响较大。李金秋等[32]通过田间试验发现:施肥和水分管理均显著影响双季稻田N2O排放,常规灌溉和尿素施用增加稻田N2O排放,而常规灌溉管理和有机肥配施化肥模式,既能保证水稻产量,又能实现减氮和减排效果,是当地值得参考的水肥管理模式。因此,今后的农田N2O减排也要综合考虑多方面因素,制定和开展减排措施。

    2.1.2   稻田CH4减排

    稻田CH4减排可采用中期排水烤田、控制灌溉以及湿润灌溉等节水灌溉水分管理措施来实现[3335]。节水灌溉在减少稻田CH4排放的同时,可能会刺激土壤N2O排放。作物秸秆还田和有机肥施用可减少土壤N2O排放,但外源有机物质的添加会加剧CH4排放。因此,只有将优化施肥模式与节水灌溉措施相结合,才有可能减少稻田综合温室气体排放。就水旱轮作农田生态系统而言,如水稻Oryza sativa-小麦Triticum aestivum轮作、水稻-油菜Brassica napus轮作,可采取在旱作生长季施用有机肥或秸秆还田,既可以提高土壤碳库储量,又可以避免有机物质的添加造成的稻田CH4排放[36]。有研究表明:施用CH4抑制剂、生物质炭或生物质炭基肥等新型肥料,可作为降低稻田CH4排放的有效手段,是种植业固碳减排协同技术的发展新方向[3738]。同时,还可利用先进的作物遗传育种手段,选育推广高产、优质、低碳水稻品种,降低水稻单产CH4排放强度。

    2.1.3   种植业间接碳排放减排

    针对种植业生产造成的间接碳排放,实施化石能源消耗减量措施,主要包括对种植业生产中机械设备进行更新改造,加快老旧农机报废更新力度,推广先进适用的低碳节能农机装备,推广新能源技术,优化农机装备结构,加快绿色、智能、复式、高效农机化技术装备普及应用,降低化石能源消耗和CO2排放[3940]。以粮食和重要农产品生产所需农机为重点,推进节能减排。实施更为严格的农机排放标准,减少废气排放。因地制宜发展复式、高效农机装备和电动农机装备,培育壮大新型农机服务组织,提供高效便捷的农机作业服务,减少种子、化肥、农药、水资源用量,提升作业效率,降低能源消耗。加快侧深施肥、精准施药、节水灌溉、高性能免耕播种等机械装备推广应用,大力示范推广节种、节水、节能、节肥、节药的农机化技术。实施农机报废更新补贴政策,加大能耗高、排放高、损失大、安全性能低的老旧农机淘汰力度。

    2.2.1   有机肥施用和秸秆还田

    一方面,施用有机肥可以促进作物根系发育,在微生物的作用下能固定更多的CO2,且土壤团聚体稳定性显著增强,可以减少土壤中碳的损失。另一方面,有机肥施用可以提高土壤有机质质量分数。土壤有机质既有易被微生物利用的不稳定态,又包括与土壤健康密切相关的稳定态的可以长期储存碳的腐殖质。有机肥的类型、用量、配施等都会影响土壤固碳效果[41]。研究表明:长期施用有机肥可显著提高双季稻田碳汇效应与经济效益,绿肥紫云英Astragalus sinicus与猪粪和秸秆配施,稻田生态系统碳汇效益与经济效益较单施绿肥紫云英优势更明显。有机肥和无机肥配施可以增加土壤有机碳的积累。有机农业生态系统土壤有机碳比常规生态系统高20%,在前15 a土壤碳存储速率最高。秸秆还田是通过秸秆粉碎抛撒、机械还田,配套应用调氮促腐技术,将碳保留在土壤中,增加土壤有机质,减少化肥施用量,具有减肥增产、固碳、降污多重效果[42]

    2.2.2   大力推广保护性耕作

    保护性耕作是对农田采用少耕、免耕或地表微型改造,结合覆盖、轮作、农药病虫害防除等措施,确保耕地可持续利用的综合性土壤管理技术体系。保护性耕作可以减少对土壤的扰动,降低土壤侵蚀,促进蓄水保墒,提高表层土壤有机碳质量分数,增强土壤固碳增汇能力[43]。相比自然植被,农业种植导致土壤有机碳显著降低,农田表层土壤的有机碳储量较草地和林地土壤分别降低45%和52%,这是由于农业耕作显著加速了不稳定颗粒有机质的周转,减少了稳定有机碳组分的形成,从而导致土壤有机碳库储量明显下降[44]。另外,土壤翻耕会破坏土壤团聚体结构、加速有机质分解,风和水的侵蚀增强,导致暴露和侵蚀的土壤中的碳以温室气体的形式排放到大气中。犁耕的碳排放量是免耕的14倍,即使采用保护性耕作机具,碳损失量也达到免耕的4倍[45]。因此,从常规深耕转向少耕或免耕可改善土壤结构、减少碳排放,增加土壤有机碳储量。在秸秆还田的基础上,免耕可显著提高表层土壤有机碳质量分数。

    2.2.3   种植业废弃物热解炭化还田

    中国种植业废弃物资源化利用仍处于起步阶段,农作物秸秆资源化利用是种植业废弃物资源化工作的重大挑战。目前,中国种植业废弃物常见的利用方式主要包括农作物秸秆还田和好氧堆肥还田。这些利用方式虽然可以小幅度增加土壤碳库,但是其生产或应用环节同样会造成大量温室气体排放[46]。因此,种植业废弃物的利用应基于种植业增汇和减排双重考虑。与秸秆直接还田和好氧堆肥等方式相比,废弃物热解炭化既充分保留了废弃物中的有机质和各种养分,又实现废弃物的多元、清洁和安全利用。热解炭化的主要产物生物炭质是一种富含稳定有机质和矿质养分的多组分固体炭质,具有稳定、疏松多孔且环境友好的特点[47]。利用不同性质的种植业废弃物热解炭化,可充分挖掘其养分、炭质和结构的优势,创造清洁高效、安全卫生和功能丰富的炭基产品。种植业废弃物热解炭化后还田,可以将作物光合作用固定的碳返还并长期保存于土壤,补充土壤有机碳和养分的同时能有效改善土壤结构,平衡土壤酸碱度,提升土壤缓冲性和保肥蓄水能力,为土壤固碳增汇和种植业绿色发展提供了新路径[37]。2017年,秸秆炭化还田被列入国家十大秸秆处理模式之一。2020—2021年,秸秆炭化还田入围农业农村部重大引领性技术榜单。

