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桂花OfCCD1基因启动子克隆与表达特性

刘玉成 王艺光 张超 董彬 付建新 胡绍庆 赵宏波

刘玉成, 王艺光, 张超, 董彬, 付建新, 胡绍庆, 赵宏波. 桂花OfCCD1基因启动子克隆与表达特性[J]. 浙江农林大学学报, 2018, 35(4): 596-603. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
引用本文: 刘玉成, 王艺光, 张超, 董彬, 付建新, 胡绍庆, 赵宏波. 桂花OfCCD1基因启动子克隆与表达特性[J]. 浙江农林大学学报, 2018, 35(4): 596-603. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
LIU Yucheng, WANG Yiguang, ZHANG Chao, DONG Bin, FU Jianxin, HU Shaoqing, ZHAO Hongbo. Cloning and transient expression assay of OfCCD1 gene promoters from Osmanthus fragrans[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2018, 35(4): 596-603. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
Citation: LIU Yucheng, WANG Yiguang, ZHANG Chao, DONG Bin, FU Jianxin, HU Shaoqing, ZHAO Hongbo. Cloning and transient expression assay of OfCCD1 gene promoters from Osmanthus fragrans[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2018, 35(4): 596-603. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003

桂花OfCCD1基因启动子克隆与表达特性

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
基金项目: 

国家自然科学基金资助项目 31501790

浙江省自然科学基金资助项目 LQ15C160004

浙江省自然科学基金资助项目 LQ16C160003

浙江省农业新品种选育重大科技专项 2016C02056-12

浙江农林大学科研发展基金人才启动项目 2016FR031

详细信息
    作者简介: 刘玉成, 从事桂花花色研究。E-mail:1035778489@qq.com
    通信作者: 赵宏波, 教授, 博士, 从事观赏植物遗传育种等研究。E-mail:zhaohb@zafu.edu.cn
  • 中图分类号: S722.3

Cloning and transient expression assay of OfCCD1 gene promoters from Osmanthus fragrans

  • 摘要: 类胡萝卜素裂解双加氧酶(CCDs)参与植物中多种类胡萝卜素的代谢,在桂花Osmanthus fragrans中类胡萝卜素裂解双加氧酶基因1(OfCCD1)对花香物质的合成具有重要作用。根据前期获得的桂花‘堰虹桂’O.fragrans ‘Yanhong Gui’转录组数据库中OfCCD1的序列和前人已发表的OfCCD1序列设计引物,利用染色体步移技术从桂花基因组DNA中扩增获得OfCCD1基因2个拷贝的启动子序列OfCCD1P-LOfCCD1P-S,其长度分别为2 747 bp和981 bp。2个启动子序列中均含有参与光响应的元件,热激响应元件(HSE),脱落酸(ABA)响应元件(ABRE)和乙烯响应元件;此外,2个启动子中均含有4个ACGT序列。将2个启动子序列分别替代pBI121上的35 S启动子,将构建的载体通过农杆菌Agrobacterium tumefaciens介导转化烟草Nicotiana tabacum叶片进行瞬时表达,发现2个启动子都具有驱动GUS报告基因表达的功能。
  • 图  1  OfCCD1启动子克隆电泳图

