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模拟根系分泌物输入对森林土壤氮转化的影响研究综述

蔡银美 ,  张成富 ,  赵庆霞 ,  李昕颖 ,  何腾兵

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文章导航 > 浙江农林大学学报  > 2021 >  38(5): 916-925
毛玮, 曹跃芬. 棉纤维发育的遗传特性及相关基因的研究进展[J]. 浙江农林大学学报, 2018, 35(6): 1155-1165. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.06.021
引用本文: 蔡银美, 张成富, 赵庆霞, 等. 模拟根系分泌物输入对森林土壤氮转化的影响研究综述[J]. 浙江农林大学学报, 2021, 38(5): 916-925. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210293
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MAO Wei, CAO Yuefen. Genetic characteristics and research advances of genes related to cotton fiber development[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2018, 35(6): 1155-1165. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.06.021
Citation: CAI Yinmei, ZHANG Chengfu, ZHAO Qingxia, et al. Effect of simulated root exudates input on soil nitrogen transformation: a review[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2021, 38(5): 916-925. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210293
shu

模拟根系分泌物输入对森林土壤氮转化的影响研究综述

DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210293
  • 1.

    贵州大学 农学院，贵州 贵阳 550025

  • 2.

    贵州大学 新农村发展研究院，贵州 贵阳 550025

基金项目: 贵州省科技厅基础条件平台建设项目(黔科合平台人才〔2019〕5701号)；贵州大学引进人才科研项目(贵大人基合字〔2017〕68号)
详细信息
    作者简介: 蔡银美(ORCID: 0000-0001-7686-6749)，从事森林土壤生态研究。E-mail: 1830056589@qq.com
    通信作者: 赵庆霞(ORCID: 0000-0002-9774-6612)，讲师，博士，从事逆境下植物生理生态适应机制研究。E-mail: qxzhao@gzu.edu.cn

  • 中图分类号: S714

Effect of simulated root exudates input on soil nitrogen transformation: a review

  • 1.

    College of Agriculture, Guizhou University, Guiyang 550025, Guizhou, China

  • 2.

    Institute of New Rural Development, Guizhou University, Guiyang 550025, Guizhou, China

摘要

  • 摘要: 在全球气候变化加速植物生长和生物量积累的背景下，氮素是森林生态系统初级生产力的主要限制因子之一。根系分泌物所介导的根际微生物过程在驱动森林生态系统土壤养分循环和增加氮素有效性方面具有重要意义。基于此，本研究综述了模拟根系分泌物输入对森林土壤氮素矿化、硝化与反硝化过程的影响及其机制。发现根系分泌物中的有机酸、糖类和氨基酸等物质均能促进有机质的分解和氮素矿化，在一定程度上能缓解植物对氮的需求。不同碳含量和碳氮比的根系分泌物输入驱动根际微生物行使不同养分利用策略，通过生物和非生物作用，根系分泌物矿化有机质中的氮素供给植物吸收利用；根系分泌物中的生物硝化抑制剂能抑制土壤硝化作用，减少氮素的淋溶；根系分泌物还通过控制根际与氮转化相关的反硝化细菌群落来促进土壤反硝化作用。综上，植物通过增加根系分泌物的输入能提高地下碳分配，影响根际土壤氮素转化，在维持森林土壤氮素循环和缓解养分限制等方面具有重要作用。表2参70
    Abstract: Global climate change accelerates plant growth and biomass accumulation, and nitrogen has become one of main limiting factors for primary productivity in forest ecosystems. The microbial process mediated by root exudates in rhizosphere is of great significance in driving soil nutrient cycle and increasing nitrogen availability. This study reviewed the effects and mechanisms of simulated root exudates input on soil nitrogen mineralization, nitrification, and denitrification. It was found that organic acids, sugars, and amino acids in root exudates accelerated the decomposition of organic matter and nitrogen mineralization, which partly alleviated the demand of plants for nitrogen. Root exudates inputs with different carbon content and C/N ratio drove rhizosphere microorganisms to exercise different nutrient utilization strategies. Through biological and abiotic effects, root exudates mineralized nitrogen in organic matter and supplied it to plants for absorption and utilization. Biological nitrification inhibitors in root exudates inhibited soil nitrification and reduced nitrogen leaching. Root exudates also promoted soil denitrification by controlling the denitrifying bacterial community in the rhizosphere. In conclusion, plants can improve underground carbon distribution and affect nitrogen transformation in rhizosphere soil by increasing the input of root exudates, which is vital for maintaining nitrogen cycle and alleviating nutrient limitation. [Ch, 2 tab. 70 ref.]

  • 棉纤维是由外珠被表皮层的单细胞分化发育而成，分为长绒(lint)和短绒(fuzz)2种，长绒是高级棉纱纺织品的主要原材料，短绒主要用做制作纤维素、絮棉、纸张及纺织品的原料。在已有的四倍体棉种中，陆地棉Gossypium hirsutum和海岛棉Gossypium barbadense已经被驯化为栽培种[1-3]。目前世界上97%的棉纤维都产自陆地棉，产量高且适应性广，但是纤维品质中等；海岛棉产量低，适应性差，栽培范围不广泛，但是其纤维更长且品质高。如何获得优质高产的棉种，一直是遗传育种学家关注的焦点。而随着遗传学、细胞学和分子生物学等学科的交叉融合，棉纤维生长发育分子机制已成为国内外研究的热点。探明棉花种子表皮细胞生长发育的分子基础，对于提高棉花产量及改良纤维品质至关重要。早期有关棉纤维发育研究大多集中于遗传定位。大量与纤维品质和产量相关的数量性状位点(QTL)通过图位克隆的方法被发现于各个染色体[4-5]，而光子显性基因Li1，Li2，N1和Fbl以及光子隐性基因n2，sma-4(fz)和sma-4(ha)[6]等一直备受关注。近年来，深度测序技术的兴起，对棉纤维发育的分子机制的研究起了有效的推动作用。随着深度测序技术的不断革新，棉花全基因组测序不断完善[7]，全基因组微卫星序列得以注释[8]，单核苷酸多态性(SNP)芯片的开发成为可能[9]，使得遗传定位工作更加便捷[9-10]。转录组学、蛋白组学及表观遗传学领域三方位的深度测序有效构建了核糖核酸(RNA)水平和蛋白质水平、编码区域和非编码序列之间的联系，并发现一系列的转录因子、编码转脂蛋白的基因、钙信号转导相关基因、多糖合成相关蛋白、大量的微核糖核酸(miRNA)以及脱氧核糖核酸(DNA)甲基化作用等共同参与棉纤维发育过程[11-16]。本文将从棉纤维发育各时期的形态结构变化及特征，经典遗传学研究，深度测序技术在转录组学、蛋白组学及表观遗传学领域的运用，以及棉纤维发育各个时期所涉及的相关调控基因等4个方面对棉纤维发育机制的研究进展进行综述。

    1.   棉纤维发育各时期的形态结构变化特征

    棉纤维细胞发育进程是一个多基因调控的有序的系统发生过程，整个细胞分化过程可被分为棉纤维起始、伸长、次生壁合成与增厚、脱水成熟等4个时期[17-20]。

    1.1   棉纤维起始期

    长绒纤维细胞一般在开花前或开花当天就开始突起，而短绒纤维的突起要稍迟几天，两者的分化过程基本相似[21]。RAMSEY等[22]通过观察开花前16 d到开花当天胚珠的亚显微结构，发现开花前16 d到前3 d表皮细胞无差异，说明纤维原始细胞的分化与突起晚于开花前3 d。而在开花前2~3 d纤维原始细胞受生长素(IAA)和赤霉素(GA3)的刺激开始产生纤维[11]，开花当天，纤维原始细胞的分化与突起已基本完成。棉花纤维原始细胞分化与突起多少决定种子表面纤维数量，从而决定了棉纤维的产量。