    实现种植业碳中和不仅需要上述传统的技术创新途径,还需要依靠新兴的经济金融手段——碳标签与碳交易。在全球绿色低碳发展的环境和经济背景下,世界农业也已进入可持续发展的低碳农业经济时代,碳标签、碳足迹和碳交易这些新兴概念应运而生。碳足迹是产品在整个生命周期内的温室气体排放总量,一般用CO2当量形式表达[48]。将碳足迹展现于产品标签之上,即碳标签。碳标签既是碳足迹的延伸也是碳足迹的载体。碳标签的主要作用是呈现产品或服务对全球变化影响的信息,把产品或服务从生产到消耗整个生命周期过程中的碳足迹在产品标签上用量化的数值标示出来。消费者可通过产品碳标签了解产品整个生命周期中的碳排放信息,引导消费者选购更加低碳绿色的产品和服务,促使企业采用各种减排措施减少碳排放,从而促进低碳社会的发展[49]。碳标签制度将自下而上地推动中国碳减排工作由强制到自愿的转变。这一新工具的产生运作必然推动中国向低碳经济发展。产品碳足迹计算是农产品碳标签制度推行的关键,作为企业应适应国际规则,积极发展低碳经济;作为消费者应培养低碳意识,养成环境友好型消费习惯;作为政府应积极扶持,助力企业产品向低碳化和标签化发展。目前应结合国家碳中和战略目标,加快推进特色农产品碳标签制度进程,促进低碳种植业的发展,助推种植业碳中和。

    碳交易以可持续发展为核心,以配额交易及核证自愿减排量(CCER)交易为主要内容,充分利用市场经济对绿色发展所发挥的重要作用,不同类型企业根据自身碳排放情况对规定的碳排放配额进行配置,或用于自身发展需要,或用于市场交易,最终形成宏观和微观相结合的有重点、多层次碳排放交易格局。现阶段,中国碳交易机制具有全国交易系统与试点地区交易所相结合、行业要求与排量要求相结合、排放配额与自愿减排量相结合等特点。中国碳交易市场已有长足发展,但目前种植业碳交易特别是农田土壤碳汇交易尚处于起步阶段。在实现种植业碳中和战略目标的过程中,碳交易是不可或缺的一部分。应积极推动形成政府主导、社会参与、市场化运作的种植业碳交易体系,在保障国家粮食安全与重要农产品有效供给的同时,降低碳排放、增加碳汇,并使农民在碳排放交易中的得到更多红利,最终形成与资源环境承载力相匹配,与生产生活生态相协调的种植业低碳发展新格局。

    实施种植业碳达峰碳中和要以全面推进乡村振兴、加快农业农村现代化为引领,以绿色低碳科技创新为支撑,以降低温室气体排放强度、提高农田土壤固碳增汇能力、实施农业废弃物资源化利用为抓手,全面提升农业综合生产能力,建立完善监测评估体系,完善政策保障机制,加快形成资源节约型和环境友好型的农业产业结构、生产方式和空间格局。

    第一,追求种植业碳达峰碳中和战略目标必须以保障粮食安全为前提。中国是人口大国,粮食安全具有重大意义,所以必须充分认识到种植业减排增汇必须以保障国家粮食安全和重要农产品有效供给为前提,科学确定减排增汇途径,合理设定碳排放峰值。种植业领域的特殊性要求不能舍弃粮食产量去偏面追求种植业减排增汇。在稳步推进田间减排的同时,要努力挖掘种植业生产过程中节能减排的潜力,大力推广先进环保节能新农具,通过提高种植业生产环节的智能化、精准化水平,降低农业投入品的使用量,从而降低能源消耗。

    第二,重点围绕农作物秸秆资源化利用,加快推进种植业废弃物热解炭化还田。全球气候变化背景下中国种植业面临耕地质量与农产品安全的巨大挑战,数十亿吨的种植业废弃物处置与资源化利用任务艰巨。在应对气候变化挑战时,应充分挖掘种植业废弃物资源,政府提供技术和资金扶持,发展以热解炭化为基础的生物质技术与产业,满足国家绿色可持续农业发展与种植业减排增汇需求。未来需要积极开发创新热解炭化装备、炭基肥料、炭基材料等技术方法,推动炭基集成技术与产业模式的大规模推广,提高种植业生产者的参与积极性,不断释放种植业助力碳中和的潜力。

    第三,加快技术创新,加强创新能力保障。在国家碳达峰碳中和的战略目标背景下,需要更大力度的技术创新。支持部分基础条件好、特色鲜明的综合性高校和行业高校,先行建设一批碳达峰碳中和领域新学院、新学科和新专业,鼓励自然科学与社会科学的交叉融合研究,培养碳达峰碳中和战略复合型人才。推动高校参与或组建碳达峰碳中和相关的国家重点实验室和国家技术创新中心,引导高等学校建设一批高水平国家科研平台。鼓励高校实施碳中和交叉学科人才培养专项计划,大力支持跨学院、跨学科组建科研和人才培养团队,以大团队、大项目支撑高质量本科生和研究生多层次培养。鼓励高校加强碳达峰碳中和领域高素质师资队伍建设。加大碳达峰碳中和领域课程、教材等教学资源建设力度。同时出台针对农业碳达峰碳中和的法律法规,制定相应的技术标准,组织和建立研究机构和研究平台,投入资金和科研力量,加快技术创新,研发颠覆性技术,探索区域化的整体解决方案。

    第四,充分发挥政策驱动作用,加快建设种植业碳交易市场,充分挖掘种植业减排增汇的经济价值,着力提升市场内生动力。目前,种植业碳金融市场建设缓慢,与工业行业日趋成熟的碳排放核算方法相比,低碳种植业领域仍缺乏具有权威性、一致性、可操作性的碳排放核算方法。通过构建完善种植业碳标签评估标准和种植业碳排放核算方法,强化种植业碳补贴等方式,加强对种植业碳减排的政策引导,推动数字科技在金融支持种植业碳减排领域中的创新应用。在推进种植业碳交易市场扩大的过程中,政府应做好统一碳市场的顶层设计,以防止不良竞争,保证政策的可执行性及有效性;构建种植业低碳发展政策体系,制定低碳种植业发展的正负面清单,探索种植业生态产品价值实现机制,优化、创设包括法律法规、规范标准、生态补偿、监测预警、财政税收、金融信贷等多种类型政策工具,为中国种植业低碳发展提供长效规制、约束与激励。

  • 图  1  基于Structure分析的5个榧树种群的遗传结构图

    Figure  1  Genetic structure of 5 T. grandis populations based on structure analysis