    Figure  1  PCR products of OfCCD1 promoters

    图  2  OfCCD1P-L序列

    Figure  2  Sequence of OfCCD1P-L

    图  3  OfCCD1P-S序列

    Figure  3  Sequence of OfCCD1P-S

    图  4  OfCCD1的2个启动子重组质粒图

    Figure  4  Recombinant vectors of two OfCCD1

    图  5  瞬时表达检测

    Figure  5  Detection of transient expression

    表  1  OfCCD1启动子克隆所用引物

    Table  1.   Primer sequences used in the cloning of OfCCD1 promoters

    引物名 称序列(5'→3')
    GSP1 CTTCACAAACAGCCATTCCAACCAGTCTAT
    GSP2 TCGGGCTTTACTGCCACCACACCATTTTC
    GSP3 GAGGAGGAGTCTCATCAACTGGAGCAAAAT
    GSP4 GCATCATTTTCACAAACAGCCATTCCAAC
    GSP5 AGCCTCAAGTTTTGTCCTATTGCCAC
    AP1 GTAATACGACTCACTATAGGGC
    AP2 ACTATAGGGCACGCGTGGT
    GWA GTAATACGACTCACTATAGGGCACGCGTGGTCGACGGCCCGGGCTGGT
    CCD1P-L-F TGATTACGCCAAGCTAAAGGAAGAGTATTCACTTTTGGC
    CCD1P-L-R CCGGGGATCCTCTAGCTGTTGATCCTAATTGAACTCTCAC
    CCD1P-S-F TGATTACGCCAAGCTGAAGCACATGTCTCCCA
    CCD1P-S-R CCGGGGATCCTCTAGCTCTTGGTTCTGAATTGA
    GUS-F TGATTACGCCAAGCTGATCAGTTCGCCGATGCAG
    GUS-R CCGGGGATCCTCTAGAAGTGCGCTTGCTG
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    表  2  OfCCD1P-L中顺式作用元件

    Table  2.   Cis-acting elements in OfCCD1P-L

    顺式作用元件名称 位置 序列(5′→3′) 功能
    G-Box -326, -664, -2 584 CACGTA 光响应元件
    GA-motif -257, -2 738 AAAGATGA 光响应元件的一部分
    ATCT-motif -2 564 AATCTAATCT 参与光响应的部分保守DNA序列
    Box I -429, -l 649 TTTCAAA 光响应元件
    AE-box -737 AGAAACAT 光响应元件的一部分
    Box 4 -733 ATTAAT 参与光响应的部分保守DNA序列
    GAG-motif -300 AGAGATG 光响应元件的一部分
    CAAT-box -ll5, -569 CAAT 一般元件
    CAT-box -l 839 GCCACT 与分生组织相关的顺式元件
    CGTCA-motif -2 580 CGTCA 茉莉酸甲酯响应元件
    TGACG-motif -486 TGACG 茉莉酸甲酯响应元件
    HSE -2 066 AAAAAATTTC 热激响应元件
    LTR -l 4ll CCGAAA 低温响应元件
    MBS -96l, -l 256 TAACTG MYB结合位点
    P-box -2 002 CCTTTTG 赤霉素响应元件
    Skn-l_motif -968, -l 3l0, -l 544, -2 33l GTCAT 胚乳中表达的必备元件
    TATA-box -268, -356, -879, -894, -909 TATA 一般元件
    TC-rich repeats -l l49, -2 5l9 ATTTTCATCA 参与防御和胁迫的元件
    TCA-element -42l, -l 340 TCAGAAGAGGA 水杨酸响应元件
    GCN4_motif -402 TGTGTCA 胚乳中表达的必备元件
    ERE -428 ATTTCAAA 乙烯响应元件
    GCN4_motif -402 TGTGTCA 胚乳中表达的必备元件
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    表  3  OfCCD1P-S中顺式作用元件

