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山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析

杨希宏 黄有军 陈芳芳 黄坚钦

杨希宏, 黄有军, 陈芳芳, 黄坚钦. 山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(1): 1-8. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001
引用本文: 杨希宏, 黄有军, 陈芳芳, 黄坚钦. 山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(1): 1-8. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001
YANG Xihong, HUANG Youjun, CHEN Fangfang, HUANG Jianqin. Identification and expression of FLOWERING LOCUS C homologous genes in Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(1): 1-8. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001
Citation: YANG Xihong, HUANG Youjun, CHEN Fangfang, HUANG Jianqin. Identification and expression of FLOWERING LOCUS C homologous genes in Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(1): 1-8. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001

山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001
详细信息
    通信作者: 黄坚钦

Identification and expression of FLOWERING LOCUS C homologous genes in Carya cathayensis

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    Corresponding author: HUANG Jianqin
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出版历程
  • 收稿日期:  2012-03-01
  • 修回日期:  2012-04-18
  • 刊出日期:  2013-02-20

山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001
    通信作者: 黄坚钦

摘要: 根据本课题组对山核桃Carya cathayensis花芽454测序获得的CcFLC基因的2个开放阅读框(ORF)分别设计引物并进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,获得开放阅读框大小分别为639 bp和612 bp,编码212个和203个氨基酸,GenBank登录号分别为JQ829074和JQ829075,都具有典型的MADS-box结构域,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为78%和67%,5端高度同源,3端差异较大。与太行花Taihangia rupestris和梨Pyrus pyrifolia等物种的FLC-like基因的氨基酸序列同源性达到40%~57%。氨基酸疏水性分析显示,它们的羧基端都是疏水性氨基酸,而氨基端是亲水性氨基酸,大部分氨基酸残基是疏水性的。实时定量PCR结果显示:CcFLC基因的2个开放阅读框在山核桃的营养枝的幼茎、幼叶、顶芽,以及短果枝的雌花芽和雄花芽中都有表达,但相对表达量存在较大差异,同一组织中ORF1 的表达丰度明显高于ORF2。ORF1 表达量在茎中最高,但在叶和雄花芽的表达量最低;ORF2 在雌花芽中相对表达量最高,茎中表达量最低。图7参23

English Abstract

杨希宏, 黄有军, 陈芳芳, 黄坚钦. 山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(1): 1-8. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001
引用本文: 杨希宏, 黄有军, 陈芳芳, 黄坚钦. 山核桃FLOWERING LOCUS C同源基因鉴定与表达分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(1): 1-8. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001
YANG Xihong, HUANG Youjun, CHEN Fangfang, HUANG Jianqin. Identification and expression of FLOWERING LOCUS C homologous genes in Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(1): 1-8. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001
Citation: YANG Xihong, HUANG Youjun, CHEN Fangfang, HUANG Jianqin. Identification and expression of FLOWERING LOCUS C homologous genes in Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(1): 1-8. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.01.001

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