山核桃MADS-like基因的克隆与分析

侯传明; 郑雅文; 王正加; 徐英武

doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005

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山核桃MADS-like基因的克隆与分析

侯传明 , 郑雅文 , 王正加 , 徐英武

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侯传明, 郑雅文, 王正加, 徐英武. 山核桃MADS-like基因的克隆与分析[J]. 浙江农林大学学报, 2015, 32(1): 33-39. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005

引用本文:

侯传明, 郑雅文, 王正加, 徐英武. 山核桃MADS-like基因的克隆与分析[J]. 浙江农林大学学报, 2015, 32(1): 33-39. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005

HOU Chuanming, ZHENG Yawen, WANG Zhengjia, XU Yingwu. Cloning and analysis of a MADS-like gene in Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2015, 32(1): 33-39. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005

Citation:

HOU Chuanming, ZHENG Yawen, WANG Zhengjia, XU Yingwu. Cloning and analysis of a MADS-like gene in Carya cathayensis[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2015, 32(1): 33-39. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005

山核桃MADS-like基因的克隆与分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005

1.
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江临安 311300

基金项目:

国家高技术研究发展计划（863计划）项目（2013AA102605）;国家重点基础研究发展计划（973计划）项目（2011CB111500）;国家自然科学基金资助项目（31170637）;浙江农林大学科研发展基金资助项目（2010FR072）

详细信息

通信作者: 徐英武，教授，博士，博士生导师，从事蛋白和药物结构生物学等研究。

中图分类号: S664.1；S722.3

Cloning and analysis of a MADS-like gene in Carya cathayensis

1.
The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture, Zhejiang A & F University, Lin’an 311300, Zhejiang, China

摘要: MADS-box基因在植物花发育的整个阶段起到了极为关键的作用。根据山核桃 Carya cathayensis 雌花芽454测序得到的基因片段，采用cDNA末端快速扩增（RACE）技术，获得了1条CcMADS-like基因。序列分析结果表明：CcMADS-like开放阅读框（ORF）长度为609 bp，编码202个氨基酸，具有典型的MADS-box结构域，包括高度保守的MADS盒和K区以及I区、C区。CcMADS-like与拟南芥Arabidopsis thaliana，金鱼草Antirrhinum majus，美洲黑杨Populus deltoides，欧洲大叶杨Populus trichocarpa等的同源基因所编码的蛋白质同源性分别达到48%，65%，69%，71%。山核桃不同组织实时荧光定量聚合酶链式反应（qRT-PCR）结果表明：CcMADS-like基因在花芽中表达量远远高于其他组织，暗示该基因极有可能参与山核桃成花发育。酵母单杂交实验表明，CcMADS-like蛋白具有转录激活活性。图5表1参25
- 经济林学 /
- 花发育 /
- 山核桃 /
- MADS-box /
- 基因克隆 /
- qRT-PCR /
- 酵母单杂交实验
Abstract: MADS-box family genes play key roles in all phases of floral development. Based on a partial fragment acquired from 454 sequencing of Carya cathayensis （hickory） floral buds, a full-length of a MADS-like gene was obtained by rapid amplification of cDNA ends （RACE）. Afterwards, a quantitative real-time （qRT） polymerase chain reaction （PCR） analysis, an amino acid sequence alignment, and a yeast one-hybrid assay were performed. Results of the sequence analysis revealed the open reading frame （ORF） of the CcMADS-like gene was 609 bp in length and encoded a protein of 202 aa. The protein presented typical characteristic of MADS-box family genes and contained MADS domain, I, K, and C, with the MADS domain was considerably conserved. The amino acid sequence alignment showed that the putative protein CcMADS-like gene had an identity to homologies of Arabidopsis thaliana （48%）, Antirrhinum majus （65%）, Populus deltoides （69%）, and Populus trichocarpa （71%）. The qRT-PCR analysis revealed that the expression level of CcMADS-like gene in flower buds was much higher than in other tissues. The yeast one-hybrid showed that the CcMADS-like gene had an activation activity as a transcription factor. Overall, the qRT-PCR analysis suggested that CcMADS-like gene possibly participated in floral development of hickory. ［Ch, 5 fig. 1 tab. 25 ref.］
- cash forestry /
- floral development /
- Carya cathayensis /
- MADS-box /
- gene clone /
- qRT-PCR /
- yeast one-hybrid