    Table  3.   Cis-acting elements in OfCCD1P-S

    顺式作用元件名称 位置 序列(5'→3') 功能
    3-AF1 binding site -911 AAGAGATATTT 光响应元件
    GATA-motif -102 AAGATAAGATT 光响应元件的一部分
    ACE -316 ACGTGGA 光响应元件
    AAGAA-motif -443 GAAAGAA
    ABRE -324 ACGT 脱落酸响应元件
    CAAT-box -12, -267, -530, -547, -566, -659, -723 CAAT(T) 一般元件
    HSE -901 AAAAAATTTC 热激响应元件
    Skn-1_motif -278, -503 GTCAT 在胚乳中表达所必须的元件
    TATA-box -54, -158, -472, -623 TAATA/TATA 基本元件
    TC-rich repeats -673 ATTTTCTTCA 参与防御和胁迫的元件
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  • [1] JOHNSON J D. Do carotenoids serve as transmembrane radical channels?[J]. Free Rad Biol Med, 2009, 47(3):321-323.
    [2] CAZZONELLI C I, POGSON B J. Source to sink:regulation of carotenoid biosynthesis in plants[J]. Trends Plant Sci, 2010, 15(5):266-274.
    [3] HOU Xin, RIVERS J, LEÓN P, et al. Synthesis and function of apocarotenoid signals in plants[J]. Trends Plant Sci, 2016, 21(9):792-803.
    [4] WALTER M H, FLOSS D S, STRACK D. Apocarotenoids:hormones, mycorrhizal metabolites and aroma volatiles[J]. Planta, 2010, 232(1):1-17.
    [5] SIMKIN A J, SCHWARTZ S H, AULDRIDGE M, et al. The tomato carotenoid cleavage dioxygenase 1 genes contribute to the formation of the flavor volatiles β-ionone, pseudoionone, and geranylacetone[J]. Plant J Cell Mol Biol, 2004, 40(6):882-892.
    [6] ILG A, BEYER P, ALBABILI S. Characterization of the rice carotenoid cleavage dioxygenase 1 reveals a novel route for geranial biosynthesis[J]. Febs J, 2009, 276(3):736-747.
    [7] BALDERMANN S, KATO M, FLEISCHMANN P, et al. Biosynthesis of α-and β-ionone, prominent scent compounds, in flowers of Osmanthus fragrans[J]. Acta Biochim Pol, 2012, 59(1):79-81.
    [8] HAN Yuanji, WANG Xiaohui, CHEN Weicai, et al. Differential expression of carotenoid-related genes determines diversified carotenoid coloration in flower petal of Osmanthus fragrans[J]. Tree Genet Genomes, 2014, 10(2):329-338.
    [9] BALDERMANN S, KATO M, KUROSAWA M, et al. Functional characterization of a carotenoid cleavage dioxygenase 1 and its relation to the carotenoid accumulation and volatile emission during the floral development of Osmanthus fragrans Lour.[J]. J Exp Bot, 2010, 61(11):2967-2977.
    [10] LIANG Yingshi, JEON Y A, LIM S H, et al. Vascular-specific activity of the Arabidopsis carotenoid cleavage dioxygenase 7 gene promoter[J]. Plant Cell Rep, 2011, 30(6):973-980.
    [11] ZHENG Xiongjie, XIE Zongzhou, ZHU Kaijie, et al. Isolation and characterization of carotenoid cleavage dioxygenase 4 genes from different citrus species[J]. Mol Genet Genomics, 2015, 290(4):1589-1603.
    [12] RUBIO-MORAGA A, RAMBLA J L, FERNÁNDEZ-de-CARMEN A, et al. New target carotenoids for CCD4 enzymes are revealed with the characterization of a novel stress-induced carotenoid cleavage dioxygenase gene from Crocus sativus[J]. Plant Mol Biol, 2014, 86(4/5):555-569.
    [13] 徐沂春, 胡绍庆, 赵宏波.基于AFLP分子标记的不同类型野生桂花种群遗传结构分析[J].浙江农林大学学报, 2014, 31(2):217-223.

    XU Yichun, HU Shaoqing, ZHAO Hongbo. Genetic structure of different natural Osmanthus fragrans populations based on AFLP method[J]. J Zhejiang A&F Univ, 2014, 31(2):217-223.
    [14] ZHANG Chao, WANG Yiguang, FU Jianxin, et al. Transcriptomic analysis and carotenogenic gene expression related to petal coloration in Osmanthus fragrans 'Yanhong Gui'[J]. Trees, 2016, 30(4):1207-1223.
    [15] 万小荣, 莫爱琼, 潘家辉, 等.拟南芥AtNCED2基因启动子区域序列克隆及其活性分析[J].生物技术, 2010, 20(6):18-23.

    WAN Xiaorong, MO Aiqiong, PAN Jiahui, et al. Molecular cloning and GUS-aided activity analysis of promoter region sequence of AtNCED2 gene from Arabidopsis thaliana L.[J]. Biotechnology, 2010, 20(6):18-23.
    [16] 万小荣, 莫爱琼, 刘帅, 等.粤油7号花生AhNCED1基因启动子克隆及其活性分析[J].核农学报, 2011, 25(4):692-699.