    1.2   棉纤维伸长期

    研究发现一般只有25%~30%的棉花种子表皮细胞(约2万个)能正常突起伸长，形成成熟的纤维[23-24]。棉纤维的伸长几乎和突起同时进行，从开花当天开始，发生在细胞壁膨胀过程，纤维的最终长度取决于纤维伸长速率和持续时间2个方面[25]，一般持续20~30 d，该过程通过一种扩散生长机制实现并指导纤维细胞的极化生长[26-27]。纤维伸长分为非极性膨胀和极性伸长2个阶段：非极性膨胀期决定了纤维的细度，纤维细胞向四周扩展直至形成纤维的最终直径[28]；极性伸长期可使纤维长度达到最终长度的80%[29]，这一时期生化反应最为活跃，主要决定纤维的长度，是影响纤维品质的关键时期[24]。

    1.3   棉纤维次生壁合成与增厚期

    棉纤维次生壁合成与增厚期和纤维伸长期存在一段时期的重叠[17]，在开花后16 d开始，持续到开花后40 d，在这段时期，纤维素大量沉积，次生壁不断加厚[30]。伴随着纤维素沉积的加速，纤维伸长逐渐减弱，该过程是影响纤维强度和韧性的关键时期。

    1.4   棉纤维脱水成熟期

    在次生壁合成与增厚期后就进入了纤维脱水成熟期，发生在开花后40~50 d，棉铃开裂至充分吐絮，纤维失水，形成转曲[31]。成熟的棉纤维由外向内依次为初生壁、次生壁和中腔。

    2.   棉花纤维生长发育的遗传学研究

    遗传规律研究和基因遗传定位是经典遗传学中2项重要的基础工作。在棉纤维遗传规律研究中发现，相同性状的材料基因型不同，其遗传模式也不同，而棉纤维发育相关基因的遗传定位又可被分成质量性状和数量性状(QTL)的定位。

    2.1   棉纤维遗传规律研究

    CARVER[32]和KEARNEY等[33-34]研究发现棉花光子性状主要由2对独立的位点控制，显性光子基因(N1)和隐性光子基因(n2)，宋丽等[35]证实这2种光子基因均符合单基因遗传模型。既无长绒也无短绒的L40突变体的光子性状为不完全显性[36]。既无长绒也无短绒的突变体Xu142 fl的短绒的发育受N1和n2 2对基因控制，长绒的发育受Li3基因位点控制[37]。陆地棉短绒突变体Li1和Li2均为单基因显性遗传[38-40]。孙亚莉等[41]选取大量的陆地棉和海岛棉的光子材料对棉花光子性状进行了遗传分析，其研究发现棉花短绒多少与生态环境有关系，且不同品种光子材料的遗传模式也不同，不论海岛棉还是陆地棉材料均存在显性、部分显性和隐性遗传。对3个陆地棉隐性性状的材料进一步研究表明：这3个材料的遗传规律均不同，‘库光子’的光子性状由2对隐性等位基因控制，并且有互补效应；‘陆无絮’的光子性状由2对隐性等位基因控制，基因间呈积加作用；SA65的光子性状由单隐性基因控制。

    2.2   棉纤维基因的QTL定位

    纤维品质性状包括长度、整齐度、伸长率、强度、细度、颜色和马克隆值等多个方面。随着分子标记的不断开发与应用，在棉花染色体A组和D组染色体上都有大量棉纤维品质和产量相关的QTL被发现(表 1)。从表 1可知：纤维品质和产量性状的QTL几乎遍布了每一条染色体，且不同实验室使用不同的群体所得到的结果也有很大差异。同时，研究也发现这些性状受环境的影响很大，某些QTL在不同环境条件下有变化，甚至检测不到，导致已定位的QTL间重复性差[10, 42]，这也说明纤维品质及产量性状的遗传非常复杂。研究也发现了一些稳定的主效QTL，如第10号染色体的棉纤维强度主效QTL(FS1)，解释了超过30.00%的表型变异[43]；第19号染色体影响衣分的QTL(qLI17)，解释24.30%的表型变异[34]；第8号染色体上颜色相关QTL(Ge6_Rd_8_3_10.60_[+])，解释48.00%的表型变异[5]；以及第14号染色体上与长度相关的QTL(qFL-Chr14-3)，解释15.05%的表型变异[10]，等等。此外，有些QTL虽然微效，但在不同环境下都能稳定存在，比如WANG等[42]在8，11，12和21号染色上发现的6个QTL：qFL-A8-1(长度相关)，qFS-A8-1(强度相关)，qFS-A12-1(强度相关)，qFS-A12-2(强度相关)，qFS-D11-1(强度相关)和qFM-A11-1(马克隆值相关)。这些稳定存在的QTL都值得科研工作者进一步关注和研究。

