新高系梨9个品种SSR 标记分析

莫文娟; 袁德义; 段经华; 邹锋

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新高系梨9个品种SSR 标记分析

莫文娟 , 袁德义 , 段经华 , 邹锋

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莫文娟, 袁德义, 段经华, 邹锋. 新高系梨9个品种SSR 标记分析[J]. 浙江农林大学学报, 2009, 26(5): 639-643.

引用本文:

莫文娟, 袁德义, 段经华, 邹锋. 新高系梨9个品种SSR 标记分析[J]. 浙江农林大学学报, 2009, 26(5): 639-643.

MO Wen-juan, YUAN De-yi, DUAN Jing-hua, ZOU Feng. Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2009, 26(5): 639-643.

Citation:

MO Wen-juan, YUAN De-yi, DUAN Jing-hua, ZOU Feng. Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2009, 26(5): 639-643.

新高系梨9个品种SSR 标记分析

1.
中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室，湖南长沙 410004;
2.
中国林业科学研究院经济林研究开发中心，河南郑州 450003

详细信息

通信作者: 袁德义

Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line

1.
The Key Laboratory of Non-wood Forestry Product of State Forestry Administration，Central South Forestry & Technology University，Changsha 410004，Hunan，China;
2.
Non-timber Research and Development Center，The Chinese Academy of Forestry，Zhengzhou 450003，Henan，China

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Corresponding author: YUAN De-yi

摘要: 为了有效区分和利用亲缘关系较近的新高系梨品种，利用简单序列重复（SSR）分子标记技术对新高系梨9个品种进行了多态性分析、遗传相似性和聚类分析。从12对引物中筛选出3对多态性高、分辨能力强的引物，在供试材料中共扩增出22条带，其中多态性带22条，多态性达100%；每对引物扩增出的条带数4 ～ 9条不等，平均为7.3条；且这3对引物组合可以成功地区分全部供试品种。9份材料之间遗传相似系数变化范围为0.47 ～ 0.91，平均值为0.67，揭示出它们的遗传基础相对比较狭窄。加权成组配对法（UPGMA）聚类分析结果表明，供试材料可以分为3个组和2个亚组，其中新高Pyrus pyrifolia ‘Niitaka’和黄金‘Whangkeum Bae’，大果水晶‘Sujeong’和华丰‘Huafeng’的相似系数最大，为0.91，说明其亲缘关系最近；天皇‘Yewang’和鲜黄‘Sunhwang’分别单独聚为一类，并对其结果的原因进行了初步探讨。图3表3参17
- 园艺学 /
- 新高系梨 /
- 简单重复序列（SSR） /
- 亲缘关系 /
- 聚类分析
Abstract: In order to efficiently distinguish and use pear cultivars come of Pyrus pyrifolia ‘Niitaka’with a near genetic relationship，the polymorphism and cluster analysis based on genetic similarity matrices of simple sequence repeat（SSR） markers were used on nine cultivars. Results showed that 3 pairs of SSR primes（KA4b，NH013a and CH02D11） produced 22 amplified fragments of which 22（100%） were polymorphic. The average number of alleles per SSR locus was 7.3 with a range from 4 to 9. Using these 3 sets of SSR primers could discriminate 9 cultivars in the study. Also，the genetic similarity coefficients among the 9 cultivars ranged from 0.47 to 0.91 with an average of 0.67，which indicated that the genetic relationships were close between them. The UPGMA cluster analysis showed that the 9 cultivars could be divided into 3 groups and 2 sub-groups. The closest relationship was ‘Niitaka’，‘Whangkeum Bae’，‘Sujeong’，and ‘Huafeng’，whose genetic similarity coefficient is 0.91，while ‘Yewang’ and ‘Sunhwang’ were highly divergent from the other cultivars. ［Ch，3 fig. 3 tab. 17 ref.］
- horticulture /
- pear cultivars in Niitaka line /
- simple sequence repeat（SSR） /
- genetic relationship /
- cluster analysis

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https://zlxb.zafu.edu.cn/article/id/490

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新高系梨9个品种SSR 标记分析

1. 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室，湖南长沙 410004;

2. 中国林业科学研究院经济林研究开发中心，河南郑州 450003

通信作者: 袁德义

刊出日期: 2009-10-20

关键词:

摘要: 为了有效区分和利用亲缘关系较近的新高系梨品种，利用简单序列重复（SSR）分子标记技术对新高系梨9个品种进行了多态性分析、遗传相似性和聚类分析。从12对引物中筛选出3对多态性高、分辨能力强的引物，在供试材料中共扩增出22条带，其中多态性带22条，多态性达100%；每对引物扩增出的条带数4 ～ 9条不等，平均为7.3条；且这3对引物组合可以成功地区分全部供试品种。9份材料之间遗传相似系数变化范围为0.47 ～ 0.91，平均值为0.67，揭示出它们的遗传基础相对比较狭窄。加权成组配对法（UPGMA）聚类分析结果表明，供试材料可以分为3个组和2个亚组，其中新高Pyrus pyrifolia ‘Niitaka’和黄金‘Whangkeum Bae’，大果水晶‘Sujeong’和华丰‘Huafeng’的相似系数最大，为0.91，说明其亲缘关系最近；天皇‘Yewang’和鲜黄‘Sunhwang’分别单独聚为一类，并对其结果的原因进行了初步探讨。图3表3参17

English Abstract

Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line

1. The Key Laboratory of Non-wood Forestry Product of State Forestry Administration，Central South Forestry & Technology University，Changsha 410004，Hunan，China;

2. Non-timber Research and Development Center，The Chinese Academy of Forestry，Zhengzhou 450003，Henan，China

Corresponding author: YUAN De-yi

Publish Date: 2009-10-20

Keywords:

Abstract: In order to efficiently distinguish and use pear cultivars come of Pyrus pyrifolia ‘Niitaka’with a near genetic relationship，the polymorphism and cluster analysis based on genetic similarity matrices of simple sequence repeat（SSR） markers were used on nine cultivars. Results showed that 3 pairs of SSR primes（KA4b，NH013a and CH02D11） produced 22 amplified fragments of which 22（100%） were polymorphic. The average number of alleles per SSR locus was 7.3 with a range from 4 to 9. Using these 3 sets of SSR primers could discriminate 9 cultivars in the study. Also，the genetic similarity coefficients among the 9 cultivars ranged from 0.47 to 0.91 with an average of 0.67，which indicated that the genetic relationships were close between them. The UPGMA cluster analysis showed that the 9 cultivars could be divided into 3 groups and 2 sub-groups. The closest relationship was ‘Niitaka’，‘Whangkeum Bae’，‘Sujeong’，and ‘Huafeng’，whose genetic similarity coefficient is 0.91，while ‘Yewang’ and ‘Sunhwang’ were highly divergent from the other cultivars. ［Ch，3 fig. 3 tab. 17 ref.］

莫文娟, 袁德义, 段经华, 邹锋. 新高系梨9个品种SSR 标记分析[J]. 浙江农林大学学报, 2009, 26(5): 639-643.

引用本文:

莫文娟, 袁德义, 段经华, 邹锋. 新高系梨9个品种SSR 标记分析[J]. 浙江农林大学学报, 2009, 26(5): 639-643.

MO Wen-juan, YUAN De-yi, DUAN Jing-hua, ZOU Feng. Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2009, 26(5): 639-643.

Citation:

MO Wen-juan, YUAN De-yi, DUAN Jing-hua, ZOU Feng. Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2009, 26(5): 639-643.