    WAN Xiaorong, MO Aiqiong, LIU Shuai, et al. Molecular cloning and GUS-aided activity analying of promoter sequence of AhNCED2 gene from Arachis hypogaea L. cv.Yueyou 7[J]. J Nucl Agri Sci, 2011, 25(4):692-699.
    [17] IMAI A, TAKAHASHI S, NAKAYAMA K, et al. The promoter of the carotenoid cleavage dioxygenase 4a-5 gene of Chrysanthemum morifolium (CmCCD4a-5) drives petal-specific transcription of a conjugated gene in the developing flower[J]. J Plant Physiol, 2013, 170(14):1295-1299.
    [18] 韩远记. 桂花花色变异的机理和不同花色品种花瓣的cDNA-AFLP差异分析[D]. 开封: 河南大学, 2014.

    HAN Yuanji. Mechanism of Flower Color Variation and cDNA-AFLP Analysis of 2 Cultivers with Different Flower Color in Osmanthus fragrans[D]. Kaifeng: Henan University, 2014.
    [19] AHRAZEM O, TRAPERO A, GÓMEZ M D, et al. Genomic analysis and gene structure of the plant carotenoid dioxygenase 4 family:a deeper study in Crocus sativus and its allies[J]. Genomics, 2010, 96(4):239-250.
    [20] AHRAZEM O, RUBIO-MORAGA A, ARGANDOÑA-PICAZO J, et al. Intron retention and rhythmic diel pattern regulation of carotenoid cleavage dioxygenase 2 during crocetin biosynthesis in saffron[J]. Plant Mol Biol, 2016, 91(3):355-374.
    [21] CHOI H I, HONG J H, HA J O, et al. ABFs, a family of ABA-responsive element binding factors[J]. J Biol Chem, 2000, 275(3):1723-1730.
    [22] BHALOTHIA P, SANGWAN C, ALOK A, et al. PP2C-like promoter and its deletion variants are induced by aba but not by MeJA and SA in Arabidopsis thaliana[J]. Front Plant Sci, 2016, 7(14):547. doi:10.3389/fpls.2016.00547.
    [23] MEHROTRA R, MEHROTRA S. Promoter activation by ACGT in response to salicylic and abscisic acids is differentially regulated by the spacing between two copies of the motif[J]. J Plant Physiol, 2010, 167(14):1214-1218.
    [24] CAO Yongrong, GUO Xiaoli, ZHANG Quan, et al. Isolation and characterization of carotenoid cleavage dioxygenase gene in halophyte Suaeda salsa[J]. Plant Growth Regul, 2005, 46(1):61-67.
    [25] WANG Ruikai, WANG Chune, FEI Yunyan, et al. Genome-wide identification and transcription analysis of soybean carotenoid oxygenase genes during abiotic stress treatments[J]. Mol Biol Rep, 2013, 40(8):4737-4745.
  • [1] 李莉, 庞天虹, 付建新, 张超.  桂花番茄红素β-环化酶基因LCYB上游B2亚组ERF转录因子的筛选和鉴定 . 浙江农林大学学报, doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20240316
    [2] 张耀, 王家璇, 蔡璇, 曾祥玲, 杨洁, 陈洪国, 邹晶晶.  桂花OfACOs基因家族鉴定及表达分析 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(3): 492-501. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220783
    [3] 洪方蕾, 陆瑶, 俞世姣, 胡芷诺, 缪云锋, 钟诗蔚, 赵宏波.  桂花OfABFs基因克隆和表达分析 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(3): 481-491. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220264