    表  1  不同群体中与棉纤维品质和产量相关的QTL分布
    Table  1.  QTL related to cotton fiber quality and yield in different populations
    性状 QTL所在染色体或连锁群 检出限(LOD) 变异率1% 群体 出处
    长度 Chr04，Chrl8，Chr22 2.00~2.74 7.80~12.60 陆地棉TM-1×海岛棉3-79的F2群体 KOHEL等[44]
    Chr20，LGA02(Chr08)，LGA03 (Chr11)，LGA05 2.63~5.40 2.90~13.70 陆地棉Siv’ on×海岛棉F-177的F2和F3群体 PATERSON等[4]
    Chr04 3.50 24.00 陆地棉Acala 44×海岛棉Pima S-7的F2群体 MEI等[45]
    Chr01，Chr03，Chr04，Chr06，Chr09，Chr13，Chr14，Chr18，Chr19，Chr20，Chr21，Chr23，Chr24，Chr26 3.30~9.50 6.00~40.00 陆地棉Guazuncho-2×海岛棉VH8-4602RIL LACAPE等[5]
    Chr05，Chr07，Chr08，Chr11，Chr12，Chr19，Chr21，Chr23，Chr26 4.57~6.05 2.47~8.49 陆地棉TM-1×海岛棉Hai7124的CSILs群体 WANG等[42]
    Chr10，Chr14，Chr15 2.50~7.71 6.21~15.05 陆地棉HS46 ×陆地棉MAR CABU-CAG8US-1-88 RIL LI等[10]
    整齐度 Chr04，Chr14，Chr15，Chr22，LGA03 (Chr11)，LGA05 1.65~3.79 2.10~13.30 陆地棉Siv’on×海岛棉F-177的F2和F3群0体 PATERSON等[4]
    Chr05，Chr09，Chr12，Chr15，Chr16，Chr18，Chr19，Chr20，Chr23，Chr26 3.50~7.80 9.00~32.00 陆地棉Guazuncho-2×海岛棉VH8-4602 RIL LACAPE等[5]
    Chr09 2.68~4.17 5.58~10.94 陆地棉HS46 ×陆地棉MARCABU- CAG8US-1-88的RIL LI等[10]
    伸长率 Chr05，Chr10，Chr15，Chr23，LGA02 (Chr8)，LGA03(Chr11)，LGD07 2.32~5.77 3.40~8.90 陆地棉Siv’on×海岛棉F-l77的F2和F3群体 PATERSON等[4]
    Chr09 5.16 42.00 陆地棉Acala 44×海岛棉Pima S-7的F2群体 MEI等[45]
    Chr02，Chr06，Chr09，Chr10，Chr12，Chr13，Chr15，Chr19，Chr20，Chr21，Chr23，Chr26 3.40~6.70 6.00~21.00 陆地棉Guazuncho-2×海岛棉VH8-4602RIL LACAPE等[5]
    Chr14，Chr20，Chr24 2.49~7.80 5.35~32.28 陆地棉HS46 ×陆地棉MARCABU-CAG8US-1-88 RIL LI等[10]
    强度 Chr03，Chr14，Chr15，Chr25 2.08~2.69 10.40~23.10 陆地棉TM-1×海岛棉3-79的F2群体 KOHEL等[10]
    Chr10 4.79~5.80 53.00~53.80 异质棉7235×陆地棉TM-1的F2群体 ZHANG等[43]
    Chr01，Chr04，Chr14，Chr17，Chr18，Chr20，Chr22，Chr23，Chr25，LGA01 (Chr13)，LGA02(Chr08)，LGA03(Chr11)，LGA05，LGD02(Chr21)，LGD03(Chr24)，LGD04，LGD07 0.21~6.22 2.50~17.40 陆地棉Siv’on×海岛棉F-177的F2和F3群体 PATERSON等[4]
    Chr03，Chr04，Chr05，Chr07，Chr09，Chr12，Chr14，Chr15，Chr16，Chr18，Chr19，Chr21，Chr23，Chr26 3.30~8.50 7.00~31.00 陆地棉Guazuncho-2×海岛棉VH8-4602RIL LACAPE等[5]
    Chr05，Chr07，Chr08，Chr09，Chr11，Chr12，Chr13，Chr14，Chr15，Chr16，Chr17，Chr18，Chr21，Chr23 7.32~22.54 5.07~15.82 陆地棉TM-1×海岛棉Hai7124的CSILs群体 WANG等[42]
    细度 Chr01，Chr02，Chr03，Chr12，Chr16，LGD01 2.16~4.04 16.70~43.90 陆地棉TM-1×海岛棉3-79的F2群体 KOHEL等[44]
    Chr02，Chr04，Chr05，Chr06，Chr09，Chr14，Chr15，Chr17，Chr20，Chr23，Chr25，LGA01 (Chr13)，LGA05，LGA06，LGD01，LGD02(Chr2l)，LGD03(Chr24)，LGD04，LGD05，LGD07 2.21~9.78 2.20~30.30 陆地棉Siv’on×海岛棉F-l77的F2和F3群体 PATERSON等[4]
    Not determined 5.11 43.20 陆地棉Acala 44×海岛棉Pima S-7的F2群体 MEI等[45]
    Chr01，Chr02，Chr03，Chr04，Chr05，Chr06，Chr08，Chr09，Chr10，Chr12，Chr15，Chr16，Chr17，Chr18，Chr19，Chr20，Chr21，Chr22，Chr23，Chr24，Chr25，Chr26 3.30~8.90 6.00~41.00 陆地棉Guazuncho-2×海岛棉VH8-4602RIL LACAPE等[5]
    颜色 Chr06，Chr09，Chr14，Chr17，Chr18，Chr22，Chr25，LGA01，LGA02，LGA03，LGD02(Chr21) 2.66~11.67 2.50~14.90 陆地棉Siv’on×海岛棉F-177的F2和F3群体 PATERSON等[4]
    Chr01，Chr02，Chr06，Chr07，Chr08，Chr09，Chr11，Chr14，Chr15，Chr17，Chr18，Chr19，Chr21，Chr22，Chr25 3.30~10.60 6.00~48.00 陆地棉Guazuncho-2×海岛棉VH8-4602RIL LACAPE等[5]
    马克隆值 Chr05，Chr06，Chr09，Chr11，Chr12，Chr15，Chr16，Chr19，Chr21，Chr22 4.56~9.09 0.80~8.03 陆地棉TM-1×海岛棉Hai7124的CSILs群体 WANG等[42]
    Chr14，Chr16 2.51~4.23 5.52~9.20 陆地棉HS46 ×陆地棉MARCABU- CAG8US-1-88 RIL LI等[10]
    产量 A02(Chr08)，A03(Chr11)，Chr14，Chr23，Chr25，LG5 3.00~5.28 13.01~28.35 陆地棉Handan 208×海岛棉Pima 90的F2群体 HE等[46]
    衣分 D08(Chr19) 3.45 24.34 陆地棉Handan 208×海岛棉Pima 90的F2群体 HE等[46]
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    然而，棉纤维相关性状QTL的分离和克隆仍然很少。有研究发现在第12条染色体上(A12/D12)与棉纤维品质相关的QTL附近的GhHOX3基因对棉纤维长度起重要调控作用[47]，以及定位于同源染色体A8(chr08)和D8(chr24)上的GhSusA1基因过表达可以增强纤维长度和强度[48]。

    2.3   棉纤维基因的质量性状定位

    在光子显性基因定位中发现，N1和Fbl基因位于chr12上[6]，其中N1基因被鉴定为转录因子MYB25-like[49]。光子隐性基因定位研究表明：n2定位在chr26上，sma-4(fz)位于L.G.A3的端部，sma-4(ha)位于L.G.A3中部[6]。超短纤维突变体Li1基因位于chr22上，并已通过精细定位被克隆到，是一个肌动蛋白家族基因[50-53]；而Li2基因则位于chr18上[6, 53]。

    3.   棉纤维发育组学研究

    棉纤维发育过程涉及到大量的基因和通路调控。利用高通量测序技术，对棉纤维发育的转录组和蛋白组分析及表观遗传研究，可以短时间内获得大量信息，捕获到许多参与不同发育阶段的特异性基因及信号通路，为下游单独研究重要基因的功能奠定良好的基础。

    3.1   转录组学研究

    利用棉花胚珠体外培养技术结合转录组数据分析比较，KIM等[11]在纤维起始分化时期发现了许多在野生型和无毛突变体间表达有差异的基因，包括MYB25，MYB109，PDF1，MYB25-like，HD1等转录调节因子，表明在棉纤维起始分化过程中存在复杂的信号网络调节机制。通过比较短绒突变体(Li1)与野生型之间在开花后1，3和8 d的转录组数据，LIANG等[49]在胚珠中共检测到7 852个差异表达基因，主要参与次生代谢物和脂质代谢途径，其中涉及非长链脂肪酸生物合成的37个基因在Li1突变体纤维的快速伸长发育过程中被显著抑制，这说明脂质代谢途径与纤维伸长密切相关。HOVAV等[54]评估了从开花后初级次生壁到次级次生壁合成过程中棉纤维发育的转录组变化发现，棉纤维发育过程中的基因转录水平很高，在每个阶段占到所有基因的75%~94%，并且半数以上的基因在纤维发育的至少一个阶段中上调。BOLTON等[55]利用基因芯片技术和实时荧光定量PCR技术在Li1突变体中发现超过100个基因在次生壁的生物合成过程中差异表达，其中的3个候选基因：伸展蛋白(extensin)，蔗糖合成酶(sucrose synthase)和微管蛋白(actin)的表达量明显偏离野生型的表达水平。通过陆地棉TM-1背景下的海岛棉染色体导入系与亲本纤维的转录组差异比较，FANG等[56]在CSIL-35431和CSIL-31010等2个导入系的次生壁合成过程中发现了大量与TM-1有表达差异的基因，功能富集分析表明这些基因主要富集于次生细胞壁的生物合成、葡糖醛酸合成、纤维素合成等生物途径。

    3.2   蛋白质组学研究

    利用蛋白组学研究，许多棉纤维发育过程中的重要蛋白被不断发掘，且此技术很好地互补了转录组只能在mRNA水平上研究纤维相关基因的劣势。HU等[12]应用相对和绝对定量(iTRAQ)LC-MS/MS分析技术研究了1 317个纤维特异性表达蛋白，其中205个蛋白在发育阶段中差异表达，190个蛋白在野生和栽培棉之间差异表达。结合转录组、iTRAQ蛋白质组和遗传图谱定位的综合分析方法，MA等[13]发现徐州142野生型与其无绒毛突变体(fl)的胚珠之间存在大量差异表达的基因和蛋白，这些差异基因和蛋白主要存在于氨基酸、核苷酸、脂肪酸和叶酸代谢以及黄酮生物合成中，说明这些代谢途径在纤维发育过程中具有重要作用。

