基于克隆文库筛选的池设计

管宇

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基于克隆文库筛选的池设计

管宇

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管宇. 基于克隆文库筛选的池设计[J]. 浙江农林大学学报, 2007, 24(1): 105-109.

引用本文:

管宇. 基于克隆文库筛选的池设计[J]. 浙江农林大学学报, 2007, 24(1): 105-109.

GUAN Yu. Pooling designs based on clone library screenings[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2007, 24(1): 105-109.

Citation:

GUAN Yu. Pooling designs based on clone library screenings[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2007, 24(1): 105-109.

基于克隆文库筛选的池设计

管宇^,

1.
浙江林学院理学院,浙江临安311300

基金项目:

浙江省自然科学基金资助项目(Y104420);浙江省教育厅资助项目(20040507)

详细信息

作者简介: 管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。

通信作者: 管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。

中图分类号: O157.2; S11+ 9

Pooling designs based on clone library screenings

GUAN Yu^,

1.
School of Science, Zhejiang Forestry College, Linan 311300, Zhejiang, China

Funds:

浙江省自然科学基金资助项目(Y104420);浙江省教育厅资助项目(20040507)

摘要: 池设计(pooling design)是基于克隆文库筛选(clone library screening)的一种实验设计,要求从大量的克隆体中筛选出其中含有某组特定核苷酸串的克隆体,它属于组合群试。一个池设计方案用一个二元关联矩阵(称为分离矩阵)表示,行对应于试验,列对应于克隆集合的体;考虑到生物实验存在误差,分离矩阵还需要有查错和纠错能力。利用子集或子空间之间的包含关系可以构建出分离矩阵,它的每行和每列中元素1的个数分别都一样,但试验总次数即行数明显大于信息下界。参13
- 克隆文库 /
- 池设计 /
- 群试 /
- 分离矩阵 /
- 信息界
Abstract: A pooling design based on clone library screenings is an experimental strategy to find cloneswith special nucleotide strings; it is also an algorithm of combinatorial group testing.A binary conjunctional matrix, sometimes called a disjunctmatrix, with a row corresponding to an experiment and a column to a clone, is usually used to represent the pooling design. Since errors exist during biological experiments, a disjunct matrix should have detecting and correcting capabilities.Utilizing the inclusion relationship between two subsets or subspaces, disjunct matrices with the same numberof elements 1 in each rowand columnwere constructed.However, the experimental number of elementswas greater than the lower bound of information.[Ch, 13 ref.]
- clone library /
- pooling design /
- group testing /
- disjunctmatrix /
- bound of information

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链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/id/1244

https://zlxb.zafu.edu.cn/article/zjnldxxb/2007/1/105

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基于克隆文库筛选的池设计

管宇^,

1. 浙江林学院理学院,浙江临安311300

基金项目:

浙江省自然科学基金资助项目(Y104420);浙江省教育厅资助项目(20040507)

作者简介:
管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。

通信作者: 管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。

收稿日期: 2006-02-18
修回日期: 2006-05-22
刊出日期: 2007-02-20

中图分类号: O157.2; S11+ 9

关键词:

摘要: 池设计(pooling design)是基于克隆文库筛选(clone library screening)的一种实验设计,要求从大量的克隆体中筛选出其中含有某组特定核苷酸串的克隆体,它属于组合群试。一个池设计方案用一个二元关联矩阵(称为分离矩阵)表示,行对应于试验,列对应于克隆集合的体;考虑到生物实验存在误差,分离矩阵还需要有查错和纠错能力。利用子集或子空间之间的包含关系可以构建出分离矩阵,它的每行和每列中元素1的个数分别都一样,但试验总次数即行数明显大于信息下界。参13

English Abstract

管宇. 基于克隆文库筛选的池设计[J]. 浙江农林大学学报, 2007, 24(1): 105-109.

引用本文:

管宇. 基于克隆文库筛选的池设计[J]. 浙江农林大学学报, 2007, 24(1): 105-109.

GUAN Yu. Pooling designs based on clone library screenings[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2007, 24(1): 105-109.

Citation:

GUAN Yu. Pooling designs based on clone library screenings[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2007, 24(1): 105-109.

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作者简介: 管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。

通信作者: 管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。

Pooling designs based on clone library screenings

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出版历程

基于克隆文库筛选的池设计

1. 浙江林学院理学院,浙江临安311300

作者简介: 管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。

通信作者: 管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。

English Abstract

Pooling designs based on clone library screenings

1. School of Science, Zhejiang Forestry College, Linan 311300, Zhejiang, China

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作者简介:
管宇,副教授,从事统计计算和生物数学等研究。