    [4] 周俊杰, 王艺光, 董彬, 赵宏波.  桂花OfPSYOfPDSOfHYB基因启动子克隆及表达特性分析 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(1): 64-71. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220110
    [5] 庞天虹, 钱婕妤, 付建新, 顾翠花, 张超.  桂花己糖激酶基因家族成员的序列及表达分析 . 浙江农林大学学报, 2021, 38(2): 225-234. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20200370
    [6] 缪云锋, 周丹, 董彬, 赵宏波.  桂花OfNAC转录因子鉴定及在花开放阶段的表达分析 . 浙江农林大学学报, 2021, 38(3): 433-444. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20200474
    [7] 吴琪, 吴鸿飞, 周敏舒, 徐倩霞, 杨丽媛, 赵宏波, 董彬.  桂花OfFCA基因的克隆及在花芽分化时期的表达分析 . 浙江农林大学学报, 2020, 37(2): 195-200. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2020.02.001
    [8] 蒋琦妮, 付建新, 张超, 董彬, 赵宏波.  桂花OfAP1基因的克隆及表达分析 . 浙江农林大学学报, 2019, 36(4): 664-669. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2019.04.005
    [9] 高向倩, 李忆林, 贾彩霞, 李大培, 杨玉婷, 杨桂燕.  核桃抗逆基因JrGSTU23的克隆及表达分析 . 浙江农林大学学报, 2018, 35(4): 589-595. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.002
    [10] 程占超, 侯丹, 马艳军, 高健.  毛竹生长素反应因子基因的生物信息学分析及差异表达 . 浙江农林大学学报, 2017, 34(4): 574-580. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.04.002
    [11] 王英, 张超, 付建新, 赵宏波.  桂花花芽分化和花开放研究进展 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(2): 340-347. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.02.021
    [12] 付建新, 张超, 王艺光, 赵宏波.  桂花组织基因表达中荧光定量PCR内参基因的筛选 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(5): 727-733. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.05.001
    [13] 庞景, 童再康, 黄华宏, 林二培, 刘琼瑶.  杉木纤维素合成酶基因CesA的克隆及表达分析 . 浙江农林大学学报, 2015, 32(1): 40-46. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2015.01.006
    [14] 贾小明, 张焕玲.  CaMV35S启动子驱动的FT基因调控杨树早期开花的初步研究 . 浙江农林大学学报, 2014, 31(3): 404-409. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.03.012
    [15] 彭沙沙, 童再康, 黄华宏, 周厚君, 时剑, 林二培.  杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(1): 1-6. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.001
    [16] 杨秀莲, 郝其梅.  桂花种子休眠和萌发的初步研究 . 浙江农林大学学报, 2010, 27(2): 272-276. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.02.018
    [17] 蔡璇, 苏蘩, 金荷仙, 姚崇怀, 王彩云.  四季桂花瓣色素的初步鉴定与提取方法 . 浙江农林大学学报, 2010, 27(4): 559-564. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.04.014
    [18] 胡绍庆, 宣子灿, 周煦浪, 吴光洪.  杭州市桂花品种的分类整理 . 浙江农林大学学报, 2006, 23(2): 179-187.
    [19] 周媛, 姚崇怀, 王彩云.  桂花切花品种筛选 . 浙江农林大学学报, 2006, 23(6): 660-663.
    [20] 吴光洪, 胡绍庆, 宣子灿, 向其柏.  桂花品种分类标准与应用 . 浙江农林大学学报, 2004, 21(3): 281-284.
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出版历程
  • 收稿日期:  2017-08-25
  • 修回日期:  2017-11-28
  • 刊出日期:  2018-08-20