    3.3   表观遗传学研究

    近年来，棉纤维发育的表观遗传学研究也取得了巨大进展。基于pre-miRNAs和已发现的miRNA靶基因数据，CHEN等[14]对83个miRNA前体及其目标调控基因进行了研究，并构建了miRNAs及其靶位点调控网络，并揭示了这些miRNA及靶基因在纤维不同发育阶段的表达模式。SONG等[15]对纤维和胚珠进行了甲基化组、转录组和小RNA组学分析，发现在胚珠和纤维发育过程中CHH甲基化变化显著。该研究发现，在胚珠中，启动子中的CHH甲基化与可诱导RNA依赖的DNA甲基化(RdDM)和胚珠偏好基因上调的siRNA呈正相关；在纤维细胞中，胚珠衍生细胞产生独立的RdDM的异染色质CHH超甲基化，抑制转座子及附近纤维相关基因的活性。使用甲基化抑制剂5-氮-2′-脱氧胞苷对胚珠进行体外培养，可以减少纤维细胞的数量和长度，这表明DNA甲基化在纤维发育中具有潜在作用。这些研究表明：启动子和转座子及附近基因中的RdDM依赖的甲基化可作为基因和转座子表达的双保险反馈机制。ZOU等[16]对参与纤维起始和伸长过程的长链非编码RNA(lncRNA)进行了系统分析，共鉴定到5 996条lncRNAs，其中长链非编码RNA(lincRNA)3 510条，天然反义转录RNA(lncNAT)2 486条，表明lncRNA对棉纤维的发育至关重要。

    4.   棉纤维发育不同时期相关调控基因研究

    4.1   棉纤维起始期相关基因

    在棉花胚珠EST数据库中，约10%的基因与转录因子密切相关，包括56个转录因子家族成员[57]，如MYB类转录因子家族的GL1及其同源基因MYB2[58]，MYB109[59]，TTG1[60]和GL2[61]等均被发现在棉纤维发育的早期阶段高效表达。棉花GaMYB2基因可以诱导种子表皮毛的产生，且转化拟南芥可以弥补GL1突变对表皮毛起始分化造成的影响[58]。通过干扰GhMYB109的表达，PU等[62]发现棉纤维细胞分化延迟且起始数量减少，说明GhMYB109在棉花纤维分化阶段起重要作用。LOGUERICO等[63]发现GhMYB4和GhMYB5基因在纤维分化期的胚珠中特异表达。WALFORD等[64]发现GhHD1可以介导棉花表皮细胞的分化。辛婧[65]的研究表明转录因子GbSPB8可能调控棉花纤维起始发育。

    4.2   棉纤维伸长期相关基因

    转脂蛋白和钙信号转导相关蛋白在棉纤维伸长过程中起到极其重要的作用。MA等[66]研究发现：转脂蛋白GhLTP3和GhLTP6的表达量在纤维快速伸长期达到最高水平，此外李锡花等[67]发现GhLTP3的表达量从开花后0~15 d中表达量不断升高，在第15天达到顶峰，之后逐渐下降。赵存鹏等[68]和GAPPER等[69]研究发现：钙调蛋白CaM在低温逆境的条件下能使活性氧(ROS)、超氧游离基、过氧化氢和羟自由基等物质提高，进而使纤维细胞壁松弛，从而影响细胞伸长。CHENG等[70]发现GhCaM7-like基因在纤维快速伸长期显著表达。HUANG等[71]发现钙依赖性蛋白激酶GhCPK1在开花第10天的胚珠中高表达。这些研究都说明钙信号转导在纤维伸长过程中发挥重要作用。除了转脂蛋白和钙信号转导相关蛋白，转录调节因子也参与其中，如ZHANG等[72]发现GbMYB25与GbML1相互作用并通过调节ROS信号调节纤维伸长。HSU等[73]发现GhMYB7可以调控LTP3等脂转移蛋白编码基因。

    4.3   棉纤维次生壁合成与加厚期相关基因

    DELMER等[74]发现Rac9和Rac13可以控制棉花纤维素沉积方向。ZHAO等[75]发现GhRGP1在纤维发育的初生壁伸长及次生壁加厚后期优势表达，参与植物细胞壁非纤维素类的多糖合成。杨郁文等[76]发现一种Ser/Thr激酶和Try激酶的双受体蛋白GhRLK1与激活和维持次级细胞壁形成的细胞信号传导过程有关。此外，GhRDL1(RD22-Like1)与GhEXPA1互作会影响纤维细胞壁发育，GhRDL1基因过表达会产生长且质量较好的棉纤维[77]。

    4.4   棉纤维脱水成熟期相关基因

    目前，关于棉纤维细胞脱水成熟期的相关研究较少，对于纤维在脱水成熟过程中细胞与分子水平的变化还不清楚，只是猜想可能涉及到棉纤维细胞的程序性死亡[78]。

    5.   研究展望

    随着技术的革新，大量棉纤维发育相关基因和涉及的调控网络被不断发现，但是基因间的相互作用及其潜在的调控机制还有待进一步探索。近年来，棉花转基因技术日益成熟，新兴的CRISPR/Cas9基因编辑系统也于2017年3月在棉花基因组靶基因敲除中得到首次应用。JANGA等[79]利用CRISPR/Cas9系统成功将转绿色荧光蛋白(GFP)基因棉花系的GFP基因敲除；LI等[80]以棉花內源GhMYB25为目标基因，使用2种单导向RNA对该基因进行定点突变，突变率分别为100%和98.8%。这些研究表明：CRISPR/Cas9可以在棉花基因组上进行高效和高特异性地突变。随着新技术在棉花中的应用与成熟，棉纤维发育相关基因及其调控机制也有望有更多的发现。

  • 表  1  根系分泌物输入对土壤氮转化的影响

    Table  1.   Effects of root exudates on soil nitrogen transformation

    森林类型土壤类型种类输入量或输入速率输入方式影响文献
    云杉和冷杉 Abies fabri 棕色森林土壤 葡萄糖、草酸 单位根系表面积碳输入速率为5 μg·cm−2·h−1 蠕动泵连续添加 提高酶活性，促进氮矿化 [19]
    火炬松 Pinus taeda 辉绿岩发育的微酸性土壤 富马酸、丙二酸、草酸、柠檬酸、葡萄糖、果糖和蔗糖 单位根系表面积碳输入速率为0、20、100和200 mg·cm−2 ·d−1 蠕动泵连续添加 增加土壤微生物对氮的降解 [9]
    栎树 Quercus 潮土，母质为砂质沉积物 葡萄糖，丙氨酸 单位质量的土壤添加碳为
    1 mg·g−1    		 一次性
    添加    		 丙氨酸产生最大的激发效应，增加土壤微生物活性 [21]
    常绿阔叶林 酸性土壤 D-葡萄糖、D-果糖、D-木糖、草酸、延胡索酸、琥珀酸、乙酸、L-脯氨酸、L-精氨酸、L-甘氨酸、丝氨酸和谷氨酸 单位质量的土壤添加碳为0、0.3、0.6、1.2 mg·g−1 一次性
    添加    		 添加0.6和1.2 mg·g−1碳显著提高氮转化相关酶的活性 [22]
    − 棕色森林土壤 葡萄糖、蔗糖、果糖、核糖、阿拉伯糖、甘氨酸、缬氨酸、谷氨酰胺、丝氨酸、丙氨酸 苹果酸、柠檬酸、丙二酸、草酸和延胡索酸 添加碳为0、0.375、0.750、1.500和3.000 mg·d−1 注射器连续添加 提高NH4 +-N含量，显著增加反硝化速率 [18]
    北美红栎 Quercus rubra和红花槭 Acer rubrum 砂质壤土，母质为冰川碛物 柠檬酸、草酸、富马酸、丙二酸和葡萄糖，氯化铵(NH4Cl)模拟氮含量 仅含碳，碳质量浓度为
    500 mg·L−1；碳氮比为10    		 蠕动泵连续添加 提高土壤微生物生物量、微生物活性和外切酶活性 [23]
    栎木 Quercus spp.和马尾松 Pinus massoniana 微酸性土壤，母质为砂岩和页岩 柠檬酸、草酸，富马酸、丙二酸和葡萄糖 仅含碳，添加碳为
    0.053 6 g·m−2·d−1；碳氮比为10，添加碳为0.021 6 g·m−2 ·d−1；碳氮比为25，添加碳为0.053 6 g·m−2·d−1    		 每次定量连续添加 增强酶功能 [24]
    云杉 暗棕壤 葡萄糖、柠檬酸和谷氨酸 仅含氮，氮质量浓度为
    6 mg·L–1；碳氮比为10、50、100；碳质量浓度为60 mg·L−1    		 每次定量连续添加 增加胞外酶分泌，加速土壤有机质分解和无机氮释放 [25]
    　　说明：−表示文献中无森林类型信息
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    表  2  植物根系分泌生物硝化抑制剂的种类和效果

