珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化

杨敬元; 熊丹; 梁宏伟; 王玉兵; 廖明尧; 陈发菊

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珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化

杨敬元 , 熊丹 , 梁宏伟 , 王玉兵 , 廖明尧 , 陈发菊

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杨敬元, 熊丹, 梁宏伟, 王玉兵, 廖明尧, 陈发菊. 珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2007, 24(3): 279-283.

引用本文:

杨敬元, 熊丹, 梁宏伟, 王玉兵, 廖明尧, 陈发菊. 珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2007, 24(3): 279-283.

YANG Jing-yuan, XIONG Dan, LIANG Hong-wei, WANG Yu-bing, LIAOMing-ya, CHEN Fa-ju. Optimal reaction system for random amplified polymorphic DNA with endangered Emmenopterys henryi[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2007, 24(3): 279-283.

Citation:

YANG Jing-yuan, XIONG Dan, LIANG Hong-wei, WANG Yu-bing, LIAOMing-ya, CHEN Fa-ju. Optimal reaction system for random amplified polymorphic DNA with endangered Emmenopterys henryi[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2007, 24(3): 279-283.

珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化

1.
湖北省神农架自然保护区管理局,湖北神农架442421;
2.
三峡大学生物技术中心-湖北省天然产物利用与研究重点实验室,湖北宜昌443002

基金项目:

湖北省宜昌市科学技术重点攻关项目(A06209)

详细信息

作者简介: 杨敬元,工程师,从事保护生物学研究。

通信作者: 陈发菊,副教授,从事植物发育生物学研究。

中图分类号: S718.4

Optimal reaction system for random amplified polymorphic DNA with endangered Emmenopterys henryi

1.
Administration of Shennongjia Nature Reserve, Shennongjia 442421, Hubei, China;
2.
Biotechnology ResearchCenter-Hubei Key Laboratory of Natural Products Use and Research, Three Gorges University, Yichang 443002, Hubei, China

Funds:

湖北省宜昌市科学技术重点攻关项目(A06209)

摘要: 以采自湖北省神农架地区的14株香果树Emmenopterys henryi为材料,提取其叶片基因组DNA,并以其基因组DNA为模板进行随机扩增多态性DNA(RAPD)反应条件的优化。RAPD反应条件中的各个因子,包括模板DNA质量浓度、引物浓度、dNTP浓度、DNA聚合酶浓度和Mg2+浓度。结果表明,香果树基因组DNA在以下条件有较好的扩增效果: 25L体系中, Taq酶1.33 10- 3 katL- 1;随机引物0.5molL- 1; Mg2+ 2.6 mmolL- 1; dNTP 220molL- 1; DNA模板4.40 mgL- 1。聚合酶链式反应(PCR)程序为: 94℃预变性5 min, 94℃变性1 min, 43℃退火1 min, 72℃延伸2 min,经过40个循环,最后72℃延伸8 min。此体系和反应程序可获得比较稳定的扩增结果。图6表1参8
- 植物学 /
- 香果树 /
- 基因组DNA /
- 随机扩增多态性DNA
Abstract: Genome DNA from leaves of the Emmenopterys henryi tree(Henry emmenopterys) in the Shennongjia area of Hubei Province, China, was extracted to optimize its random amplified polymorphic DNA(RAPD) reaction conditions, which included concentrations of DNA polymerase, primers, Mg2+,dNTP, and DNA.Resultsindicated that genome DNA of E. henryi had good amplification with the following conditions: 25L solutionwith 1.33 10- 3 katL- 1 Taq DNA polymerase, 0.5molL- 1 random primer, 2.6 mmolL- 1 Mg2+,220molL- 1 dNTP, and 4.40 mgL- 1 genomic DNA. The polymerase chain reaction(PCR) amplification programwas as follows: predenaturing at 94℃ for5 min, followed by 40 cycles of denaturing at 94℃ for1 min,annealing at 43℃ for 1 min, extension at 72℃ for 2 min, and final extension at 72℃ for 8 min. Such a system and reaction programs could achieve comparatively stable amplification.[Ch, 6 fig. 1 tab. 8 ref.]
- botany /
- Emmenopterys henryi(Henry emmenoterys) /
- genomic DNA /
- randomamplified polymorphic DNA(RAPD)

