甜槠ISSR-PCR 反应体系的正交优化

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

甜槠ISSR-PCR 反应体系的正交优化

张文标 , 金则新 , 李钧敏 , 潘冠琼

文章导航 > 浙江农林大学学报 > 2006 > 23(5): 516-520

张文标, 金则新, 李钧敏, 潘冠琼. 甜槠ISSR-PCR 反应体系的正交优化[J]. 浙江农林大学学报, 2006, 23(5): 516-520.

引用本文:

张文标, 金则新, 李钧敏, 潘冠琼. 甜槠ISSR-PCR 反应体系的正交优化[J]. 浙江农林大学学报, 2006, 23(5): 516-520.

ZHANG Wen-biao, JIN Ze-xin, LI Jun-min, PAN Guan-qiong. Optimization of ISSR-PCR reaction system of Castanopsis eyrei by orthogonal design[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2006, 23(5): 516-520.

Citation:

ZHANG Wen-biao, JIN Ze-xin, LI Jun-min, PAN Guan-qiong. Optimization of ISSR-PCR reaction system of Castanopsis eyrei by orthogonal design[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2006, 23(5): 516-520.

甜槠ISSR-PCR 反应体系的正交优化

张文标^1,2, ,,
金则新^2, ,,
李钧敏²,
潘冠琼²

1.
西南师范大学三峡库区生态环境教育部重点实验室, 重庆400715;
2.
台州学院生态研究所, 浙江临海317000

基金项目:

浙江省自然科学基金资助项目(Y504220)

作者简介: 张文标, 硕士研究生, 从事植物生态学研究。E-mail :zhangwb0918@hotmail.com 。通讯作者:金则新, 教授, 硕士, 从事植物生态学研究。E-mail:jzx @tzc.edu.cn ;张文标, 硕士研究生, 从事植物生态学研究。E-mail :zhangwb0918@hotmail.com 。通讯作者:金则新, 教授, 硕士, 从事植物生态学研究。E-mail:jzx @tzc.edu.cn

通信作者: 张文标, 硕士研究生, 从事植物生态学研究。通讯作者:金则新,教授, 硕士, 从事植物生态学研究。; 张文标, 硕士研究生, 从事植物生态学研究。通讯作者:金则新,教授, 硕士, 从事植物生态学研究。

中图分类号: Q946 ;S792.17

Optimization of ISSR-PCR reaction system of Castanopsis eyrei by orthogonal design

1.
Key Laboratory of the Three Gorge Reservoir Regions Eco-Environment of Ministry of Education, Southwest China Normal University , Chongqing 400715 , China;
2.
Institute of Ecology , Taizhou University , Linhai 317000 , Zhejiang , China

Funds:

浙江省自然科学基金资助项目(Y504220)

摘要: 对甜槠Castanopsis eyrei 进行遗传多样性研究的过程中, 为了获得清晰可靠、重复性强的ISSR 扩增结果, 利用正交设计对Mg 2+ , dNTP , 引物, Taq 酶, 牛血清蛋白(BSA )和模板DNA 等6 种因素5 个水平进行筛选和优化。确定甜槠ISSR-PCR 最适宜反应体系为:10 L 反应体中, 1 Taq 酶配套缓冲液(10 mmolL-1 Tris-HCl , pH 9.0 , 50 mmolL-1 KCl , 10 gL-1 TritonX-100), 1.7 mmolL-1 Mg 2+ , 0.25 mmolL-1 dNTP , 8.34 nkat Taq DNA 聚合酶, 1.5 gL-1牛血清白蛋白, 6 pmol 引物, 12 ng 模板DNA 。甜槠扩增时引物UBC846 的最适退火温度为56.3 ℃。图2 表1 参23
- 植物学 /
- ISSR-PCR /
- 正交设计 /
- 0优化 /
- 甜槠
Abstract: Obtaining the stable and repeatable ISSR-PCR amplification result is the basic work to study genetic diversity of Castanopsis eyrei .The ISSR-PCR amplification system was optimized by using orthogonal design in six factors and five levels (Mg2 + , dNTP , primer , Taq DNA polymerase , bovine serum albumin and template DNA).The suitable reaction conditions of ISSR-PCR were shown as follows :1 Taq buffer (10 mmolL-1 Tris-HCl , pH 9.0 , 50 mmolL-1 KCl , 10 gL-1 TritonX-100), 1.7 mmolL-1 Mg 2+ , 0.25 mmolL-1 dNTP , 8.34 nkat Taq DNA polymerase , 1.5 gL-1 bovine serum albumin , 6 pmol primer , 12 ng template DNA in 10 L reaction volume .The optimal annealing temperature for primer UBC 846 was 56.3 ℃.[ Ch , 2 fig .1 tab .23 ref .]
- botany /
- ISSR-PCR /
- orthogonal design /
- optimization /
- Castanopsis eyrei