    Table  2.   Types and effects of biological nitrification inhibitors secreted by plant roots

    分类植物种类生物硝化抑制剂物质种类抑制方式文献
    草本臂形草　臂形草内酯　　　环二萜类AMO和HAO　　　 [12]　
    作物高粱　　高粱醌　　　　　苯醌类　AMO和HAO　　　 [45]　
    作物高粱　　对羟基苯丙酸甲酯苯丙酸类AMO　　　　　　 [44-46]
    作物高粱　　樱花素　　　　　黄酮类　AMO和HAO　　　 [45]　
    作物水稻　　1,9-癸二醇　　　 脂肪醇　AMO　　　　　　 [48-49]
    木本卡兰贾树水黄皮素　　　　抑制氨氧化细菌活性[50]　
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出版历程
  • 收稿日期:  2021-04-16
  • 修回日期:  2021-07-31
  • 网络出版日期:  2021-10-12
  • 刊出日期:  2021-10-20

模拟根系分泌物输入对森林土壤氮转化的影响研究综述

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210293
  • 1. 贵州大学 农学院，贵州 贵阳 550025
  • 2. 贵州大学 新农村发展研究院，贵州 贵阳 550025
    • 基金项目:  贵州省科技厅基础条件平台建设项目(黔科合平台人才〔2019〕5701号)；贵州大学引进人才科研项目(贵大人基合字〔2017〕68号)
    作者简介:

    蔡银美(ORCID: 0000-0001-7686-6749)，从事森林土壤生态研究。E-mail: 1830056589@qq.com

    通信作者: 赵庆霞(ORCID: 0000-0002-9774-6612)，讲师，博士，从事逆境下植物生理生态适应机制研究。E-mail: qxzhao@gzu.edu.cn
  • 收稿日期: 2021-04-16
  • 修回日期: 2021-07-31
  • 网络出版日期: 2021-10-12
  • 刊出日期: 2021-10-20

  • 中图分类号: S714

摘要: 在全球气候变化加速植物生长和生物量积累的背景下，氮素是森林生态系统初级生产力的主要限制因子之一。根系分泌物所介导的根际微生物过程在驱动森林生态系统土壤养分循环和增加氮素有效性方面具有重要意义。基于此，本研究综述了模拟根系分泌物输入对森林土壤氮素矿化、硝化与反硝化过程的影响及其机制。发现根系分泌物中的有机酸、糖类和氨基酸等物质均能促进有机质的分解和氮素矿化，在一定程度上能缓解植物对氮的需求。不同碳含量和碳氮比的根系分泌物输入驱动根际微生物行使不同养分利用策略，通过生物和非生物作用，根系分泌物矿化有机质中的氮素供给植物吸收利用；根系分泌物中的生物硝化抑制剂能抑制土壤硝化作用，减少氮素的淋溶；根系分泌物还通过控制根际与氮转化相关的反硝化细菌群落来促进土壤反硝化作用。综上，植物通过增加根系分泌物的输入能提高地下碳分配，影响根际土壤氮素转化，在维持森林土壤氮素循环和缓解养分限制等方面具有重要作用。表2参70

English Abstract

毛玮, 曹跃芬. 棉纤维发育的遗传特性及相关基因的研究进展[J]. 浙江农林大学学报, 2018, 35(6): 1155-1165. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.06.021
引用本文: 蔡银美, 张成富, 赵庆霞, 等. 模拟根系分泌物输入对森林土壤氮转化的影响研究综述[J]. 浙江农林大学学报, 2021, 38(5): 916-925. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210293
shu
MAO Wei, CAO Yuefen. Genetic characteristics and research advances of genes related to cotton fiber development[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2018, 35(6): 1155-1165. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.06.021
Citation: CAI Yinmei, ZHANG Chengfu, ZHAO Qingxia, et al. Effect of simulated root exudates input on soil nitrogen transformation: a review[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2021, 38(5): 916-925. DOI: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210293
shu

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  • 氮素是植物生长过程中需求量最大的矿质营养元素。全球气候变化下，气温升高、二氧化碳(CO2)增加提高了植物碳同化速率[1-2]，进一步加剧了植物对氮的需求。森林生态系统中90%的氮素都存在于土壤中，但大多数氮素不能直接被植物吸收利用。因此，如何加速氮素转化，提高氮素利用效率已成为亟待解决的问题。研究表明：植物可以通过根系分泌物的输入刺激土壤有机质的微生物分解来加速氮素循环，影响根际氮动态[3]。土壤氮转化主要包括固氮作用、硝化作用、反硝化作用和氨化作用4个过程，以上过程均由微生物驱动[4]。氮气(N2)分子三键的强稳定性导致不能被大多数生物直接利用，只能通过原核生物(细菌或古菌)的固氮作用，将N2还原为铵离子(NH4 +)。NH4 +也容易被土壤微生物氧化，发生硝化作用，即主要由氨氧化细菌(ammonia-oxidizing bacteria, AOB)、氨氧化古菌(ammonia-oxidizing archaea, AOA)催化完成的氨氧化过程和亚硝酸盐氧化细菌和完全氨氧化微生物催化完成的亚硝酸盐氧化过程[5-6]。其中，亚硝化作用被认为是全球氮循环的中心环节，然而，氨氧化细菌和氨氧化古菌的固氮作用主要局限于海洋和淡水沉积物[7]，对森林固氮作用有限。有研究表明：在气温升高和CO2增加的条件下，植物会通过改变自身的地下根系分泌物的输入速率和组分控制根际界面的生物和非生物过程，加速氮素矿化，缓解植物快速生长的养分限制[8-11]。根系分泌物由于含丰富的碳源和氮源，它的输入通过改变微生物数量和活性，深刻影响土壤有机质分解和养分代谢过程[9-10]。但森林生态系统中植物种类繁多，植物根系分泌物组成成分复杂，且不同植物的根系分泌物分泌速率不同，对有机质矿化和氮素转化过程的影响存在较大差异。模拟根系分泌物输入试验是通过原位收集测定根系分泌物的物质组成、含量及输入速率，进而探究根系分泌物输入变化对根际土壤养分转化过程的影响。相关模拟根系分泌物输入的研究表明：根系分泌物既能促进土壤氮素从有机态向无机态转化，显著提高氮素矿化速率，又能抑制硝化作用和促进反硝化过程，降低氮素流失量[12-13]。但根系分泌物对土壤氮转化的影响复杂，且是多方面的，目前缺乏相关的总结性综述。基于此，本研究主要综述了根系分泌物模拟输入对森林土壤氮矿化、硝化、反硝化过程的影响，以期为今后开展根系分泌物和氮素转化相关研究提供科学依据和理论指导。

    • 1.   模拟根系分泌物输入对森林土壤氮矿化的影响及其机制

      1.1.   碳输入对土壤氮矿化的影响及其机制

      1.1.1.   碳输入量及输入速率对土壤氮矿化的影响

    • 根系分泌物是植物生长过程中通过根系分泌到土壤中的多种可溶性有机化合物的总称[14]，占植物光合作用碳同化总量的5%~21%[15]。植物根系通过释放根系分泌物中的含碳物质到根际土壤中，刺激土壤微生物群落活动[16-17]，加速土壤有机质的分解，促进土壤氮素矿化。

