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西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析

吴月燕 陶巧静 李波 许丹叶

吴月燕, 陶巧静, 李波, 许丹叶. 西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
引用本文: 吴月燕, 陶巧静, 李波, 许丹叶. 西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
WU Yueyan, TAO Qiaojing, LI Bo, XU Danye. An optimal SRAP-PCR system of Rhododendron hybridum and its genetic diversity analysis with SRAP marker[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
Citation: WU Yueyan, TAO Qiaojing, LI Bo, XU Danye. An optimal SRAP-PCR system of Rhododendron hybridum and its genetic diversity analysis with SRAP marker[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007

西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
基金项目: 

浙江省重大科技专项重点农业项目(2009C12092);宁波市科技创新创业重点项目(2010C92021)

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    通信作者: 吴月燕

An optimal SRAP-PCR system of Rhododendron hybridum and its genetic diversity analysis with SRAP marker

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    Corresponding author: WU Yueyan
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出版历程
  • 收稿日期:  2012-11-14
  • 修回日期:  2013-05-22
  • 刊出日期:  2013-12-20

西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
    基金项目:

    浙江省重大科技专项重点农业项目(2009C12092);宁波市科技创新创业重点项目(2010C92021)

    通信作者: 吴月燕

摘要: 以西洋杜鹃Rhododendron hybridum功能叶片为试验材料,采用改良的十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取西洋杜鹃基因组DNA,并且运用L16(44)正交试验设计,在4个水平上对影响西洋杜鹃相关序列扩增多态性(SRAP)反应的镁离子(Mg2+)浓度、Taq酶用量、三磷酸碱基脱氧核苷酸(dNTPs)浓度、引物浓度等4个因素进行了优化,确立了一套适用于西洋杜鹃的稳定可靠、重复性强的SRAP?鄄PCR反应体系。实验发现,其最佳反应体系(20.0 L)为:Mg2+浓度1.750 mmolL-1,dNTPs浓度 0.175 mmolL-1,Taq酶1.500 16.67 nkat,引物0.200 molL-1。利用该优化体系对24个西洋杜鹃花品种进行遗传多样性分析。从88对SRAP引物中筛选出10对扩增清晰且多态性高的引物,共扩增出217条带,其中多态性条带212条,多态性比率达97.35%。24个杜鹃品种的遗传相似系数变化范围为0.591~0.708,算术平均数的非加权配对算术平均法(UPGMA)聚类分析结果显示:在相似系数为0.590处将24个供试品种分为2个类群,在相似系数为0.623处又可分为2个亚群,说明该优化体系可应用于西洋杜鹃花品种鉴定及遗传多样性的研究。图3表6参19

English Abstract

吴月燕, 陶巧静, 李波, 许丹叶. 西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
引用本文: 吴月燕, 陶巧静, 李波, 许丹叶. 西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
WU Yueyan, TAO Qiaojing, LI Bo, XU Danye. An optimal SRAP-PCR system of Rhododendron hybridum and its genetic diversity analysis with SRAP marker[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
Citation: WU Yueyan, TAO Qiaojing, LI Bo, XU Danye. An optimal SRAP-PCR system of Rhododendron hybridum and its genetic diversity analysis with SRAP marker[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007

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