[1]	何自强, 张惠玲, 杨正雄. 响应面优化超声波辅助[Bmim]Cl-K₂HPO₄双水相提取黄秋葵多糖 . 浙江农林大学学报, 2020, 37(3): 547-555. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20190339
[2]	张洁, 尹德洁, 关海燕, 屈琦琦, 董丽. 景天属植物研究综述 . 浙江农林大学学报, 2018, 35(6): 1166-1176. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.06.022
[3]	崔静, 吴记贵, 黄伯高, 蒋万杰, 范雅倩, 程瑾. 兰科植物的生殖隔离 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(4): 695-702. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.04.020
[4]	田风光, 何颖飞, 段承俐. 七叶一枝花ISSR-PCR反应体系的建立 . 浙江农林大学学报, 2014, 31(6): 983-989. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.06.023
[5]	陈芳, 张广群, 崔坤鹏, 汪杭军. 嵌入式植物自动识别系统的设计与实现 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(3): 379-384. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.03.012
[6]	武冲, 仲崇禄, 张勇, 姜清彬, 陈羽, 陈珍. 麻楝ISSR-PCR反应体系的建立及优化 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(4): 620-626. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.024
[7]	吴月燕, 陶巧静, 李波, 许丹叶. 西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
[8]	姜小凤, 高燕会, 童再康, 黄春红. 石蒜属植物SCoT-PCR反应体系构建及优化 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(3): 444-452. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.03.023
[9]	姜晓玲, 黄秋娴, 李虹, 赵嘉平. 植物类甜蛋白基因家族研究进展 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(2): 279-287. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.02.019
[10]	陈争, 姜小凤, 童再康. 光皮桦EST-SSR PCR反应体系的优化 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(6): 960-965. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.06.023
[11]	高航洋, 张启香, 胡恒康, 张振茹, 黄坚钦. 天目杜鹃组培苗生根培养体系的优化 . 浙江农林大学学报, 2011, 28(6): 982-985. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.06.024
[12]	叶生月, 陈钢, 张慧, 刘建杰, 曾燕如, 吴慧敏. 香榧ISSR-PCR扩增条件的优化和引物筛选 . 浙江农林大学学报, 2010, 27(1): 87-92. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.01.014
[13]	顾翠花, 王守先, 张启翔. 我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 298-303.
[14]	曹福亮, 王国霞, 李广平, 花喆斌. 银杏ISSR-PCR扩增反应体系的优化 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(2): 186-190.
[15]	杨敬元, 熊丹, 梁宏伟, 王玉兵, 廖明尧, 陈发菊. 珍稀濒危植物香果树RAPD反应条件的优化 . 浙江农林大学学报, 2007, 24(3): 279-283.
[16]	张雷凡, 高燕会, 朱玉球, 刘志高, 童再康, 黄华宏. 石蒜属植物种质资源ISSR-PCR反应体系的建立 . 浙江农林大学学报, 2007, 24(2): 156-161.
[17]	杨萍, 郑前剑, 赵明水, 汤定钦. 柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化 . 浙江农林大学学报, 2006, 23(1): 52-55.
[18]	林新春, 俞志雄. 木兰科植物的叶表皮特征及其分类学意义 . 浙江农林大学学报, 2004, 21(1): 33-39.
[19]	王国良. 福建龙栖山甜槠林恢复生态学研究(Ⅰ) . 浙江农林大学学报, 2002, 19(4): 363-366.
[20]	毕丽君. 香椿嫩叶中黄酮类化合物的提取 . 浙江农林大学学报, 2000, 17(2): 146-149.