    图  2  5个榧树种群的UPGMA聚类图

    Figure  2  UPGMA dendrograme of 5 T. grandis populations

    表  1  雌性榧树种群叶片与种实表型

    Table  1.   Leaf and seed phenotypes of female quince populations in T. grandis

    种群叶质量叶形指数种实质量种形指数假种皮厚种核质量核形指数种壳厚
    数值/gCV/%数值CV/%数值/gCV/%数值CV/%数值/mmCV/%数值/gCV/%数值CV/%数值/mmCV/%
    富阳0.02±0.0131.10.15±0.0210.810.70±2.4222.60.78±0.079.03.53±0.3610.24.77±1.2726.50.66±0.0710.20.54±0.1119.7
    嵊州0.02±0.0129.90.16±0.0211.211.85±3.3628.30.79±0.056.53.67±0.7821.34.92±1.1823.90.68±0.068.90.72±0.2534.6
    黄山0.02±0.0119.20.16±0.0211.69.50±2.2722.90.81±0.075.52.94±0.5317.84.51±0.9319.00.71±0.075.80.91±0.1721.1
    临安0.02±0.0133.90.16±0.0215.39.50±2.2723.90.81±0.078.22.94±0.5318.14.51±0.9320.60.71±0.079.50.91±0.1719.1
    建德0.02±0.0133.80.17±0.029.511.19±2.4121.50.83±0.056.13.63±0.4612.84.58±0.9721.10.70±0.057.80.85±0.1314.7
      说明:数值为均值±标准差;CV为变异系数。
    下载: 导出CSV

    表  2  榧树叶片与种实表型的方差分析

    Table  2.   Variance analysis of phenotypic parameters of the leaf and seeds in T. grandis

    指标变异来源平方和自由度均方F指标变异来源平方和自由度均方F
    叶质量 种群间0.22040.005121.000种核质量种群间358.014489.503112.981
    个体间0.028290.00121.158个体间355.3262912.25315.467
    叶形指数种群间0.18140.04550.937核形指数种群间0.60040.15064.909
    个体间0.252290.0099.779个体间1.256290.04318.755
    种实质量种群间2 530.9504632.737191.245假种皮厚种群间796.6464199.16291.175
    个体间1 612.4712955.60216.806个体间484.0262916.6917.641
    种形指数种群间0.40840.10246.454种壳厚 种群间16.01844.005116.324
    个体间1.194290.04118.764个体间10.813290.37310.831
      说明:所有指标P=0.000。
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    表  3  5个榧树种群种仁的脂肪相对含量

    Table  3.   Lipid content of the kernel among 5 T. grandis populations

    种群脂肪相对含量/%CV/%
    最大值最小值平均值±标准差
    富阳47.7918.2529.36±6.34 d21.6
    嵊州48.1430.6242.35±3.77 a8.9
    黄山46.8133.6140.93±3.19 ab7.8
    临安44.9032.1939.82±3.07 b7.7
    建德40.5216.1933.96±4.66 c13.7
      说明:不同字母表示不同种群间差异显著(P<0.05)。CV为变异系数。
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    表  4  5个榧树种群脂肪酸组成的变异

    Table  4.   Variation in fatty acid composition among 5 T. grandis populations

    种群棕榈酸/%硬脂酸/%油酸/%亚油酸/%亚麻酸/%花生一烯酸/%
    相对含量CV相对含量CV相对含量CV相对含量CV相对含量CV相对含量CV
    富阳 10.70±2.59 24.0 2.97±1.14 38.0 28.29±6.06 21.0 41.82±8.01 19.0 0.52±0.17 32.0 0.91±0.37 40.0
    嵊州 8.52±1.22 14.0 2.18±0.47 21.0 23.78±4.26 18.0 47.85±2.88 6.0 0.50±0.06 12.0 0.67±0.09 14.0
    黄山 8.06±0.98 12.0 2.97±0.54 18.0 26.21±2.87 11.0 46.81±2.35 5.0 0.47±0.05 11.0 0.65±0.08 13.0
    临安 8.47±0.88 10.0 2.15±0.46 22.0 23.63±2.40 11.0 49.00±2.45 5.0 0.57±0.00 14.0 0.59±0.09 16.0
    建德 9.58±1.83 19.0 2.80±0.92 33.0 23.47±2.63 11.0 46.49±3.67 8.0 0.48±0.07 14.0 0.67±0.10 15.0
    种群 花生二烯酸/% 金松酸/% 饱和脂肪酸/% 不饱和脂肪酸/% 单不饱和脂肪酸/% 多不饱和脂肪酸/%
    相对含量 CV 相对含量 CV 相对含量 CV 相对含量 CV 相对含量 CV 相对含量 CV
    富阳 2.42±0.63 26.0 10.76±2.14 20.0 13.68±3.45 25.0 84.71±4.39 5.0 29.20±6.34 22.0 55.52±10.16 18.0
    嵊州 2.80±0.75 27.0 12.61±2.02 16.0 10.70±1.32 12.0 88.22±2.04 2.0 24.45±4.30 18.0 63.77±4.36 7.0
    黄山 2.64±0.41 15.0 11.11±1.25 11.0 11.03±0.88 8.0 87.89±0.97 1.0 26.86±2.89 11.0 61.03±2.97 5.0
    临安 2.60±0.53 20.0 12.00±0.98 8.0 10.63±1.06 10.0 88.39±1.14 1.0 24.22±2.52 10.0 64.18±2.92 5.0
    建德 2.49±0.40 16.0 11.98±1.56 13.0 12.38±2.16 17.0 85.58±2.95 3.0 24.14±2.59 11.0 61.44±4.63 8.0
      说明:数值为平均值±标准差。CV为变异系数。
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    表  5  5个榧树种群种仁的可溶性糖质量分数

    Table  5.   Soluble sugar content of the kernel among 5 T. grandis populations   

    种群可溶性糖质量分数/(mg·g−1)
    最大值最小值平均值±标准差CV/%
    富阳47.9132.1040.23±4.80 c11.9
    嵊州65.5629.3545.35±8.77 b19.3
    黄山60.0231.8044.38±7.56 b17.0
    临安54.3437.2447.75±4.18 ab8.8
    建德68.6834.3650.49±9.26 a18.3
      说明:不同字母表示不同种群间差异显示(P<0.05)。CV为变异系数。
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    表  6  5个榧树种群叶片和种实表型、品质的主成分分析

    Table  6.   Principal components of leaf and plant phenotypes among 5 T. grandis populations

    指标主成分指标主成分
    123456123456
    种实质量0.0740.856−0.0820.387−0.0070.263硬脂酸0.724−0.236−0.2170.2480.062−0.061
    种核质量0.1160.8190.0910.132−0.1870.305油酸0.731−0.431−0.2510.1570.1320.269
    种形指数0.010−0.1310.7410.3700.466−0.085亚油酸−0.9460.1420.046−0.106−0.0110.009
    核形指数−0.099−0.0970.8340.1940.3700.003亚麻酸0.239−0.0470.295−0.204−0.3140.120
    种皮厚度0.1050.498−0.3210.5290.2590.054花生一烯酸0.804−0.0460.027−0.0470.076−0.017
    种壳厚度−0.367−0.2430.3400.082−0.3330.327花生二烯酸−0.3720.114−0.1780.1520.369−0.310
    叶片质量0.2020.2890.049−0.5330.4960.190金松酸−0.6490.4240.186−0.152−0.176−0.397
    叶形指数−0.116−0.1790.0560.614−0.416−0.391饱和脂肪酸0.9430.0930.1600.000−0.124−0.106
    含油率−0.459−0.485−0.1950.3190.0180.426不饱和脂肪酸−0.927−0.113−0.194−0.0250.1310.114
    可溶性糖−0.1990.0100.4970.044−0.2070.330特征值6.1532.6182.1841.5951.3871.138
    棕榈酸0.8430.2210.296−0.111−0.181−0.105累计贡献率/%30.7643.8554.7762.7569.6875.38
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    表  7  榧树13个SSR位点的遗传参数

