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榧树Torreya grandis多雌雄异株,因天然杂交而群体内遗传多样性丰富[1]。此外,榧树分布范围广,地理环境复杂,极大地增加了榧树种内的性状变异[1-3]。丰富的自然变异为榧树优良种质的选育提供了物质基础。迄今为止,唯一进行人工大面积栽培的香榧T. grandis ‘Merrillii’是榧树优良变异类型经无性繁殖培育而成的优良栽培类型[4-5]。除香榧外,近年来在榧树中发现了许多优良自然变异类型,包括以种子生产为目的种质[6]及种子营养成分含量高[7]或生长性状优良的种质[8],一些优株的综合性状品质甚至超过香榧[6-7]。嫁接是经济树种无性繁殖的方式之一,可以保持嫁接品种的优良性状。生产上榧树优良种质的扩繁以嫁接繁殖为主,而嫁接用的砧木均以榧树种子实生繁殖而成。目前生产上提倡香榧大苗造林,培养的嫁接苗至少为2+2(砧木培养2 a后嫁接,嫁接苗至少再培养2 a才能造林)。研究表明:砧木显著影响接穗生长势[9]、嫁接植株的抗旱性[10]、果实化学成分的积累[11]。香榧嫁接时发现,直径越粗的砧苗往往根系更强壮,有利于嫁接苗的快速生长,并促进开花结实,这对童期长且生命周期达上千年的香榧及其他优良种质而言尤其重要。此外,砧苗的分枝数越少,表皮越光滑,嫁接时越方便,越有利于接口的愈合。榧树优良砧木育种资源的选育目前尚未见相关报道。对林木而言,子代测定中包括各方差分量及由其计算的遗传力、遗传相关系数和遗传增益,以及加性效应值等遗传参数的估计来自线性混合模型(linear mixed model, LMM),且林木中的目标改良性状多为数量性状,即连续性状,服从高斯分布,采用普通的线性混合模型即可估算遗传参数。对于诸如存活、干形、颜色、分枝数等非连续性状,早期研究多数采用原始数据或通过转换使数据呈正态和方差齐次后,再采用普通的线性混合模型建模。然而,广义线性混合模型(generalized linear mixed model, GLMM)可以直接对这类表型数据进行分析,无需进行额外处理。尽管常规转换数据的线性混合模型和广义线性混合模型的结果差异不大,但利用广义线性混合模型更合理,且无需担心常规方法数据转换失败等问题[12],此类方法已在动物及林木育种中得到发展,并逐渐普及[13-15]。本研究对天然榧树群体半同胞子代1年生和2年生幼苗生长性状(苗高、地径)和分枝数,分别采用常规线性混合模型和广义线性混合模型拟合并估算相关的遗传参数,以期为天然优良嫁接砧木用榧树种质的选育及利用提供依据。
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榧树在自然分布区内资源分布不均,以浙江省最多,安徽黄山市也有较多分布[6]。黄山市徽州区呈坎镇小容村(29°57′N,118°14′E)分布有大量百年以上的野生榧树。2010年10月待榧树种子开始开裂并脱落时,在小容村随机选择50株彼此至少相距50 m以上,生长健壮、正常结实的雌株,每株分别采集不少于50颗种子。种子带回浙江农林大学国家林业与草原局林木良种基地(30°26′N,119°73′E)后,采用双层薄膜结合湿沙储藏催芽法进行种子处理。种子萌发出土后除去稻草及薄膜,按时进行浇水、除草及病害防治等日常管理。2012年3月将培养1 a的幼苗单株移栽至培养钵内。培养钵规格为18 cm×16 cm(直径×高度);培养基质由黄土、泥炭、蛭石和珍珠岩按6∶1∶1∶1(V∶V)混合而成。培养钵按编号摆放于开阔的水平地面上。
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移栽结束后,在每个半同胞家系内选择20株生长良好的幼苗进行编号挂牌,然后用电子数显卡尺和卷尺测定苗高(H1,999株)、地径(D1,999株)。由于1年生幼苗多无分枝,所以到具有一定分枝能力的2年生苗时才观察记录分枝数。2013年1月,对挂牌幼苗进行第2次生长性状测定,指标包括苗高(H2,946株)、地径(D2,946株)、分枝数(B2,944株)。
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连续性状采用以下常规线性混合模型:
$$y = {{X}}\beta + {{Z}}u + e{\text{。}}$$ (1) 式(1)中:y为表型观测值向量;β为固定效应向量(均值);u为随机家系效应向量,服从
$u \! \sim \! N $ $\left( {0,{{I}}\hat \sigma _u^2} \right)$ ,N表示正态分布,I表示单位矩阵,${\rm{\hat \sigma }}_{u}^2$ 表示家系效应方差;X和Z分别表示固定和随机效应的关联矩阵;e表示随机残差向量,服从$e \! \sim \! N\left( {0,{{I}}\hat \sigma _e^2} \right)$ ,${\rm{\hat \sigma }}_{e}^2$ 表示残差方差。非连续性状采用以下广义线性混合模型:
$$y = \eta + e = {{X}}\beta + {{Z}}u + e{\text{;}}$$ (2) $$\eta = {{I}}\left( \mu \right) = {{X}}\beta + {{Z}}u{\text{。}}$$ (3) 式(2)~(3)中:η为线性预测值;I(μ)为链接函数;其余项与公式(1)相同。
统计分析主要由R语言计算平台的ASReml-R包3.0版完成。模型参数由限制性最大似然估计法(REML)估计,随机效应的效应值由最佳无偏线性预测法(BLUP)预测。各方差组分的统计显著性检验由似然比检验(LRT)完成。利用泰勒级数展开法计算遗传参数标准误。