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链接本文:
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山核桃MADS-like基因的克隆与分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005

1. 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江临安 311300

基金项目:

通信作者: 徐英武，教授，博士，博士生导师，从事蛋白和药物结构生物学等研究。

收稿日期: 2014-03-10
修回日期: 2014-04-20
刊出日期: 2015-02-20

中图分类号: S664.1；S722.3

关键词:

摘要: MADS-box基因在植物花发育的整个阶段起到了极为关键的作用。根据山核桃 Carya cathayensis 雌花芽454测序得到的基因片段，采用cDNA末端快速扩增（RACE）技术，获得了1条CcMADS-like基因。序列分析结果表明：CcMADS-like开放阅读框（ORF）长度为609 bp，编码202个氨基酸，具有典型的MADS-box结构域，包括高度保守的MADS盒和K区以及I区、C区。CcMADS-like与拟南芥Arabidopsis thaliana，金鱼草Antirrhinum majus，美洲黑杨Populus deltoides，欧洲大叶杨Populus trichocarpa等的同源基因所编码的蛋白质同源性分别达到48%，65%，69%，71%。山核桃不同组织实时荧光定量聚合酶链式反应（qRT-PCR）结果表明：CcMADS-like基因在花芽中表达量远远高于其他组织，暗示该基因极有可能参与山核桃成花发育。酵母单杂交实验表明，CcMADS-like蛋白具有转录激活活性。图5表1参25

English Abstract

Cloning and analysis of a MADS-like gene in Carya cathayensis

1. The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture, Zhejiang A & F University, Lin’an 311300, Zhejiang, China

Received Date: 2014-03-10
Rev Recd Date: 2014-04-20
Publish Date: 2015-02-20

Keywords:

Abstract: MADS-box family genes play key roles in all phases of floral development. Based on a partial fragment acquired from 454 sequencing of Carya cathayensis （hickory） floral buds, a full-length of a MADS-like gene was obtained by rapid amplification of cDNA ends （RACE）. Afterwards, a quantitative real-time （qRT） polymerase chain reaction （PCR） analysis, an amino acid sequence alignment, and a yeast one-hybrid assay were performed. Results of the sequence analysis revealed the open reading frame （ORF） of the CcMADS-like gene was 609 bp in length and encoded a protein of 202 aa. The protein presented typical characteristic of MADS-box family genes and contained MADS domain, I, K, and C, with the MADS domain was considerably conserved. The amino acid sequence alignment showed that the putative protein CcMADS-like gene had an identity to homologies of Arabidopsis thaliana （48%）, Antirrhinum majus （65%）, Populus deltoides （69%）, and Populus trichocarpa （71%）. The qRT-PCR analysis revealed that the expression level of CcMADS-like gene in flower buds was much higher than in other tissues. The yeast one-hybrid showed that the CcMADS-like gene had an activation activity as a transcription factor. Overall, the qRT-PCR analysis suggested that CcMADS-like gene possibly participated in floral development of hickory. ［Ch, 5 fig. 1 tab. 25 ref.］

侯传明, 郑雅文, 王正加, 徐英武. 山核桃MADS-like基因的克隆与分析[J]. 浙江农林大学学报, 2015, 32(1): 33-39. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005

引用本文:

侯传明, 郑雅文, 王正加, 徐英武. 山核桃MADS-like基因的克隆与分析[J]. 浙江农林大学学报, 2015, 32(1): 33-39. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.005