    Table  7.   Genetic parameters of 13 SSR loci in T. grandis

    引物
    编号
    平均等位
    基因数/个
    有效等位
    基因数/个
    观测
    杂合度
    期望
    杂合度
    Nei’s遗传
    多样性指数
    Shannon’s
    指数
    引物
    编号
    平均等位
    基因数/个
    有效等位
    基因数/个
    观测
    杂合度
    期望
    杂合度
    Nei’s遗传
    多样性指数
    Shannon’s
    指数
    ZAFU-1 3.7501.6040.2250.3660.3620.661GR984.3753.2300.6970.6950.6881.252
    ZAFU-3 1.6251.1200.0300.0910.0900.164TG191.6251.0160.0000.0150.0150.039
    ZAFU-5 2.5002.0040.5500.5060.5010.709TG555.3752.7060.5840.6220.6161.112
    ZAFU-6 2.0001.4950.2890.3290.3250.504TG702.5001.9860.9120.5020.4960.698
    ZAFU-8 2.0002.0000.9970.5050.5000.693TG812.0001.0140.0000.0140.0140.041
    ZAFU-112.6251.9610.4620.4910.4860.713TG883.7502.4530.4920.5930.5871.022
    GR12  3.0002.0950.3410.5250.5190.839平均2.8561.8990.4290.4040.4000.650
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    表  8  5个榧树亲本种群的遗传多样性

    Table  8.   Genetic diversity among 5 T. grandis populations

    种群  平均等位基因数/个有效等位基因数/个观测杂合度期望杂合度Nei’s遗传多样性指数Shannon’s指数多态位点百分比/%
    富阳  2.6921.8480.4310.3870.3810.62584.62
    嵊州  2.1541.7910.3770.3760.3690.56584.62
    黄山  2.2311.8110.4510.3990.3920.61184.62
    临安  2.4621.9170.4640.4060.3990.64876.92
    淳安  2.4621.9540.4230.4180.4100.65876.92
    种群水平2.4001.8640.4290.3970.3900.62181.54
    物种水平3.2311.9250.4290.4060.4050.67192.31
      说明:种群水平指5个种群平均值;物种水平指5个种群中所有物种平均值。
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    表  9  5个榧树种群的遗传分化

    Table  9.   Genetic differentiation among 5 T. grandis populations

    种群总遗传
    多样性
    种群内
    近交系数
    种群间
    近交系数
    遗传分
    化指数
    基因流
    富阳 0.457−0.1130.0580.1531.381
    嵊州 0.475−0.0030.2060.2090.946
    黄山 0.491−0.1320.0540.1881.082
    临安 0.527−0.1430.1200.2300.838
    淳安 0.534−0.0130.2070.2180.898
    平均值0.497−0.0810.1290.1991.029
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    表  10  5个榧树种群的分子方差分析

    Table  10.   Molecular variance among 5 T. grandis populations   

    来源自由度平方和均方方差分量变异百
    分比/%
    P
    种群间467.42716.8570.41680.081
    种群内141664.2514.7114.71192
    总数 145731.6785.127100
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    表  11  5个榧树种群的遗传距离和遗传相似度

    Table  11.   Genetic distance and genetic identity among 5 T. grandis populations

    种群富阳嵊州黄山临安淳安
    富阳0.9760.9770.9770.962
    嵊州0.0240.9700.9710.957
    黄山0.0230.0310.9730.946
    临安0.0230.0300.0270.977
    淳安0.0380.0450.0550.024
      说明:对角线下方为遗传距离,对角线上方为遗传相似度。
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出版历程
  • 收稿日期:  2024-03-22
  • 修回日期:  2024-05-14
  • 录用日期:  2024-05-28
  • 网络出版日期:  2025-01-20
  • 刊出日期:  2025-02-20

雌性榧树种实性状和SSR标记的遗传变异

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20240254
    基金项目:  浙江省果品育种重大专项(2021C02066-11)
    作者简介:

    李柯豫(ORCID: 0009-0000-2764-0007),从事经济林培育研究。E-mail: 1554106281@qq.com

    通信作者: 喻卫武(ORCID: 0000-0003-4246-4287),高级实验师,从事经济林栽培与产品分析研究。E-mail: yww888@zafu.edu.cn
  • 中图分类号: S722.3

摘要:   目的  探究不同种群雌性榧树Torreya grandis种实性状,基于简单重复序列标记(SSR)引物对榧树的种群遗传变异进行分析,比较榧树种群间、种群内种实表型、品质及遗传多样性的差异。  方法  以浙江富阳、嵊州、临安、建德及安徽黄山种群雌性榧树为材料,通过方差分析、主成分分析对榧树叶片及种实表型进行比较;以浙江富阳、嵊州、临安、淳安及安徽黄山种群雌性榧树为材料,通过SSR分子标记对榧树遗传多样性进行比较。  结果  榧树种实分析发现:叶质量、叶形指数、种实质量、种形指数、种核质量、核形指数、假种皮厚、种壳厚等8个指标在种群间和种群内个体差异极显著(P<0.01);脂肪相对含量及可溶性糖质量分数在种群间差异极显著(P<0.01),脂肪相对含量为29.36%~42.35%,榧树种实外观和种仁品质变异丰富。SSR引物分析发现:榧树种群的Nei’s遗传多样性指数(H)均值为0.400,Shannon’s信息指数(I)均值为0.650,多态性信息含量(PIC)均值为0.400。淳安种群的遗传多样性(H=0.410,I=0.658)最高,嵊州种群(H=0.369,I=0.565)最低。92%总遗传变异存在于种群内。  结论  榧树种实的表型、品质在种群间和种群内存在遗传变异,淳安种群遗传多样性最高,且种群内遗传变异大于种群间。图2表11参26