因为家系数少(50个),每家系取样量也少(20个),采用常规遗传力计算方法得到的遗传力估计值大于1,超出其取值范围(0~1),因此采用CULLIS等[16]提出的方法计算遗传力,公式为:
$${H_{\rm{c}}}{\rm{ = 1}} - {V}/{{{\rm{2}}\hat \sigma _{g}^2}}{\text{。}}$$ (4) 式(4)中:Hc为遗传力;V为成对基因型最佳无偏线性预测差值的方差,
$\hat \sigma _{\rm{g}}^2 = 4 \hat \sigma _u^2$ 。遗传力的标准误采用自主抽样法估计。采用下式计算拟合双性状模型连续性状x和y间的遗传相关(
${\hat r_{\rm{g}}}$ )和表型相关(${\hat r_{\rm{p}}}$ ):$${\hat r_{\rm{g}}} = {{{{\hat \sigma }_{{\rm{g}}(xy)}}}}\Big/{{\sqrt {\hat \sigma _{{\rm{g}}(x)}^2 \hat \sigma _{{\rm{g}}(y)}^2} }}{\text{;}}$$ (5) $${\hat r_{\rm{p}}} = {{{{\hat \sigma }_{{\rm{p}}(xy)}}}}\Big/{{\sqrt {\hat \sigma _{{\rm{p}}(x)}^2 \hat \sigma _{{\rm{p}}(y)}^2} }}{\text{。}}$$ (6) 式(5)~(6)中:
${\hat \sigma _{{\rm{g}}(xy)}}$ 和${{\rm{\hat \sigma }}_{{\rm{p}}(xy)}}$ 分别表示性状x和y间的加性遗传和表型协方差估计值;${\rm{\hat \sigma }}_{{\rm{g}}(x)}^2$ 和${\rm{\hat \sigma }}_{{\rm{g}}(y)}^2$ 分别表示性状x和y的加性遗传估计值;${\rm{\hat \sigma }}_{{\rm{p}}(x)}^{2{\rm{}}}$ 和${\rm{\hat \sigma }}_{{\rm{p}}(y)}^{2{\rm{}}}$ 分别表示性状x和y的表型方差估计值。由于ASReml-R包3.0版不能拟合含有非连续性状的双变量模型,因而分枝数与生长性状的遗传相关用性状最佳无偏线性预测育种值间的Pearson相关系数替代,表型相关由表型值间的Pearson相关系数替代。设定入选率为10%,采用WHITE等[17]提出的公式计算各性状的遗传增益ΔG:
$$\varDelta G = \left( {{{\bar A}_{\rm{s}}} - {{\bar A}_{\rm{p}}}} \right) \times 100{\rm{\% }}{\text{。}}$$ (7) 式(7)中:
${\bar A_{\rm{s}}}$ 和${\bar A_{\rm{p}}}$ 分别为入选群体和试验群体的平均育种值。 -
从表1可见:1年生榧树幼苗苗高均值为(19.428±4.465) cm,地径均值为(3.608±0.635) mm;2年生幼苗的平均苗高和地径分别为(29.105±6.267) cm和(4.383±0.630) mm;分枝数为1~17条。苗高和地径在年龄尺度上呈不同程度的变异,总体上苗高的变异系数大于地径,且随年龄的增加而降低;在2 a的观测中,苗高的变异系数均大于20%,地径的变异系数略小(表2)。
表 1 榧树生长与分枝性状的描述性统计
Table 1. Descriptive statistics for growth and branching traits in T. grandis
项目 H1/cm H2/cm D1/mm D2/mm B2/条 均值±标准差 19.428±4.465 29.105±6.267 3.608±0.635 4.383±0.630 7.451±2.902 最小值 9.00 13.00 1.56 2.64 1 最大值 35.00 50.00 5.63 6.98 17 -
表2表明:5个表型性状家系间在统计学上存在极显著差异(P<0.01),说明各性状在家系间存在丰富的变异,具有在家系水平开展选择的潜力。1年生苗高的遗传变异系数最大,第2年分枝数的遗传变异系数最小;遗传变异系数苗高大于地径。苗高和地径表型变异系数与遗传变异系数有相同的变化趋势,且遗传及表型变异系数随年龄的增加而降低,但分枝数的遗传变异系数很小,苗高和地径变异系数则较大。5个表型性状均有较大的遗传力估计值(Hc>0.7),且标准误不大(0.012~0.029)。在相同年龄水平上,苗高的遗传力最高,变幅为0.857~0.943;地径略低,变幅为0.808~0.866;分枝数的遗传力最低,为0.734。在遗传增益上幼苗苗高大于地径及分枝数,1年生枝条的遗传增益最高,达32.60%;苗高和地径的遗传增益第1年高于第2年。
表 2 榧树生长与分枝性状的遗传参数
Table 2. Genetic parameters for growth and branching traits in T. grandis
