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山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较

李元春 沈林 曾燕如

李元春, 沈林, 曾燕如. 山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较[J]. 浙江农林大学学报, 2011, 28(3): 505-512. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025
引用本文: 李元春, 沈林, 曾燕如. 山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较[J]. 浙江农林大学学报, 2011, 28(3): 505-512. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025
LI Yuan-chun, SHEN Lin, ZENG Yan-ru. Establishment of a SRAP analysis protocol in Carya cathayensis and a comparison among SRAP,RAPD,ISSR analysis protocols[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2011, 28(3): 505-512. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025
Citation: LI Yuan-chun, SHEN Lin, ZENG Yan-ru. Establishment of a SRAP analysis protocol in Carya cathayensis and a comparison among SRAP,RAPD,ISSR analysis protocols[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2011, 28(3): 505-512. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025

山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025
详细信息
    通信作者: 曾燕如

Establishment of a SRAP analysis protocol in Carya cathayensis and a comparison among SRAP,RAPD,ISSR analysis protocols

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    Corresponding author: ZENG Yan-ru
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出版历程
  • 刊出日期:  2011-06-20

山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025
    通信作者: 曾燕如

摘要: 以山核桃Carya cathayensis基因组DNA为模板,对聚合酶链式反应(PCR)体系各组分进行了梯度实验,优化出条带清晰、重复性好的相关序列扩增多态性聚合酶链式反应(SRAP-PCR)扩增体系,并筛选了引物。该体系(25.00 L)为:1 缓冲液0.20 mmolL-1,脱氧核糖核苷酸(dNTPs),0.20 molL-1 引物,2.00 mmolL-1镁离子(Mg2+),33.34 nkat Taq DNA 聚合酶,0.80 mgL-1基因组DNA(以上均为终浓度)。反应条件为94 ℃预变性5 min;94 ℃变性30 s,35 ℃退火30 s,72 ℃延伸2 min,5个循环;94 ℃变性30 s,50 ℃退火30 s,72 ℃延伸2 min,30个循环;72 ℃延伸8 min,4 ℃保存,反应时间比其他体系缩短了一半。从100对引物中筛选出了适用于山核桃的引物15对。在山核桃中,随机扩增多态性DNA(RAPD),简单序列重复区间(ISSR),SRAP等3种标记,以SRAP标记每对引物扩增的位点数及每对引物扩增的多态性位点数为多,但SRAP多态性引物的比例、多态性位点比例居于另2种标记之间。在山核桃研究中可以考虑使用SRAP及RAPD标记。图6表4参28

English Abstract

李元春, 沈林, 曾燕如. 山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较[J]. 浙江农林大学学报, 2011, 28(3): 505-512. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025
引用本文: 李元春, 沈林, 曾燕如. 山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较[J]. 浙江农林大学学报, 2011, 28(3): 505-512. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025
LI Yuan-chun, SHEN Lin, ZENG Yan-ru. Establishment of a SRAP analysis protocol in Carya cathayensis and a comparison among SRAP,RAPD,ISSR analysis protocols[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2011, 28(3): 505-512. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025
Citation: LI Yuan-chun, SHEN Lin, ZENG Yan-ru. Establishment of a SRAP analysis protocol in Carya cathayensis and a comparison among SRAP,RAPD,ISSR analysis protocols[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2011, 28(3): 505-512. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.025

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