English Abstract

孔德雷, 姜培坤. “双碳”背景下种植业减排增汇的途径与政策建议[J]. 浙江农林大学学报, 2023, 40(6): 1357-1365. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220742
引用本文: 李柯豫, 陈荣, 刘琏, 等. 雌性榧树种实性状和SSR标记的遗传变异[J]. 浙江农林大学学报, 2025, 42(1): 94−102 doi:  10.11833/j.issn.2095-0756.20240254
KONG Delei, JIANG Peikun. Approaches and policy recommendations for reducing emissions and increasing carbon sinks in crop industry under the background of carbon peak and carbon neutrality[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2023, 40(6): 1357-1365. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220742
Citation: LI Keyu, CHEN Rong, LIU Lian, et al. Genetic variation of seed traits and SSR markers in female Torreya grandis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2025, 42(1): 94−102 doi:  10.11833/j.issn.2095-0756.20240254
  • 榧树Torreya grandis四季常绿,是红豆杉科Taxaceae植物中少有的集果用、油用、药用、材用、观赏于一体的植物,雌雄异株,生命周期可达上千年。榧树种子含油量高,主要含油酸和亚油酸,不饱和脂肪酸含量远超饱和脂肪酸[1]。饱和脂肪酸中主要是山俞酸和棕榈酸[2]。榧树自然分布于浙江、安徽南部、福建北部、江西东北部,零星分布于贵州松桃、江苏南部、湖南西南部等地,其中以浙江最多,近年来人类活动的干扰加剧了榧树资源的破坏,威胁到部分种群的生存[34]

    遗传多样性是生物多样性的重要组成部分。一个物种的稳定性和进化潜力依赖其遗传多样性,物种的经济和生态价值依赖其特有的基因组成。因此,保护生物多样性的最终目标就是保护遗传多样性[57]。DNA分子标记的数量极多,多态性高,受限制少,检测方法简单易掌握,结果稳定可靠,已被广泛应用于植物多样性研究[89]。简单重复序列标记(SSR)技术是以特异引物PCR为基础的分子标记技术,其特点是标记在整个基因组DNA中随机分布,多态性较高,操作简单,可通过PCR直接扩增来检测,重复性好,成本低[10]

    香榧T. grandis‘Merrillii’是榧树优良的变异类型,具有较高的经济价值[11]。自然环境中榧树结种迟,一般作为香榧嫁接的砧木,雄株因不结种被大量砍伐,使榧树遗传多样性受到影响,但榧树具有丰富的遗传多样性,产生了丰富的变异类型,形成了物种生存与进化的基础,也为资源的开发利用提供了可供选择的物质基础[12]。因此,本研究利用多重比较、方差分析等对不同种群雌性榧树叶片、种实表型、种实营养成分及遗传多样性指标的变异进行分析,以期为榧树的利用提供理论依据。

    • 基于天然榧树的分布情况以及前人的研究成果[13],于2019年10—11月榧树种实成熟期,从浙江省杭州市富阳区洞桥村(富阳)、杭州市临安区洪岭村(临安)、杭州市建德市大库村(建德)、绍兴市嵊州市榆树村(嵊州)及安徽省黄山市呈坎村(黄山)5个海拔在250~600 m的雌性榧树种群中,分别采集叶片和种实用于表型及种实营养成分的探究。基于詹利云等[14]的研究,选择富阳、临安、嵊州、黄山以及杭州市淳安县半夏村(淳安)的雌性榧树种群,分别采集叶片对榧树种群遗传多样性进行研究。样株间距大于50 m,生长状况良好。每株采集相同位置的新鲜叶片,采集至少100颗自然脱落的成熟种实,样品装入带有硅胶的塑封袋中,并利用全球卫星定位系统(GPS)定位采样点。叶片测量表型后置于−40 ℃冰箱保存,种实测完表型后置于阴凉通风处,等待假种皮自然开裂,用于后续研究。

    • 从各单株选取2个小枝相同部位的叶片共20片,用卡尺测量叶长、叶宽,并计算叶形指数(叶宽/叶长),用天平称取单片叶的质量。从各单株随机选取30颗种实,用卡尺测量单颗种实和种核的横径、纵径、假种皮厚、种壳厚,并计算种形指数(种实横径/种实纵径)、核形指数(种核横径/种核纵径),用天平称取单颗种实质量和种核质量。

    • 脂肪相对含量参照GB/T 14772—2008《食品中粗脂肪的测定》索氏抽提法测定。脂肪酸组成参照GB/T 17376—2008《食品脂肪酸含量的测定》测定。可溶性糖质量分数参照蒽酮比色法[15]测定。

    • 采用改良的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法[16]提取雌性榧树叶片的DNA。参照郑刘辉等[17]的SSR反应体系,合成引物序列,进行PCR扩增。

    • 采用SPSS 23.0进行数据统计、方差分析、多重比较、主成分分析;用Genemaker软件准确读取SSR位点信息。用Popgene 1.32计算平均等位基因数、观察杂合度、多态信息含量等遗传多样性指标。使用Structure 2.3.4分析种群的遗传结构,并绘制遗传结构图,用Q值表示一种遗传组成的比率,即同一颜色所占比率最大的种群聚类为同一亚群。通过NTSYS2.10e计算Nei’s遗传相似矩阵,使用非加权组平均聚类分析法(UPGMA)分析样品的亲缘关系,并进行聚类分析。

    • 表1可见:在叶质量和叶形指数上,临安种群的变异系数最大。在种实质量上,嵊州种群的变异系数最大。种形指数和种核质量富阳种群的变异系数最大。核形指数的变异系数在富阳种群中最大,但仅为10.2%。种壳厚和假种皮厚的变异系数在嵊州种群中最大。方差分析(表2)表明:叶质量、叶形指数、种实质量、种形指数、种核质量、核形指数、假种皮厚、种壳厚8个指标在种群间和种群内个体间差异极显著(P<0.01)。

      表 1  雌性榧树种群叶片与种实表型

      Table 1.  Leaf and seed phenotypes of female quince populations in T. grandis

      种群叶质量叶形指数种实质量种形指数假种皮厚种核质量核形指数种壳厚
      数值/gCV/%数值CV/%数值/gCV/%数值CV/%数值/mmCV/%数值/gCV/%数值CV/%数值/mmCV/%
      富阳0.02±0.0131.10.15±0.0210.810.70±2.4222.60.78±0.079.03.53±0.3610.24.77±1.2726.50.66±0.0710.20.54±0.1119.7
      嵊州0.02±0.0129.90.16±0.0211.211.85±3.3628.30.79±0.056.53.67±0.7821.34.92±1.1823.90.68±0.068.90.72±0.2534.6
      黄山0.02±0.0119.20.16±0.0211.69.50±2.2722.90.81±0.075.52.94±0.5317.84.51±0.9319.00.71±0.075.80.91±0.1721.1
      临安0.02±0.0133.90.16±0.0215.39.50±2.2723.90.81±0.078.22.94±0.5318.14.51±0.9320.60.71±0.079.50.91±0.1719.1
      建德0.02±0.0133.80.17±0.029.511.19±2.4121.50.83±0.056.13.63±0.4612.84.58±0.9721.10.70±0.057.80.85±0.1314.7
        说明:数值为均值±标准差;CV为变异系数。

      表 2  榧树叶片与种实表型的方差分析

      Table 2.  Variance analysis of phenotypic parameters of the leaf and seeds in T. grandis