性状 家系方差 残差方差 遗传力 遗传变异系数/% 表型变异系数/% 遗传增益/% H1 9.963(2.134)** 11.932(0.548) 0.943(0.015) 22.98 24.08 32.60 H2 9.506(2.238)** 29.784(1.407) 0.857(0.014) 14.98 21.54 18.49 D1 0.099(0.023)** 0.306(0.014) 0.866(0.012) 12.33 17.64 11.65 D2 0.073(0.018)** 0.326(0.015) 0.808(0.018) 8.72 14.42 8.04 B2 0.020(0.005)** 1.000(NA) 0.734(0.029) 1.89 13.55 11.00 说明:括号内数值为标准误;**表示在P<0.01水平上差异显著;NA表示不可用 -
由表3可见:同一批榧树幼苗,无论生长年限多长,表型上苗高、地径及分枝数两两间都具有极显著的相关性(P<0.01),且以不同年份地径间及苗高间的相关性较高,说明第1年的生长对第2年的生长有影响;此外,第1年的苗高与第2年的地径,第2年的苗高与第2年的地径及分枝数的相关性处于中等水平,说明苗高的影响比较大。遗传相关表明:不同年份苗高间及地径间相关性高,且相关极显著(P<0.01);而分枝数与第1年的苗高及地径相关不显著,但与当年的苗高及地径相关显著(P<0.05)(表3),说明遗传相关与表型相关格局基本一致,选择第1年苗高及地径数值大的幼苗,第2年苗高及地径值也大。可见,当年的生长影响苗木的分枝。遗传增益的分析结果也是第1年大于第2年(表2)。
表 3 生长性状间遗传及表型相关
Table 3. Genetic and phenotypic correlations between growth traits
性状 H1 H2 D1 D2 B2 H1 1.00 0.61 (0.03) ** 0.53 (0.04) ** 0.51 (0.04) ** 0.20 (0.05) ** H2 0.84 (0.05) ** 1.00 0.34 (0.04) ** 0.46 (0.03) ** 0.59(0.03) ** D1 0.63 (0.10) ** 0.51 (0.13) ** 1.00 0.71 (0.02) ** 0.14 (0.04) ** D2 0.58 (0.11) ** 0.57 (0.12) ** 0.82 (0.06) ** 1.00 0.34(0.04) ** B2 0.21 (0.16) 0.55(0.13) ** 0.13 (0.18) 0.33(0.16) * 1.00 说明:上三角是表型相关,下三角是遗传相关;括号内数值为标准误;*表示显著相关(P<0.05),**表示极显著相关(P<0.01)
Estimation of genetic parameters for juvenile growth of half-sib seedlings of Torreya grandis
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摘要:
目的 研究生产上香榧Torreya grandis ‘Merrillii’嫁接繁殖砧木用榧树T. grandis幼苗生长性状的遗传,选育天然优良榧树种质。 方法 以天然林自由授粉的榧树半同胞子代为材料,连续2 a测定榧树幼苗苗高、地径及分枝数,采用常规线性混合模型(LMM)和广义线性混合模型(GLMM)拟合并估算相关的遗传参数,计算了遗传和表型相关系数。 结果 总体上榧树幼苗苗高的变异系数大于地径的变异系数,且随幼苗年龄的增加而降低。各生长性状指标在家系间均存在极显著差异(P<0.01),且遗传力都较高,1年生幼苗各指标的遗传力均大于2年生幼苗的遗传力,遗传相关大于表型相关。遗传增益方面则表现为幼苗苗高大于地径及分枝数,以1年生枝条的遗传增益最高。生长表型性状相关分析表明:同批榧树幼苗除分枝数外,各指标间的遗传及表型均有极显著的相关性。 结论 天然群体榧树在生长性状上具有较强的选育潜力,可以根据1年生幼苗的苗高来选择培育砧木的采种树。表3参24 Abstract:Objective To provide rationale for the selection and breeding of natural superior individuals of Torreya grandis, this research is intended to study the inheritance of the growth traits of T. grandis seedlings which are generally used as the rootstock for grafting scions from T. grandis ‘Merrillii’ in production. Method With half-sib seedlings of T. grandis openly pollinated in the natural forests as a material, the height, basal diameter and number of branches were measured for two consecutive years while the relevant genetic parameters were fitted and estimated employing conventional linear mixed model (LMM) and generalized linear mixed model (GLMM) so as to calculate the genetic and phenotypic correlation coefficients. Result The coefficient of variation of seedling height