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杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

彭沙沙 童再康 黄华宏 周厚君 时剑 林二培

彭沙沙, 童再康, 黄华宏, 周厚君, 时剑, 林二培. 杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析[J]. 浙江农林大学学报, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
引用本文: 彭沙沙, 童再康, 黄华宏, 周厚君, 时剑, 林二培. 杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析[J]. 浙江农林大学学报, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
PENG Sha-sha, TONG Zai-kang, HUANG Hua-hong, ZHOU Hou-jun, SHI Jian, LIN Er-pei. Cloning and bioimformatic analysis of the cellulose synthase-like protein gene,ClCslD1 from Cunninghamia lanceolata[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
Citation: PENG Sha-sha, TONG Zai-kang, HUANG Hua-hong, ZHOU Hou-jun, SHI Jian, LIN Er-pei. Cloning and bioimformatic analysis of the cellulose synthase-like protein gene,ClCslD1 from Cunninghamia lanceolata[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001

杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
基金项目: 

浙江省重大科技专项(2008C02004-1);浙江省自然科学基金资助项目(Y3090510);浙江省林业厅资助项目(08A10)

详细信息
    通信作者: 童再康

Cloning and bioimformatic analysis of the cellulose synthase-like protein gene,ClCslD1 from Cunninghamia lanceolata

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    Corresponding author: TONG Zai-kang
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出版历程
  • 收稿日期:  2011-02-10
  • 修回日期:  2011-06-20
  • 刊出日期:  2012-02-20

杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
    基金项目:

    浙江省重大科技专项(2008C02004-1);浙江省自然科学基金资助项目(Y3090510);浙江省林业厅资助项目(08A10)

    通信作者: 童再康

摘要: 纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。图5参10

English Abstract

彭沙沙, 童再康, 黄华宏, 周厚君, 时剑, 林二培. 杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析[J]. 浙江农林大学学报, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
引用本文: 彭沙沙, 童再康, 黄华宏, 周厚君, 时剑, 林二培. 杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析[J]. 浙江农林大学学报, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
PENG Sha-sha, TONG Zai-kang, HUANG Hua-hong, ZHOU Hou-jun, SHI Jian, LIN Er-pei. Cloning and bioimformatic analysis of the cellulose synthase-like protein gene,ClCslD1 from Cunninghamia lanceolata[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
Citation: PENG Sha-sha, TONG Zai-kang, HUANG Hua-hong, ZHOU Hou-jun, SHI Jian, LIN Er-pei. Cloning and bioimformatic analysis of the cellulose synthase-like protein gene,ClCslD1 from Cunninghamia lanceolata[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001

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