      指标变异来源平方和自由度均方F指标变异来源平方和自由度均方F
      叶质量 种群间0.22040.005121.000种核质量种群间358.014489.503112.981
      个体间0.028290.00121.158个体间355.3262912.25315.467
      叶形指数种群间0.18140.04550.937核形指数种群间0.60040.15064.909
      个体间0.252290.0099.779个体间1.256290.04318.755
      种实质量种群间2 530.9504632.737191.245假种皮厚种群间796.6464199.16291.175
      个体间1 612.4712955.60216.806个体间484.0262916.6917.641
      种形指数种群间0.40840.10246.454种壳厚 种群间16.01844.005116.324
      个体间1.194290.04118.764个体间10.813290.37310.831
        说明:所有指标P=0.000。
    • 表3可见:5个种群的脂肪相对含量从大到小依次为嵊州、黄山、临安、建德、富阳,变异系数为7.7%~21.6%。多重分析发现各种群间脂肪相对含量差异显著(P<0.05)。

      表 3  5个榧树种群种仁的脂肪相对含量

      Table 3.  Lipid content of the kernel among 5 T. grandis populations

      种群脂肪相对含量/%CV/%
      最大值最小值平均值±标准差
      富阳47.7918.2529.36±6.34 d21.6
      嵊州48.1430.6242.35±3.77 a8.9
      黄山46.8133.6140.93±3.19 ab7.8
      临安44.9032.1939.82±3.07 b7.7
      建德40.5216.1933.96±4.66 c13.7
        说明:不同字母表示不同种群间差异显著(P<0.05)。CV为变异系数。

      榧树种子脂肪酸组成(表4)分析发现:不饱和脂肪酸的相对含量远远高于饱和脂肪酸,且前者是后者的2倍多;脂肪酸中亚油酸的相对含量最高,其次是油酸、金松酸、棕榈酸,亚麻酸相对含量最低。可见,榧树种子中主要的不饱和脂肪酸是亚油酸和油酸。5个种群间的脂肪酸组成存在不同程度的变异,其中多不饱和脂肪酸相对含量最高的是临安种群,随后依次是嵊州、建德、黄山、富阳种群;单不饱和脂肪酸相对平均含量富阳种群最高,为(29.20±6.34)%,建德种群最低,为(24.14±2.59)%;变异系数不饱和脂肪酸远小于饱和脂肪酸。从脂肪酸种类上看,变异系数最大的为花生一烯酸(13.0%~40.0%),其次是硬脂酸(18.0%~38.0%)、花生二烯酸(15.0%~27.0%)。

      表 4  5个榧树种群脂肪酸组成的变异

      Table 4.  Variation in fatty acid composition among 5 T. grandis populations

      种群棕榈酸/%硬脂酸/%油酸/%亚油酸/%亚麻酸/%花生一烯酸/%
      相对含量CV相对含量CV相对含量CV相对含量CV相对含量CV相对含量CV
      富阳 10.70±2.59 24.0 2.97±1.14 38.0 28.29±6.06 21.0 41.82±8.01 19.0 0.52±0.17 32.0 0.91±0.37 40.0
      嵊州 8.52±1.22 14.0 2.18±0.47 21.0 23.78±4.26 18.0 47.85±2.88 6.0 0.50±0.06 12.0 0.67±0.09 14.0
      黄山 8.06±0.98 12.0 2.97±0.54 18.0 26.21±2.87 11.0 46.81±2.35 5.0 0.47±0.05 11.0 0.65±0.08 13.0
      临安 8.47±0.88 10.0 2.15±0.46 22.0 23.63±2.40 11.0 49.00±2.45 5.0 0.57±0.00 14.0 0.59±0.09 16.0
      建德 9.58±1.83 19.0 2.80±0.92 33.0 23.47±2.63 11.0 46.49±3.67 8.0 0.48±0.07 14.0 0.67±0.10 15.0
      种群 花生二烯酸/% 金松酸/% 饱和脂肪酸/% 不饱和脂肪酸/% 单不饱和脂肪酸/% 多不饱和脂肪酸/%
      相对含量 CV 相对含量 CV 相对含量 CV 相对含量 CV 相对含量 CV 相对含量 CV
      富阳 2.42±0.63 26.0 10.76±2.14 20.0 13.68±3.45 25.0 84.71±4.39 5.0 29.20±6.34 22.0 55.52±10.16 18.0
      嵊州 2.80±0.75 27.0 12.61±2.02 16.0 10.70±1.32 12.0 88.22±2.04 2.0 24.45±4.30 18.0 63.77±4.36 7.0
      黄山 2.64±0.41 15.0 11.11±1.25 11.0 11.03±0.88 8.0 87.89±0.97 1.0 26.86±2.89 11.0 61.03±2.97 5.0
      临安 2.60±0.53 20.0 12.00±0.98 8.0 10.63±1.06 10.0 88.39±1.14 1.0 24.22±2.52 10.0 64.18±2.92 5.0
      建德 2.49±0.40 16.0 11.98±1.56 13.0 12.38±2.16 17.0 85.58±2.95 3.0 24.14±2.59 11.0 61.44±4.63 8.0
        说明:数值为平均值±标准差。CV为变异系数。
    • 表5可见:平均可溶性糖质量分数建德种群最高,为(50.49±9.26) mg·g−1,随后依次是黄山、嵊州、临安种群,富阳种群最低,为(40.23±4.80) mg·g−1。不同种群的变异系数为8.8%~19.3%。多重比较发现:嵊州、黄山种群间无显著差异,但与其他种群间差异显著(P<0.05)。

      表 5  5个榧树种群种仁的可溶性糖质量分数

      Table 5.  Soluble sugar content of the kernel among 5 T. grandis populations   

      种群可溶性糖质量分数/(mg·g−1)
      最大值最小值平均值±标准差CV/%
      富阳47.9132.1040.23±4.80 c11.9
      嵊州65.5629.3545.35±8.77 b19.3
      黄山60.0231.8044.38±7.56 b17.0
      临安54.3437.2447.75±4.18 ab8.8
      建德68.6834.3650.49±9.26 a18.3
        说明:不同字母表示不同种群间差异显示(P<0.05)。CV为变异系数。
    • 20个指标通过主成分分析提取出6个指标,发现特征值均大于1.000的前6个主成分累计贡献率为75.38%,可以全面反映各个指标的信息(表6)。第1主成分贡献率为30.76%,特征值较高的为亚油酸、饱和脂肪酸、不饱和脂肪酸;第2主成分贡献率为13.09%,特征值较高的为种实质量、种核质量;第3主成分贡献率为10.92%,其大小主要由核形指数、种形指数决定;第4主成分贡献率为7.98%,特征值较高的为叶形指数、叶片质量、种皮厚度;第5主成分贡献率为6.93%,特征值较高的为叶片质量、种形指数、叶形指数;第6主成分贡献率为5.70%,其大小主要由含油率、金松酸、叶形指数决定。