      根系分泌物碳输入所介导的根际氮矿化过程主要与输入量及输入速率有关。目前，多以原位测定的根系分泌物碳输入速率为研究基础，模拟输入量及输入速率梯度展开研究。MEIER等[9]通过模拟根系单位表面积不同碳输入速率(0、20、100和200 mg·cm−2·d−1)发现：当碳输入速率为20 mg·cm−2·d−1时，显著增加了N-乙酰-β-D-葡萄糖苷酶活性，当碳输入速率为100 mg·cm−2·d−1时，显著提高了蛋白水解酶活性，对土壤的总氮矿化有积极作用。LANGARICA-FUENTES等[18]以多年生落叶松Larix gmelinii根系碳输入速率的0~2倍模拟添加试验(0、0.375、0.750、1.500和3.000 mg·cm−2·d−1)的结果显示：随着碳输入速率的增加，土壤中铵态氮(NH4 +-N)显著增加，并在分泌速率为3.000 mg·cm−2·d−1时达到最高。YUAN等[19]研究发现：添加草酸和葡萄糖均可提高β-1,4-N-乙酰氨基葡糖苷酶和多酚氧化酶的活性，草酸使云杉Picea asperata人工林和天然林土壤的潜在净氮矿化率分别增加89%和150%，葡萄糖使其分别增加了45%和104%。但是含碳物质的输入超过一定含量时，酶活性反而下降，有机质的分解减少[20]。以上研究(表1)均表明：一定量的根系分泌物碳输入可以提高相关氮转化酶的活性，促进有机氮的矿化。因此，树木可以通过控制根系碳的分泌速率影响根际氮素矿化。

      表 1  根系分泌物输入对土壤氮转化的影响

      Table 1.  Effects of root exudates on soil nitrogen transformation

      森林类型土壤类型种类输入量或输入速率输入方式影响文献
      云杉和冷杉 Abies fabri 棕色森林土壤 葡萄糖、草酸 单位根系表面积碳输入速率为5 μg·cm−2·h−1 蠕动泵连续添加 提高酶活性，促进氮矿化 [19]
      火炬松 Pinus taeda 辉绿岩发育的微酸性土壤 富马酸、丙二酸、草酸、柠檬酸、葡萄糖、果糖和蔗糖 单位根系表面积碳输入速率为0、20、100和200 mg·cm−2 ·d−1 蠕动泵连续添加 增加土壤微生物对氮的降解 [9]
      栎树 Quercus 潮土，母质为砂质沉积物 葡萄糖，丙氨酸 单位质量的土壤添加碳为
      1 mg·g−1      		 一次性
      添加      		 丙氨酸产生最大的激发效应，增加土壤微生物活性 [21]
      常绿阔叶林 酸性土壤 D-葡萄糖、D-果糖、D-木糖、草酸、延胡索酸、琥珀酸、乙酸、L-脯氨酸、L-精氨酸、L-甘氨酸、丝氨酸和谷氨酸 单位质量的土壤添加碳为0、0.3、0.6、1.2 mg·g−1 一次性
      添加      		 添加0.6和1.2 mg·g−1碳显著提高氮转化相关酶的活性 [22]
      − 棕色森林土壤 葡萄糖、蔗糖、果糖、核糖、阿拉伯糖、甘氨酸、缬氨酸、谷氨酰胺、丝氨酸、丙氨酸 苹果酸、柠檬酸、丙二酸、草酸和延胡索酸 添加碳为0、0.375、0.750、1.500和3.000 mg·d−1 注射器连续添加 提高NH4 +-N含量，显著增加反硝化速率 [18]
      北美红栎 Quercus rubra和红花槭 Acer rubrum 砂质壤土，母质为冰川碛物 柠檬酸、草酸、富马酸、丙二酸和葡萄糖，氯化铵(NH4Cl)模拟氮含量 仅含碳，碳质量浓度为
      500 mg·L−1；碳氮比为10      		 蠕动泵连续添加 提高土壤微生物生物量、微生物活性和外切酶活性 [23]
      栎木 Quercus spp.和马尾松 Pinus massoniana 微酸性土壤，母质为砂岩和页岩 柠檬酸、草酸，富马酸、丙二酸和葡萄糖 仅含碳，添加碳为
      0.053 6 g·m−2·d−1；碳氮比为10，添加碳为0.021 6 g·m−2 ·d−1；碳氮比为25，添加碳为0.053 6 g·m−2·d−1      		 每次定量连续添加 增强酶功能 [24]
      云杉 暗棕壤 葡萄糖、柠檬酸和谷氨酸 仅含氮，氮质量浓度为
      6 mg·L–1；碳氮比为10、50、100；碳质量浓度为60 mg·L−1      		 每次定量连续添加 增加胞外酶分泌，加速土壤有机质分解和无机氮释放 [25]
      　　说明：−表示文献中无森林类型信息
      • 1.1.2.   碳输入对土壤氮矿化的影响机制

    • 根系分泌物碳输入对氮矿化的影响机制主要可以分为生物和非生物作用。生物作用主要是指根系分泌物碳输入通过影响根际微生物，来影响土壤氮矿化。一方面根系碳输入可以为土壤微生物提供碳源，增加微生物的活性和数量，提高氮素矿化相关胞外酶的产量，从而刺激和激发土壤有机质分解和转化[26]。如NOBILI等[27]和KUZYAKOV等[28]研究发现：通过向土壤中添加有效的低分子底物(例如葡萄糖和氨基酸)可以促进激发效应，激活休眠的土壤微生物，增加土壤微生物量。另一方面，含碳物质的分泌还可以作为根际微生物的化学引诱物质，招募特定的微生物，改变群落的组成和多样性。如LANDI等[29]研究表明：葡萄糖和草酸的添加均能影响森林土壤细菌群落，葡萄糖偏向促进土壤微生物有机体的合成，草酸则被土壤中的某一种专一微生物利用。YUAN等[19]研究发现：添加草酸可以增加某些特殊的微生物种类定殖(如K策略相关微生物)，产生大量与氮转化相关的酶(如N-乙酰-β-D-葡萄糖苷酶)，从而进一步分解有机质，增强氮的释放。除了生物作用，根系碳分泌也可通过非生物作用过程，如保护态碳活化、微生物对有机碳的可接近性等影响氮矿化过程。例如，KEILUWEIT等[30]发现：输入草酸打破了空间隔离效应，增加了保护态碳的微生物可达性，通过配位络合作用和溶解反应等物理化学作用，破坏或者降低了土壤有机物-矿质复合体界面的稳定性，从而将土壤中保护态碳从土壤有机-矿质复合体中释放出来，供微生物分解和利用。YUAN等[19]也发现：草酸的添加破坏了有机-矿质复合体，显著降低了有机-矿质复合体中受保护的铁和铝的含量，导致有机物分解，增加氮的矿化来源。总之，根系碳分泌物可以通过生物和非生物作用影响氮矿化过程，但是由于根系碳分泌物组分的复杂性，根系分泌物中不同组分对氮矿化的作用效果及作用机制缺乏研究。

      • 1.2.   不同碳氮比的根系分泌物输入对氮矿化的影响及其机制

      1.2.1.   不同碳氮比的根系分泌物输入对氮矿化的影响

    • 森林根系分泌物研究大都仅关注根系碳源输入对土壤过程和功能的影响，而忽略了根系分泌物中氮成分变化及其伴随的碳氮比化学计量特征对土壤生态过程与调控机制的系统性研究，极大地限制对森林根系-土壤-微生物互作机制的深入认识[26]。例如有机酸和碳水化合物虽然是根系分泌物的主要化学物质，但有研究也发现了氨基酸等含氮物质的大量存在[31-32]，且在调控氮素转化过程中起关键作用。然而由于根系和微生物活动对根际有效氮素的获取和激烈竞争，使得根际区通常成为碳过剩而氮受限制强烈的区域[33]。大量研究表明：当土壤氮素较低时，根系分泌物刺激土壤有机质分解合成额外的氮[34-35]。因此，根系分泌物氮或碳氮比也是驱动根际微生物群落组成和活性的重要调控因子。