链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/id/1476

https://zlxb.zafu.edu.cn/article/zjnldxxb/2006/5/516

WeChat

点击查看大图

计量

文章访问数: 1460
HTML全文浏览量: 221
PDF下载量: 254
被引次数: 0

甜槠ISSR-PCR 反应体系的正交优化

1. 西南师范大学三峡库区生态环境教育部重点实验室, 重庆400715;

2. 台州学院生态研究所, 浙江临海317000

基金项目:

浙江省自然科学基金资助项目(Y504220)

作者简介:
张文标, 硕士研究生, 从事植物生态学研究。E-mail :zhangwb0918@hotmail.com 。通讯作者:金则新, 教授, 硕士, 从事植物生态学研究。E-mail:jzx @tzc.edu.cn

张文标, 硕士研究生, 从事植物生态学研究。E-mail :zhangwb0918@hotmail.com 。通讯作者:金则新, 教授, 硕士, 从事植物生态学研究。E-mail:jzx @tzc.edu.cn

通信作者: 张文标, 硕士研究生, 从事植物生态学研究。通讯作者:金则新,教授, 硕士, 从事植物生态学研究。; 张文标, 硕士研究生, 从事植物生态学研究。通讯作者:金则新,教授, 硕士, 从事植物生态学研究。

收稿日期: 2005-10-31
修回日期: 2006-05-15
刊出日期: 2006-10-20

中图分类号: Q946 ;S792.17

关键词:

摘要: 对甜槠Castanopsis eyrei 进行遗传多样性研究的过程中, 为了获得清晰可靠、重复性强的ISSR 扩增结果, 利用正交设计对Mg 2+ , dNTP , 引物, Taq 酶, 牛血清蛋白(BSA )和模板DNA 等6 种因素5 个水平进行筛选和优化。确定甜槠ISSR-PCR 最适宜反应体系为:10 L 反应体中, 1 Taq 酶配套缓冲液(10 mmolL-1 Tris-HCl , pH 9.0 , 50 mmolL-1 KCl , 10 gL-1 TritonX-100), 1.7 mmolL-1 Mg 2+ , 0.25 mmolL-1 dNTP , 8.34 nkat Taq DNA 聚合酶, 1.5 gL-1牛血清白蛋白, 6 pmol 引物, 12 ng 模板DNA 。甜槠扩增时引物UBC846 的最适退火温度为56.3 ℃。图2 表1 参23

English Abstract

张文标, 金则新, 李钧敏, 潘冠琼. 甜槠ISSR-PCR 反应体系的正交优化[J]. 浙江农林大学学报, 2006, 23(5): 516-520.

引用本文:

张文标, 金则新, 李钧敏, 潘冠琼. 甜槠ISSR-PCR 反应体系的正交优化[J]. 浙江农林大学学报, 2006, 23(5): 516-520.

ZHANG Wen-biao, JIN Ze-xin, LI Jun-min, PAN Guan-qiong. Optimization of ISSR-PCR reaction system of Castanopsis eyrei by orthogonal design[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2006, 23(5): 516-520.

Citation:

ZHANG Wen-biao, JIN Ze-xin, LI Jun-min, PAN Guan-qiong. Optimization of ISSR-PCR reaction system of Castanopsis eyrei by orthogonal design[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2006, 23(5): 516-520.

全文HTML

/

下载: 全尺寸图片幻灯片

分享

用微信扫码二维码

分享至好友和朋友圈

返回