      表 6  5个榧树种群叶片和种实表型、品质的主成分分析

      Table 6.  Principal components of leaf and plant phenotypes among 5 T. grandis populations

      指标主成分指标主成分
      123456123456
      种实质量0.0740.856−0.0820.387−0.0070.263硬脂酸0.724−0.236−0.2170.2480.062−0.061
      种核质量0.1160.8190.0910.132−0.1870.305油酸0.731−0.431−0.2510.1570.1320.269
      种形指数0.010−0.1310.7410.3700.466−0.085亚油酸−0.9460.1420.046−0.106−0.0110.009
      核形指数−0.099−0.0970.8340.1940.3700.003亚麻酸0.239−0.0470.295−0.204−0.3140.120
      种皮厚度0.1050.498−0.3210.5290.2590.054花生一烯酸0.804−0.0460.027−0.0470.076−0.017
      种壳厚度−0.367−0.2430.3400.082−0.3330.327花生二烯酸−0.3720.114−0.1780.1520.369−0.310
      叶片质量0.2020.2890.049−0.5330.4960.190金松酸−0.6490.4240.186−0.152−0.176−0.397
      叶形指数−0.116−0.1790.0560.614−0.416−0.391饱和脂肪酸0.9430.0930.1600.000−0.124−0.106
      含油率−0.459−0.485−0.1950.3190.0180.426不饱和脂肪酸−0.927−0.113−0.194−0.0250.1310.114
      可溶性糖−0.1990.0100.4970.044−0.2070.330特征值6.1532.6182.1841.5951.3871.138
      棕榈酸0.8430.2210.296−0.111−0.181−0.105累计贡献率/%30.7643.8554.7762.7569.6875.38
    • 13对引物在146个雌性榧树中共获得37个等位基因,每对引物可扩增2~5个等位基因,平均每对引物扩增出2.85个等位基因,TG55平均等位基因数最多,ZAFU-3和TG19最少;每对引物的平均有效等位基因数为1.899个;平均观测杂合度(0.429)略高于平均期望杂合度(0.404);Nei’s遗传多样性指数平均为0.400,其中GR98 (0.688)最高,TG19 (0.015)最低;Shannon’s指数为0.039~1.252,有11对引物的Shannon’s信息指数高于0.500,其中GR98 (1.252)最高,TG19 (0.039)最低,平均为0.650,说明榧树遗传多样性丰富(表7)。

      表 7  榧树13个SSR位点的遗传参数

      Table 7.  Genetic parameters of 13 SSR loci in T. grandis

      引物
      编号
      平均等位
      基因数/个
      有效等位
      基因数/个
      观测
      杂合度
      期望
      杂合度
      Nei’s遗传
      多样性指数
      Shannon’s
      指数
      引物
      编号
      平均等位
      基因数/个
      有效等位
      基因数/个
      观测
      杂合度
      期望
      杂合度
      Nei’s遗传
      多样性指数
      Shannon’s
      指数
      ZAFU-1 3.7501.6040.2250.3660.3620.661GR984.3753.2300.6970.6950.6881.252
      ZAFU-3 1.6251.1200.0300.0910.0900.164TG191.6251.0160.0000.0150.0150.039
      ZAFU-5 2.5002.0040.5500.5060.5010.709TG555.3752.7060.5840.6220.6161.112
      ZAFU-6 2.0001.4950.2890.3290.3250.504TG702.5001.9860.9120.5020.4960.698
      ZAFU-8 2.0002.0000.9970.5050.5000.693TG812.0001.0140.0000.0140.0140.041
      ZAFU-112.6251.9610.4620.4910.4860.713TG883.7502.4530.4920.5930.5871.022
      GR12  3.0002.0950.3410.5250.5190.839平均2.8561.8990.4290.4040.4000.650
    • 在种群水平上,Nei’s遗传多样性指数(H)与Shannon’s指数(I)在5个雌性种群间的变化趋势相似。Nei’s遗传多样性指数平均为0.390,从大到小依次为淳安、临安、黄山、富阳、嵊州;Shannon’s指数平均为0.621,从大到小依次为淳安、临安、富阳、黄山、嵊州;多态位点百分比平均为81.54%,其中富阳、黄山、嵊州3个种群的多态位点百分比相等,临安和淳安种群相等。淳安(H=0.410,I=0.658)的遗传多样性最高,嵊州(H=0.369,I=0.565)的遗传多样性最低(表8)。

      表 8  5个榧树亲本种群的遗传多样性

      Table 8.  Genetic diversity among 5 T. grandis populations

      种群  平均等位基因数/个有效等位基因数/个观测杂合度期望杂合度Nei’s遗传多样性指数Shannon’s指数多态位点百分比/%
      富阳  2.6921.8480.4310.3870.3810.62584.62
      嵊州  2.1541.7910.3770.3760.3690.56584.62
      黄山  2.2311.8110.4510.3990.3920.61184.62
      临安  2.4621.9170.4640.4060.3990.64876.92
      淳安  2.4621.9540.4230.4180.4100.65876.92
      种群水平2.4001.8640.4290.3970.3900.62181.54
      物种水平3.2311.9250.4290.4060.4050.67192.31
        说明:种群水平指5个种群平均值;物种水平指5个种群中所有物种平均值。

      在物种水平上,5个种群榧树的平均等位基因数为3.231个,平均有效等位基因数为1.925个,期望杂合度(0.406)略小于观测杂合度(0.429),Nei’s遗传多样性指数为0.405,Shannon’s指数为0.671,多态位点百分比为92.31%(表8)。各种群在种群水平上的多态位点百分比及Shannon’s指数均低于物种水平,仅淳安种群在种群水平上的Nei’s遗传多样性指数高于物种水平。

    • 5个雌性榧树种群间的总遗传多样性平均为0.497;群体内近交系数均为负值,说明群体内杂合子过剩,纯合子缺失[18],这与榧树雌雄异株的特性相吻合,且这些供试雌株都是杂交后代;种群间近交系数变幅为0.054~0.207,平均为0.129;遗传分化指数变幅为0.153~0.218,平均为0.199,表明5个雌性榧树种群间存在的遗传分化程度不大,这与榧树风媒、花粉流动性大的特性相吻合;基因流的变幅为0.898~1.381,平均为1.029,表明种群间存在基因交流,每代交流约1个基因,基因流动相对来说不是很频繁(表9)。

      表 9  5个榧树种群的遗传分化

      Table 9.  Genetic differentiation among 5 T. grandis populations

      种群总遗传
      多样性
      种群内
      近交系数
      种群间
      近交系数
      遗传分
      化指数
      基因流
      富阳 0.457−0.1130.0580.1531.381
      嵊州 0.475−0.0030.2060.2090.946
      黄山 0.491−0.1320.0540.1881.082
      临安 0.527−0.1430.1200.2300.838
      淳安 0.534−0.0130.2070.2180.898
      平均值0.497−0.0810.1290.1991.029