      DRAKE等[23]模拟根系分泌物中的柠檬酸、草酸、富马酸、丙二酸和葡萄糖等5种含碳物质，并用氯化铵配成碳氮比为10的添加液，结果表明：相比只含碳的根系分泌物，同时输入含有碳和氮的根系分泌物可显著提高土壤微生物活性、微生物生物量以及分解土壤低分子量有机物(如纤维素，氨基糖)的胞外酶活性，显著促进氮素矿化。TIAN等[24]在DRAKE等[23]的研究基础上增加了碳氮比为25的处理，以模拟在CO2增加的情况下根系分泌物的化学计量变化[11]，结果表明：碳氮比为10和25的处理均增强了与氮矿化相关的酶活性，并且碳氮比为25的处理还显著增加了土壤碳含量。梁儒彪等[25]模拟根系分泌物碳氮比化学计量特征(仅含碳，碳氮比为10、50、100)对川西亚高山森林土壤碳动态和微生物群落结构的影响表明：森林根系分泌物氮源输入和土壤氮有效性共同调控根系碳源输入对土壤有机质分解激发效应的方向和幅度。综上所述，相比只含碳的根系分泌物，添加适宜碳氮比的根系分泌物可显著提高土壤微生物活性和酶活性，对有机质的分解具有正效应。

      • 1.2.2.   不同碳氮比的根系分泌物输入对氮矿化的影响机制

    • 不同碳氮比根系分泌物的输入对氮矿化的影响机制主要是养分的输入或养分的有效性对有机物的矿化分解过程产生影响。该过程目前主要存在2种假说：微生物氮矿化假说与化学计量分解理论假说。微生物物氮矿化假说认为：外源碳的添加为土壤获取氮微生物提供能源，提高其微生物活性，进而刺激土壤惰性有机质分解和养分转化过程[36]。化学计量分解理论假说则认为：添加外源碳和氮满足土壤微生物需求时，其化学计量值高度匹配时，土壤微生物活性最高，分解速率最大[37]。2种假说代表了氮养分有效性对土壤有机质稳定性相反的影响效应。第1种假说表明氮有效性低，有利于土壤有机质的分解；第2种假说表明氮有效性高，有利于土壤有机质的分解[38]。梁儒彪等[25]研究表明：只含碳和碳氮比为100(氮含量基本忽略)的处理显著降低土壤全碳含量，而添加适量的氮(只含氮、碳氮比为10和50)在一定程度上缓和了土壤全碳含量的降低。其原因是低含量的有效氮促使微生物分泌更多的胞外酶，加速了土壤有机质的分解，使土壤全碳含量显著降低，而添加一定量的氮组分缓和了土壤氮的限制，使得微生物偏好利用易于分解的有机化合物，缓和了土壤全碳含量的降低幅度[25]。该研究结果证实了微生物氮矿化假说。CHEN等[38]研究显示：蔗糖和氮添加显著加速有机质的矿化，但有机质矿化的速率由氮有效性控制，表明高氮有效性有利于有机质的分解。该研究结果支持化学计量分解理论。根系分泌物通过控制输入土壤的养分化学计量比，介导着微生物行使不同的有机质分解和矿化策略，这对调控土壤养分利用方向和提高养分利用率具有重要意义。

      • 1.3.   根系分泌物不同组分输入对氮矿化的影响及其机制

    • 目前森林土壤矿化相关研究大多围绕有机酸和糖类开展。有机酸类和糖类通常由植物根系、菌根和菌丝分泌，且是最丰富的两类根系分泌物[39]。这两类物质在根系分泌物含碳物质中占的比例最高，当外界环境变化时最容易引起这两类物质含量的变化[40]。MEIER等[9]通过蠕动泵连续添加根系分泌物的方式，选择已发现的有机酸和单糖种类，模拟添加有机酸(富马酸、丙二酸、草酸和柠檬酸)和单糖(葡萄糖、蔗糖和果糖) (体积比为3∶1，比例接近成熟树木原位收集的根系分泌物中的有机酸和糖的比例)对氮素矿化的影响，发现有机酸和单糖的添加显著增强了降解氮素的酶活性，并增加了降解氮素微生物的分配比例。DRAKE等[23]和TIAN等[24]添加柠檬酸、草酸、富马酸、丙二酸和葡萄糖，梁儒彪等[25]添加葡萄糖和柠檬酸也发现相似的结果。YUAN等[19]研究发现：草酸和葡萄糖虽然显著促进了氮矿化和增加氮有效性，但葡萄糖的增强作用明显小于草酸，其原因是草酸不仅可以充当含羧基的碳源，而且还可以充当络合金属的配体，通过络合和溶解受保护的有机-矿质复合体，加速土壤微生物分解有机物。而葡萄糖增加了有机-矿质复合体的形成，从而限制了微生物的获取。另外，微生物对葡萄糖的优先利用也会导致较低的氮分解。BERNAL等[21]研究还发现：根系分泌物还对深层(2.7~3.0 m)土壤有机质矿化有积极作用，向深层土壤中添加葡萄糖和丙氨酸后，土壤酚氧化酶和过氧化物酶活性增加了13倍，显著降低了土壤微生物生物量和微生物磷脂脂肪酸含量，而且添加丙氨酸还产生了最大的激发效应。可见，根系分泌物在森林生态系统植物氮素需求供应中起着关键作用。

      除了有机酸和糖类以外，根系还会分泌一些其他物质影响土壤氮转化。目前相关研究报道主要集中在以下几个方面：①根系分泌物中含有大量的氨基酸、蛋白质等含氮物质，这些物质可以改变土壤的氮组分和含量，影响氮转化；②根系分泌物中有强黏着力的高分子多糖，能显著改善土壤微团聚体的稳定性及大小分布等物理性质，间接影响土壤氮素的矿化[41]；③植物根系分泌物也是土壤酶的重要来源之一，包括磷酸酶、转氨酶、淀粉酶、蛋白酶、多聚半乳糖醛酸酶等，可作为土壤碳、氮元素转化的催化剂，影响氮素转化[14]。

    2.   模拟根系分泌物输入对土壤硝化作用的影响及其机制

      2.1.   对土壤硝化作用的影响

    • 硝化作用指NH4 +氧化为亚硝酸根离子(NO2 −)的氨氧化过程和NO2 −氧化为硝酸根离子(NO3 −)的亚硝酸盐氧化过程。有研究表明：植物可以通过分泌某些物质来抑制土壤硝化作用，植物根系产生和分泌能抑制土壤硝化作用物质的能力被称为生物硝化抑制作用，植物根系产生和分泌的抑制硝化作用的物质，被称为生物硝化抑制剂(biological nitrification inhibitor, BNI)[42]。生物硝化抑制剂通过抑制AOB、AOA及相关酶，即氨单加氧酶(ammonia mono oxygenase, AMO)和羟胺氧化还原酶(hydroxylamine oxidoreductase, HAO)活性来抑制土壤硝化作用，降低NO3 −的淋溶[43]。目前已在高粱Sorghum bicolor[44-46]、小麦Triticum aestivum[47]、水稻Oryza sativa[48-49]、臂形草Brachiaria humidicola[12]中发现了生物硝化抑制剂的存在。这些被鉴定的硝化抑制剂中，臂形草内酯(brachialactone)、高粱醌(sorgoleone)和樱花素(sakuranetin)能通过抑制氨单加氧酶和羟胺氧化还原酶抑制土壤硝化作用，而对羟基苯丙酸甲酯[methyl 3-(4-hydroxyphenyl) propionate, MHPP]和1,9-癸二醇(1,9-decanediol)只能通过抑制氨单加氧酶抑制土壤硝化作用(表2)。在卡兰贾树Pongamia glabra中发现名为水黄皮素的生物硝化抑制剂，可以抑制氨氧化细菌的活性，其种子中有一种结晶的成分会改变生物硝化抑制剂的活性[50]，硝化作用抑制程度可达65%~75%[51]，能够显著提高氮素利用率。

      表 2  植物根系分泌生物硝化抑制剂的种类和效果

      Table 2.  Types and effects of biological nitrification inhibitors secreted by plant roots