[1]	骆争荣, 郑伟成, 唐战胜, 蔡臣臣, 陈旭波, 郑子洪. 浙江九龙山香果树生境土壤微生物多样性及其影响因素 . 浙江农林大学学报, 2024, 41(5): 1013-1023. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230532
[2]	鲁亚萍, 周明兵. 转座子沉默与DNA甲基化 . 浙江农林大学学报, 2021, 38(3): 634-643. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20200338
[3]	王宁, 昌孝涛, 袁美丽, 陈浩. 香豆素对入侵植物节节麦种子萌发及幼苗生长的影响 . 浙江农林大学学报, 2019, 36(4): 835-840. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2019.04.025
[4]	黄笑宇, 许在恩, 郭小勤. 基于全基因组的毛竹同义密码子使用偏好性分析 . 浙江农林大学学报, 2017, 34(1): 120-128. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.01.017
[5]	辛建攀, 孙欣欣, 田如男. 南京将军山种子植物区系多样性及基本特征 . 浙江农林大学学报, 2017, 34(4): 629-636. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.04.008
[6]	朱致翔, 时浩杰, 雷飞斌, 张传清. 实时荧光定量PCR定量检测山核桃干腐病病菌潜伏侵染量方法的建立 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(2): 364-368. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.02.024
[7]	张梅, 刘利, 伊力塔. 辽宁白石砬子国家级自然保护区植物区系的多样性 . 浙江农林大学学报, 2014, 31(2): 210-216. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.02.008
[8]	马腾飞, 林新春. 植物SOC1/AGL20基因研究进展 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 930-937. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.019
[9]	姜晓玲, 黄秋娴, 李虹, 赵嘉平. 植物类甜蛋白基因家族研究进展 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(2): 279-287. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.02.019
[10]	张振, 张含国, 张磊, 朱航勇, 李雪峰. 兴安落叶松基本群体与育种群体RAPD多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(1): 130-136. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.022
[11]	田敏, 龚茂江, 徐小雁, 王彩霞. 兰科植物花发育的基因调控研究进展 . 浙江农林大学学报, 2011, 28(3): 494-499. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.023
[12]	马进, 刘志高, 郑钢. 差异蛋白质组学及其在植物盐胁迫响应研究中的应用 . 浙江农林大学学报, 2011, 28(1): 139-143. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.01.022
[13]	蓝云龙, 吴令上, 裘波音, 高燕会, 斯金平. 鱼腥草RAPD分子标记的多态性 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 309-313.
[14]	王祖良, 丁丽霞, 赵明水, 程晓渊, 沈乾. 濒危植物天目铁木遗传多样性的RAPD分析 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 304-308.
[15]	桂仁意, 金爱武, 高培军, 曹福亮. 银杏核糖体DNA内转录间隔序列初步分析 . 浙江农林大学学报, 2007, 24(1): 17-21.
[16]	阮秀春, 斯金平, 吴健, 黄文华, 郭宝林, 许元科. 雷公藤属植物生物学特性与生态适应性的初步研究 . 浙江农林大学学报, 2006, 23(5): 595-598.
[17]	谢一青, 李志真, 黄儒珠, 肖祥希, 王志洁. 光皮桦基因组DNA 提取方法比较 . 浙江农林大学学报, 2006, 23(6): 664-668.
[18]	杨毅, 周祖基, 张立钦, 马良进, 林新春, 高洁. 寄生松墨天牛的球孢白僵菌不同菌株DNA多态性的RAPD 分析 . 浙江农林大学学报, 2005, 22(3): 306-309.
[19]	雷日平, 陈辉, 谢利国. 锥栗不同品种遗传距离的RAPD 分析 . 浙江农林大学学报, 2002, 19(3): 240-243.
[20]	方伟, 何祯祥, 黄坚钦, 史钱均, 林新春. 雷竹不同栽培类型RAPD 分子标记的研究 . 浙江农林大学学报, 2001, 18(1): 1-5.