      方差分析结果(表10)表明:榧树的遗传变异集中在种群内,种群内(92%)的遗传变异远大于种群间(8%)。

      表 10  5个榧树种群的分子方差分析

      Table 10.  Molecular variance among 5 T. grandis populations   

      来源自由度平方和均方方差分量变异百
      分比/%
      P
      种群间467.42716.8570.41680.081
      种群内141664.2514.7114.71192
      总数 145731.6785.127100

      对亚群归属分析发现:每个种群的样本基本上都有3个亚群的痕迹,只是比例不同而已(图1)。这说明榧树天然异交导致高度杂合的特性。

      图  1  基于Structure分析的5个榧树种群的遗传结构图

      Figure 1.  Genetic structure of 5 T. grandis populations based on structure analysis

    • 5个榧树种群的遗传相似系数平均为0.969,说明各种群间的遗传相似度很高,亲缘关系较近,存在一定程度的遗传变异(表11)。遗传距离平均为0.032,黄山与淳安种群的遗传距离最大(0.055),遗传相似度最小(0.946),富阳与黄山、临安种群的遗传距离最小(0.022),遗传相似度最大(0.977)。表明雌性榧树群体遗传相似度高,但因雌雄异株天然杂交的特性,使物种内又存在一定的变异。

      表 11  5个榧树种群的遗传距离和遗传相似度

      Table 11.  Genetic distance and genetic identity among 5 T. grandis populations

      种群富阳嵊州黄山临安淳安
      富阳0.9760.9770.9770.962
      嵊州0.0240.9700.9710.957
      黄山0.0230.0310.9730.946
      临安0.0230.0300.0270.977
      淳安0.0380.0450.0550.024
        说明:对角线下方为遗传距离,对角线上方为遗传相似度。

      UPGMA聚类分析发现:富阳与黄山种群相聚之后再与嵊州种群聚在一起,随后上述3个种群与临安种群聚在一起,富阳、黄山、嵊州、临安4个种群与淳安种群之间存在差异 (图2)。

      图  2  5个榧树种群的UPGMA聚类图

      Figure 2.  UPGMA dendrograme of 5 T. grandis populations

    • 本研究表明:5个雌性榧树种群叶与种实指标在种群间及个体间均存在显著差异,这与其本身雌雄异株风媒花天然杂交的特性相符。詹利云等[14]对富阳、嵊州、黄山、临安种群雄性榧树的叶片、种实表型指标进行了研究,而本研究则对上述相同种群雌株的叶片、种实表型指标进行探究。比较发现:在种群间,雄株仅叶长这一指标存在显著差异,雌株则各指标均有差异,但种群内雌雄榧树间各指标都有显著差异;黄山种群雌株叶质量的均值要小于雄株,且变异系数雌株种群比雄株种群大;叶形指数雌雄榧树均值接近,变异系数仅嵊州(13.97%)和临安(18.27%)种群的雄株比雌株(分别为11.20%、15.30%)大。

      与沈登锋等[19]的研究结果相比,本研究的种实和种核质量与其接近,但变异系数较低,而种实相对脂肪含量两者相近。究其原因,沈登锋等[19]的研究是从种子可食性的角度收集种质,而本研究在各种群的取样则是随机的,数据更能反映自然条件下榧树种群的状况。董雷鸣等[20]对榧树黄山种群的种实进行了分析,发现与本研究在种实质量、种核质量、种形指数、核形指数上接近,而脂肪相对含量本研究的结果要高近7%。尽管研究材料取自同一种群,但榧树雌雄异株天然风媒杂交的特性决定了雄株花粉在其中所起的作用,加之研究的年份不同,气候气象条件也不同,因此研究结果有出入。本研究表明:榧树种实与种核的表型指标中,变异系数大于10%的包括种实质量、假种皮厚、种核质量及种壳厚,这些指标与种实产量有关,而各种群间相差10%以上的指标包括假种皮厚、种壳厚。

      本研究的榧树种实可食性较差,其脂肪相对含量不及香榧。金松酸作为一种特殊的不饱和脂肪酸,目前已知来源较少,得率低[21]。本研究各种群金松酸的平均相对含量为10.76%~12.61%,接近或高于香榧及日本榧Torreya nucifera的平均值,且有的单株相对含量更高,进一步说明榧树种子的利用价值。本研究发现:榧树种实脂肪相对含量的变异系数为7.70%~21.80%,而不饱和脂肪酸的变异系数较小,低于5%,脂肪中各脂肪酸组分种群间差异显著,金松酸的变异系数为8.00%~20.00%,因此不仅具有优株选择的潜力,且基于脂肪、金松酸相对含量的高低来进行优株选择理论上是可行的。

      本研究表明:天然雌性榧树的遗传变异集中在种群内,种群内(92%)的遗传变异远大于种群间(8%),这与异交风媒植物90%以上的遗传变异存在于种群内的结果相符[22],且说明榧树单株间的遗传变异更丰富,选育要基于单株性状表现来进行。以遗传多样性指标来看,仅淳安种群(H=0.410,I=0.658)的遗传多样性大于雌性榧树物种水平(H=0.405,I=0.671),而雌性物种水平的多态位点百分比(92.31%)均大于5个天然雌性榧树种群。这与刘浩凯[12]用相关系列扩增多态性(SRAP)分析天然雌性榧树种群的结果相似。

      天然榧树种群内近交系数均为负值,杂合子过剩而纯合子缺失,这也与该物种风媒传粉天然杂交的特性相吻合,说明天然雌性榧树种群没有近交衰退的现象[10]。WRIGHT[23]研究表明:遗传分化指数(Fst)可反映群体间遗传分化程度,当0<Fst≤0.05、0.05<Fst≤0.15、0.15<Fst≤0.25、Fst>0.25时,遗传分化程度分别为很弱、中等、较大分化、极大。基因流越大,遗传分化越小[24]。当基因流大于1时,说明种群间存在一定的基因交流,种群间的遗传分化不会太大[25]。在本研究中,5个雌性榧树种群的遗传分化指数为0.199,但基因流为1.029,说明种群间的遗传分化较大。

      从榧树染色体水平参考基因组,可获得更加详细和精确的基因组信息[26]。这些信息不仅包括基因的序列,还包括基因的结构、功能和调控网络等。通过深入分析这些信息,可以更准确地识别和定位SSR标记,从而提高其全面性和多态性。

    • 不同雌性榧树种群叶与种实表型指标在种群间及个体间存在显著差异。脂肪相对含量、脂肪酸相对含量及可溶性糖质量分数在种群间差异极显著,榧树种实表型和种仁品质变异丰富。基于遗传多样性指标,发现雌性榧树种群表现出一定程度的变异,淳安种群的遗传多样性最大,且雌性榧树的遗传变异种群内远大于种群间。

参考文献 (26)

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