      分类植物种类生物硝化抑制剂物质种类抑制方式文献
      草本臂形草　臂形草内酯　　　环二萜类AMO和HAO　　　 [12]　
      作物高粱　　高粱醌　　　　　苯醌类　AMO和HAO　　　 [45]　
      作物高粱　　对羟基苯丙酸甲酯苯丙酸类AMO　　　　　　 [44-46]
      作物高粱　　樱花素　　　　　黄酮类　AMO和HAO　　　 [45]　
      作物水稻　　1,9-癸二醇　　　 脂肪醇　AMO　　　　　　 [48-49]
      木本卡兰贾树水黄皮素　　　　抑制氨氧化细菌活性[50]　

      • 2.2.   对土壤硝化作用的影响机制

    • 根系分泌物的输入对土壤硝化作用的抑制主要表现在抑制土壤中NH4 +向NO3 −的转化。目前已发现的生物硝化抑制剂抑制硝化作用的机制主要是：含有生物硝化抑制活性的亚油酸和α-亚麻酸很可能具有抑制硝化所需的结构和链长，能同时抑制氨单加氧酶和羟胺还原酶[52]。此外，生物硝化抑制剂还扰乱羟胺还原酶到辅酶(ubiquinone)和细胞色素(cytochrome)的电子传递途径，影响氨氧化过程的代谢功能[53]。也有研究表明：化感物质会通过影响微生物抑制土壤硝化作用[54]，而高粱等植物的根系分泌物均属于化感物质，在一定程度上影响硝化作用。根系分泌物输入对土壤硝化作用的调控与土壤氮素水平有关。在NH4 +为0~1 mmol·L−1时，高粱和水稻生物硝化抑制剂的分泌量随NH4 +浓度的增加而显著增强，但当NH4 +大于1 mmol·L−1时，生物硝化抑制剂的分泌不再提高[55-56]。此外，还和氮素形态有关，在以NO3 −为氮源时，生物硝化抑制剂的分泌量少，而以NH4 +为氮源时则大量分泌[52]。其原因是由于土壤中NH4 +的积累会诱导亚硝化细菌活性的增强[57]。

    3.   模拟根系分泌物输入对土壤反硝化作用的影响及其机制

      3.1.   对土壤反硝化作用的影响

    • 反硝化作用是异氧微生物在缺氧或者厌氧情况下将NO3 −或者NO2 −还原为一氧化氮(NO)、一氧化二氮(N2O)和N2的过程。植物根系的生长和活动显著影响土壤中的反硝化过程，导致根际土壤中的反硝化作用比非根际土壤强[58-59]。然而，由于影响根际土壤反硝化过程的因素较多，导致根系分泌物在反硝化过程中的具体作用知之甚少[60]。

      根系分泌物的种类和含量对土壤反硝化作用影响不同。LANGARICA-FUENTES等[18]模拟不同种类(葡萄糖、蔗糖、果糖、核糖和阿拉伯糖、甘氨酸、缬氨酸、谷氨酰胺、丝氨酸和丙氨酸、苹果酸、柠檬酸、丙二酸、草酸和延胡索酸)、不同碳含量(0、0.375、0.750、1.500和3.000 mg·d−1)根系分泌物输入试验中发现：根系分泌物的碳输入显著促进土壤反硝化速率。庄姗等[61]通过室内模拟根系分泌物输入试验发现：草酸、丝氨酸、葡萄糖3种主要根系分泌物均能促进土壤N2O排放。GILES等[62]研究发现：添加葡萄糖、谷氨酰胺和柠檬酸也能显著促进N2O的排放，并且N2O的排放速率由底物的类型和利用效率决定，调节碳化合物的有效性可以降低N2O的排放。根系分泌物的量也影响土壤中N2O的产生量。GUYONNET等[63]发现：土壤N2O的产生量与根际土壤中丁酸和琥珀酸的相对含量呈正相关。小分子有机物(甲酸盐和葡萄糖)的微量添加也能刺激土壤N2O的排放[64]。可见，根系分泌物的输入促进了土壤反硝化作用，增加了N2O的排放。

      • 3.2.   对土壤反硝化作用的影响机制

    • 根系分泌物的输入对土壤反硝化作用的影响机制主要有以下几点：①根系分泌物可以加速氮矿化，促进氮释放。如草酸和葡萄糖均能显著促进土壤中有机态氮和有机复合态氮的矿化速度，促进氮的释放[19]。②根系分泌物和根系呼吸降低了氧气的利用率，促进反硝化作用[1, 65]。③根系分泌物可以调控氮素转化相关酶活性基因的表达，从而影响反硝化过程。反硝化过程由narG/napA、nirK/nirS、norB/nosZ基因编码的特定还原酶执行[66]。主要包括催化NO2 −还原为NO的亚硝酸盐还原酶(由nirK或nirS编码)，催化NO还原为N2O的NO还原酶(由norB编码)和将N2O转化为惰性N2的还原酶(由nosZ编码)[66]。通过控制基因表达调控土壤酶活性从而影响反硝化过程。④根系分泌物显著影响反硝化细菌群落[62, 67-68]。例如LANGARICA-FUENTES等[18]研究证实：根系分泌物会导致土壤细菌总数和反硝化菌群落规模和结构发生变化，增加反硝化速率。但是有些研究却发现根系分泌物输入虽然可以显著增加反硝化速率，但是对反硝化细菌的结构和丰度影响不大[69-70]。

    4.   展望

    • 根系分泌物介导的氮素转化的研究报道主要在增加土壤氮素矿化速率，抑制土壤硝化作用，及促进土壤反硝化过程3个方面。根系分泌物调控的根际土壤氮素转化过程为今后全球气候变化下的植物氮素需求研究提供了新方向。然而当前研究仍存在不足之处：①目前已经有部分研究发现了根系分泌物影响氮转化的现象，但其具体的作用机制以及作用过程还有待更进一步研究。②根系分泌收集困难，组分繁多，各组分含量较低，分离鉴定难度较大，且极易被微生物降解，目前较多研究集中在含量较高、且易分离鉴定的物质，很多成分还没有进行过研究。③当前农业生态系统生物硝化抑制剂研究较多，而森林生态系统中，生物硝化抑制剂的报道很少，一定程度上限制了对森林土壤硝化过程的认识。因此，未来研究要聚焦森林生态系统中的植物分泌哪些生物硝化抑制剂来促进氮素转化和减少氮素损失，及其作用机制。这对推动森林生态系统养分循环研究具有指导性意义。④气候变化下根系分泌物介导的森林生态系统氮素转化过程仍是未来研究的重点。森林生态系统中，大气CO2和气温升高的情况下，会导致根系分泌物分泌速率加强以加速氮素矿化[8-11]。但是，目前尚不清楚由于气候变化而导致的根系分泌速率增加如何影响氮转化的其他过程，例如硝化作用和反硝化作用等过程。

参考文献 (70)

目录

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  • 1.   模拟根系分泌物输入对森林土壤氮矿化的影响及其机制

  • 1.1.   碳输入对土壤氮矿化的影响及其机制

  • 1.1.1.   碳输入量及输入速率对土壤氮矿化的影响
  • 1.1.2.   碳输入对土壤氮矿化的影响机制

  • 1.2.   不同碳氮比的根系分泌物输入对氮矿化的影响及其机制

  • 1.2.1.   不同碳氮比的根系分泌物输入对氮矿化的影响
  • 1.2.2.   不同碳氮比的根系分泌物输入对氮矿化的影响机制

  • 1.3.   根系分泌物不同组分输入对氮矿化的影响及其机制

  • 2.   模拟根系分泌物输入对土壤硝化作用的影响及其机制

  • 2.1.   对土壤硝化作用的影响

  • 2.2.   对土壤硝化作用的影响机制

  • 3.   模拟根系分泌物输入对土壤反硝化作用的影响及其机制

  • 3.1.   对土壤反硝化作用的影响

  • 3.2.   对土壤反硝化作用的影响机制

  • 4.   展望

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