was greater than that of basal diameter and decreased with the seedling age. Every growth trait parameter displayed a very significant difference among families (P<0.01) and a relatively high heritability. The heritability of one-year-old seedlings for each parameter was higher than that of two-year-old seedlings and the genetic correlation was greater than that of phenotypic correlation. In terms of genetic gain, the seedling height was bigger than the basal diameter and the number of branches, and the genetic gain of the annual shoot was the highest. The correlation analysis of growth phenotypic traits showed that there was a significant correlation between genotype and phenotype of the same batch seedlings in all the parameters except the number of branches. Conclusion Natural T. grandis populations have displayed the great potential for selection and breeding in growth traits. Seed-bearing trees could be selected based on the height of one-year-old seedlings for the purpose of stock cultivation. [Ch, 3 tab. 24 ref.] -
表 1 榧树生长与分枝性状的描述性统计
Table 1. Descriptive statistics for growth and branching traits in T. grandis
项目 H1/cm H2/cm D1/mm D2/mm B2/条 均值±标准差 19.428±4.465 29.105±6.267 3.608±0.635 4.383±0.630 7.451±2.902 最小值 9.00 13.00 1.56 2.64 1 最大值 35.00 50.00 5.63 6.98 17 表 2 榧树生长与分枝性状的遗传参数
Table 2. Genetic parameters for growth and branching traits in T. grandis
性状 家系方差 残差方差 遗传力 遗传变异系数/% 表型变异系数/% 遗传增益/% H1 9.963(2.134)** 11.932(0.548) 0.943(0.015) 22.98 24.08 32.60 H2 9.506(2.238)** 29.784(1.407) 0.857(0.014) 14.98 21.54 18.49 D1 0.099(0.023)** 0.306(0.014) 0.866(0.012) 12.33 17.64 11.65 D2 0.073(0.018)** 0.326(0.015) 0.808(0.018) 8.72 14.42 8.04 B2 0.020(0.005)** 1.000(NA) 0.734(0.029) 1.89 13.55 11.00 说明:括号内数值为标准误;**表示在P<0.01水平上差异显著;NA表示不可用 表 3 生长性状间遗传及表型相关
Table 3. Genetic and phenotypic correlations between growth traits
性状 H1 H2 D1 D2 B2 H1 1.00 0.61 (0.03) ** 0.53 (0.04) ** 0.51 (0.04) ** 0.20 (0.05) ** H2 0.84 (0.05) ** 1.00 0.34 (0.04) ** 0.46 (0.03) ** 0.59(0.03) ** D1 0.63 (0.10) ** 0.51 (0.13) ** 1.00 0.71 (0.02) ** 0.14 (0.04) ** D2 0.58 (0.11) ** 0.57 (0.12) ** 0.82 (0.06) ** 1.00 0.34(0.04) ** B2 0.21 (0.16) 0.55(0.13) ** 0.13 (0.18) 0.33(0.16) * 1.00 说明:上三角是表型相关,下三角是遗传相关;括号内数值为标准误;*表示显著相关(P<0.05),**表示极显著相关(P<0.01) -
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链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/doi/10.11833/j.issn.2095-0756.20190542