通直型巨龙竹不同地理种源遗传分化的ISSR分析

杨汉奇; 阮桢媛; 田波; 杨宇明; 孙茂盛

doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2010.01.013

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通直型巨龙竹不同地理种源遗传分化的ISSR分析

杨汉奇 , 阮桢媛 , 田波 , 杨宇明 , 孙茂盛

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杨汉奇, 阮桢媛, 田波, 杨宇明, 孙茂盛. 通直型巨龙竹不同地理种源遗传分化的ISSR分析[J]. 浙江农林大学学报, 2010, 27(1): 81-86. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.01.013

引用本文:

YANG Han-qi, RUAN Zhen-yuan, TIAN Bo, YANG Yu-ming, SUN Mao-sheng. Genetic differentiation of four straight-culmed provenances of Dendrocalamus sinicus based on ISSRs[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2010, 27(1): 81-86. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.01.013

Citation:

YANG Han-qi, RUAN Zhen-yuan, TIAN Bo, YANG Yu-ming, SUN Mao-sheng. Genetic differentiation of four straight-culmed provenances of Dendrocalamus sinicus based on ISSRs[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2010, 27(1): 81-86. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.01.013

通直型巨龙竹不同地理种源遗传分化的ISSR分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.01.013

1.
中国林业科学研究院资源昆虫研究所，云南昆明 650224;
2.
西南林学院资源学院，云南昆明 650224;
3.
中国科学院西双版纳热带植物园昆明分部，云南昆明 650223

详细信息

通信作者: 田波

Genetic differentiation of four straight-culmed provenances of Dendrocalamus sinicus based on ISSRs

1.
Research Institute of Resource Insects，The Chinese Academy of Forestry，Kunming 650224，Yunnan，China;
2.
School of Resources，Southwest Forestry College，Kunming 650224，Yunnan，China;
3.
Xishuangbanna Tropical Botanical Garden，Chinese Academy of Sciences，Kunming 650223，Yunnan，China

More Information

Corresponding author: TIAN Bo

摘要: 通直型巨龙竹Dendrocalamus sinicus是云南重要的经济竹种资源之一。为了保护和开发通直型巨龙竹种质资源，应用简单序列重复区间扩增（ISSR）标记对通直型巨龙竹核心分布区不同地理种源的遗传变异进行了研究。从80个引物中筛选出7个用于正式扩增，在所研究的4个居群共54个个体中检测到54个多态位点。在居群水平上，多态位点百分率为9.59%，Neis基因多样性指数（H）和Shannon信息指数（I）分别为0.036 3和0.053 6；在物种水平上，多态位点百分率为73.97%，H和I分别为0.260 0和0.392 1。居群间的遗传分化系数（Gst）达0.863 4，显示不同居群间遗传分化很大。造成通直型巨龙竹不同地理种源遗传分化的主要原因可能是生境片断化和自然条件下花而不实造成的种子传播困难。图4表4参21
- 林木育种学 /
- 巨龙竹 /
- 遗传分化 /
- 简单序列重复区间扩增
Abstract: The straight-culmed type of Dendrocalamus sinicus is one of the most important economic bamboo resources in Yunnan Province，China. To protect and develop native germplasm resources of the straight-culmed D. sinicus in Yunnan，the genetic diversity of four straight-culmed provenances of D. sinicus was analyzed based on inter-simple sequence repeat（ISSR） markers for percentage of polymorphic bands（PPB），Neis gene diversity（H），Shannons information index（I） and Neis coefficient of genetic differentiation（Gst）. Results showed seven informative and reliable primers with 54 polymorphic loci that were chosen from 80 pre-screened primers. At the population level，PPB was 9.59%，H was 0.036 3，and I was 0.053 6；whereas at the species level，PPB was 73.97%，H was 0.260 0 and I was 0.3921. Also，Gst was 0.863 4. Gst indicated a high degree of genetic differentiation among straight-culmed D. sinicus provenances most likely due to habitat fragmentation and flowering without seed.［Ch，4 fig. 4 tab. 21 ref.］
- forest tree breeding /
- Dendrocalamus sinicus /
- genetic differentiation /
- inter-simple sequence repeat（ISSR）

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链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/doi/10.11833/j.issn.2095-0756.2010.01.013

https://zlxb.zafu.edu.cn/article/zjnldxxb/2010/1/81

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通直型巨龙竹不同地理种源遗传分化的ISSR分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.01.013

1. 中国林业科学研究院资源昆虫研究所，云南昆明 650224;

2. 西南林学院资源学院，云南昆明 650224;

3. 中国科学院西双版纳热带植物园昆明分部，云南昆明 650223

通信作者: 田波

刊出日期: 2010-02-20

关键词:

摘要: 通直型巨龙竹Dendrocalamus sinicus是云南重要的经济竹种资源之一。为了保护和开发通直型巨龙竹种质资源，应用简单序列重复区间扩增（ISSR）标记对通直型巨龙竹核心分布区不同地理种源的遗传变异进行了研究。从80个引物中筛选出7个用于正式扩增，在所研究的4个居群共54个个体中检测到54个多态位点。在居群水平上，多态位点百分率为9.59%，Neis基因多样性指数（H）和Shannon信息指数（I）分别为0.036 3和0.053 6；在物种水平上，多态位点百分率为73.97%，H和I分别为0.260 0和0.392 1。居群间的遗传分化系数（Gst）达0.863 4，显示不同居群间遗传分化很大。造成通直型巨龙竹不同地理种源遗传分化的主要原因可能是生境片断化和自然条件下花而不实造成的种子传播困难。图4表4参21

English Abstract

Genetic differentiation of four straight-culmed provenances of Dendrocalamus sinicus based on ISSRs

1. Research Institute of Resource Insects，The Chinese Academy of Forestry，Kunming 650224，Yunnan，China;

2. School of Resources，Southwest Forestry College，Kunming 650224，Yunnan，China;

3. Xishuangbanna Tropical Botanical Garden，Chinese Academy of Sciences，Kunming 650223，Yunnan，China

Corresponding author: TIAN Bo

Publish Date: 2010-02-20

Keywords:

Abstract: The straight-culmed type of Dendrocalamus sinicus is one of the most important economic bamboo resources in Yunnan Province，China. To protect and develop native germplasm resources of the straight-culmed D. sinicus in Yunnan，the genetic diversity of four straight-culmed provenances of D. sinicus was analyzed based on inter-simple sequence repeat（ISSR） markers for percentage of polymorphic bands（PPB），Neis gene diversity（H），Shannons information index（I） and Neis coefficient of genetic differentiation（Gst）. Results showed seven informative and reliable primers with 54 polymorphic loci that were chosen from 80 pre-screened primers. At the population level，PPB was 9.59%，H was 0.036 3，and I was 0.053 6；whereas at the species level，PPB was 73.97%，H was 0.260 0 and I was 0.3921. Also，Gst was 0.863 4. Gst indicated a high degree of genetic differentiation among straight-culmed D. sinicus provenances most likely due to habitat fragmentation and flowering without seed.［Ch，4 fig. 4 tab. 21 ref.］

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