链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/id/1276

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珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化

1. 湖北省神农架自然保护区管理局,湖北神农架442421;

2. 三峡大学生物技术中心-湖北省天然产物利用与研究重点实验室,湖北宜昌443002

基金项目:

湖北省宜昌市科学技术重点攻关项目(A06209)

作者简介:
杨敬元,工程师,从事保护生物学研究。

通信作者: 陈发菊,副教授,从事植物发育生物学研究。

收稿日期: 2006-09-18
修回日期: 2006-12-12
刊出日期: 2007-06-20

中图分类号: S718.4

关键词:

摘要: 以采自湖北省神农架地区的14株香果树Emmenopterys henryi为材料,提取其叶片基因组DNA,并以其基因组DNA为模板进行随机扩增多态性DNA(RAPD)反应条件的优化。RAPD反应条件中的各个因子,包括模板DNA质量浓度、引物浓度、dNTP浓度、DNA聚合酶浓度和Mg2+浓度。结果表明,香果树基因组DNA在以下条件有较好的扩增效果: 25L体系中, Taq酶1.33 10- 3 katL- 1;随机引物0.5molL- 1; Mg2+ 2.6 mmolL- 1; dNTP 220molL- 1; DNA模板4.40 mgL- 1。聚合酶链式反应(PCR)程序为: 94℃预变性5 min, 94℃变性1 min, 43℃退火1 min, 72℃延伸2 min,经过40个循环,最后72℃延伸8 min。此体系和反应程序可获得比较稳定的扩增结果。图6表1参8

English Abstract

Optimal reaction system for random amplified polymorphic DNA with endangered Emmenopterys henryi

1. Administration of Shennongjia Nature Reserve, Shennongjia 442421, Hubei, China;

2. Biotechnology ResearchCenter-Hubei Key Laboratory of Natural Products Use and Research, Three Gorges University, Yichang 443002, Hubei, China

Funds:

湖北省宜昌市科学技术重点攻关项目(A06209)

Received Date: 2006-09-18
Rev Recd Date: 2006-12-12
Publish Date: 2007-06-20

Keywords:

botany /
Emmenopterys henryi(Henry emmenoterys) /
genomic DNA /
randomamplified polymorphic DNA(RAPD)

Abstract: Genome DNA from leaves of the Emmenopterys henryi tree(Henry emmenopterys) in the Shennongjia area of Hubei Province, China, was extracted to optimize its random amplified polymorphic DNA(RAPD) reaction conditions, which included concentrations of DNA polymerase, primers, Mg2+,dNTP, and DNA.Resultsindicated that genome DNA of E. henryi had good amplification with the following conditions: 25L solutionwith 1.33 10- 3 katL- 1 Taq DNA polymerase, 0.5molL- 1 random primer, 2.6 mmolL- 1 Mg2+,220molL- 1 dNTP, and 4.40 mgL- 1 genomic DNA. The polymerase chain reaction(PCR) amplification programwas as follows: predenaturing at 94℃ for5 min, followed by 40 cycles of denaturing at 94℃ for1 min,annealing at 43℃ for 1 min, extension at 72℃ for 2 min, and final extension at 72℃ for 8 min. Such a system and reaction programs could achieve comparatively stable amplification.[Ch, 6 fig. 1 tab. 8 ref.]

杨敬元, 熊丹, 梁宏伟, 王玉兵, 廖明尧, 陈发菊. 珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2007, 24(3): 279-283.

引用本文:

杨敬元, 熊丹, 梁宏伟, 王玉兵, 廖明尧, 陈发菊. 珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2007, 24(3): 279-283.

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作者简介: 杨敬元,工程师,从事保护生物学研究。

通信作者: 陈发菊,副教授,从事植物发育生物学研究。

Optimal reaction system for random amplified polymorphic DNA with endangered Emmenopterys henryi

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出版历程

珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化

1. 湖北省神农架自然保护区管理局,湖北神农架442421; 2. 三峡大学生物技术中心-湖北省天然产物利用与研究重点实验室,湖北宜昌443002

作者简介: 杨敬元,工程师,从事保护生物学研究。

通信作者: 陈发菊,副教授,从事植物发育生物学研究。

English Abstract

Optimal reaction system for random amplified polymorphic DNA with endangered Emmenopterys henryi

1. Administration of Shennongjia Nature Reserve, Shennongjia 442421, Hubei, China; 2. Biotechnology ResearchCenter-Hubei Key Laboratory of Natural Products Use and Research, Three Gorges University, Yichang 443002, Hubei, China

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1. 湖北省神农架自然保护区管理局,湖北神农架442421;

2. 三峡大学生物技术中心-湖北省天然产物利用与研究重点实验室,湖北宜昌443002

作者简介:
杨敬元,工程师,从事保护生物学研究。

1. Administration of Shennongjia Nature Reserve, Shennongjia 442421, Hubei, China;

2. Biotechnology ResearchCenter-Hubei Key Laboratory of Natural Products Use and Research, Three Gorges University, Yichang 443002, Hubei, China