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山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析

黄银芝 曾燕如 周秦 夏国华 黄有军

黄银芝, 曾燕如, 周秦, 夏国华, 黄有军. 山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析[J]. 浙江农林大学学报, 2015, 32(2): 229-236. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009
引用本文: 黄银芝, 曾燕如, 周秦, 夏国华, 黄有军. 山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析[J]. 浙江农林大学学报, 2015, 32(2): 229-236. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009
HUANG Yinzhi, ZENG Yanru, ZHOU Qin, XIA Guohua, HUANG Youjun. Analysis of ESTs associated with oil metabolism in seeds of Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2015, 32(2): 229-236. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009
Citation: HUANG Yinzhi, ZENG Yanru, ZHOU Qin, XIA Guohua, HUANG Youjun. Analysis of ESTs associated with oil metabolism in seeds of Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2015, 32(2): 229-236. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009

山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009
基金项目: 

浙江省自然科学基金重点项目(Z13C160012);浙江省科学技术创新团队项目(2011R50030);国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2013AA102605)

详细信息
    作者简介: 黄银芝,从事经济林培育与利用研究。
    通信作者: 曾燕如,教授,博士,从事经济林培育与利用研究。
  • 中图分类号: S722.3;Q753

Analysis of ESTs associated with oil metabolism in seeds of Carya cathayensis

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  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2014-06-12
  • 修回日期:  2014-08-24
  • 刊出日期:  2015-04-20

山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009
    基金项目:

    浙江省自然科学基金重点项目(Z13C160012);浙江省科学技术创新团队项目(2011R50030);国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2013AA102605)

    作者简介:

    黄银芝,从事经济林培育与利用研究。

    通信作者: 曾燕如,教授,博士,从事经济林培育与利用研究。
  • 中图分类号: S722.3;Q753

摘要: 山核桃Carya cathayensis为重要的油料干果树种,其非同一般的高含油率必定有其特殊的成油机制。为探索其成油机制,在已构建的山核桃脂肪代谢相关cDNA文库基础上,对cDNA进行随机克隆测序,对序列进行拼接、功能注释,基因本体论(gene ontology,GO)分类及基于拟南芥Arabidopsis thaliana的FunCat分类,并对与脂肪代谢相关的全长cDNA序列进行蛋白性质分析。结果共得到1 010条山核桃表达序列标签(ESTs),经拼接获得188个编码蛋白质的基因(unigene),其中92个contigs和96个singlets。GO分类将这些unigene分成细胞组分、分子功能和生物过程等3类,并发现各序列编码的基因并不承担单一的功能,有些序列在功能上有重叠;同时参照拟南芥的基因功能分类,将unigene序列在功能上分成9类,得到了143个全长cDNA序列,其中包括14个与脂肪代谢相关的cDNA序列。对12个与脂肪代谢相关的全长cDNA序列进行蛋白性质分析,发现它们均具有磷酸化位点;除油质蛋白外都没有跨膜区域,且不具信号肽结构,为非分泌蛋白,属于某个蛋白家族;不同的油体蛋白具有不同的跨膜区,且均具有信号肽结构,属于Oleosin super family蛋白家族。表4参35

English Abstract

黄银芝, 曾燕如, 周秦, 夏国华, 黄有军. 山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析[J]. 浙江农林大学学报, 2015, 32(2): 229-236. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009
引用本文: 黄银芝, 曾燕如, 周秦, 夏国华, 黄有军. 山核桃种子脂肪代谢期EST序列的初步分析[J]. 浙江农林大学学报, 2015, 32(2): 229-236. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009
HUANG Yinzhi, ZENG Yanru, ZHOU Qin, XIA Guohua, HUANG Youjun. Analysis of ESTs associated with oil metabolism in seeds of Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2015, 32(2): 229-236. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009
Citation: HUANG Yinzhi, ZENG Yanru, ZHOU Qin, XIA Guohua, HUANG Youjun. Analysis of ESTs associated with oil metabolism in seeds of Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2015, 32(2): 229-236. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.009

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