桂花OfCCD1基因启动子克隆与表达特性

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
    基金项目:

    国家自然科学基金资助项目 31501790

    浙江省自然科学基金资助项目 LQ15C160004

    浙江省自然科学基金资助项目 LQ16C160003

    浙江省农业新品种选育重大科技专项 2016C02056-12

    浙江农林大学科研发展基金人才启动项目 2016FR031

    作者简介:

    刘玉成, 从事桂花花色研究。E-mail:1035778489@qq.com

    通信作者: 赵宏波, 教授, 博士, 从事观赏植物遗传育种等研究。E-mail:zhaohb@zafu.edu.cn
  • 中图分类号: S722.3

摘要: 类胡萝卜素裂解双加氧酶(CCDs)参与植物中多种类胡萝卜素的代谢,在桂花Osmanthus fragrans中类胡萝卜素裂解双加氧酶基因1(OfCCD1)对花香物质的合成具有重要作用。根据前期获得的桂花‘堰虹桂’O.fragrans ‘Yanhong Gui’转录组数据库中OfCCD1的序列和前人已发表的OfCCD1序列设计引物,利用染色体步移技术从桂花基因组DNA中扩增获得OfCCD1基因2个拷贝的启动子序列OfCCD1P-LOfCCD1P-S,其长度分别为2 747 bp和981 bp。2个启动子序列中均含有参与光响应的元件,热激响应元件(HSE),脱落酸(ABA)响应元件(ABRE)和乙烯响应元件;此外,2个启动子中均含有4个ACGT序列。将2个启动子序列分别替代pBI121上的35 S启动子,将构建的载体通过农杆菌Agrobacterium tumefaciens介导转化烟草Nicotiana tabacum叶片进行瞬时表达,发现2个启动子都具有驱动GUS报告基因表达的功能。

English Abstract

刘玉成, 王艺光, 张超, 董彬, 付建新, 胡绍庆, 赵宏波. 桂花OfCCD1基因启动子克隆与表达特性[J]. 浙江农林大学学报, 2018, 35(4): 596-603. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
引用本文: 刘玉成, 王艺光, 张超, 董彬, 付建新, 胡绍庆, 赵宏波. 桂花OfCCD1基因启动子克隆与表达特性[J]. 浙江农林大学学报, 2018, 35(4): 596-603. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
LIU Yucheng, WANG Yiguang, ZHANG Chao, DONG Bin, FU Jianxin, HU Shaoqing, ZHAO Hongbo. Cloning and transient expression assay of OfCCD1 gene promoters from Osmanthus fragrans[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2018, 35(4): 596-603. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
Citation: LIU Yucheng, WANG Yiguang, ZHANG Chao, DONG Bin, FU Jianxin, HU Shaoqing, ZHAO Hongbo. Cloning and transient expression assay of OfCCD1 gene promoters from Osmanthus fragrans[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2018, 35(4): 596-603. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.003
  • 类胡萝卜素是广泛分布于自然界的一类色素,迄今已发现了近800种[1],主要存在于植物的叶、花、果实和根等器官中,在吸引昆虫、鸟类传播花粉和种子中发挥作用[2]。类胡萝卜素可作为多种生物活性物质的前体,经过氧合酶或非酶裂解作用可以形成阿朴类胡萝卜素[3],后者及其衍生物可生成β-紫罗兰酮(β-ionone)等香气物质及脱落酸(abscisic acid,ABA)等植物生长调节剂[4]。作为类胡萝卜素裂解氧合酶(carotenoid cleavage oxygenases,CCO)中的重要成员,类胡萝卜素裂解双加氧酶1(carotenoid cleavage dixoygenase 1,CCD1)在不同的植物中所裂解的底物、作用位点不尽相同。研究发现[5],CCD1在C9~C10(C9′~C10′)位时剪切番茄红素、胡萝卜素、玉米黄质或脱辅基类胡萝卜素等,形成β-紫罗兰酮,β-环柠檬醛(β-cyclocitral),香叶基丙酮(geranylacetone)和假紫罗兰酮(pseudoionone)等芳香类物质;在番茄红素C5~C6(C5′~C6′)位裂解时则形成6-甲基-5-庚烯-2-酮[6],认为CCD1对基于类胡萝卜素代谢途径的香气物质合成发挥着重要作用。桂花Osmanthus fragrans在中国栽培历史悠久,集绿化、美化和香化为一体,花香和花色是其重要观赏性状。类胡萝卜素裂解双加氧酶1(OfCCD1)[7]降解桂花中的着色物质——α-胡萝卜素和β-胡萝卜素[8],合成主要香气物质α-紫罗酮和β-紫罗酮[9]。基因启动子控制着基因在特定的组织[10]、特定的发育阶段[11]以及一定的环境条件下表达[12];分离相关基因启动子,分析其序列及其作用元件,并研究其功能,可明确该基因的调控因子及其作用机制。本研究利用染色体步移技术克隆了OfCCD1启动子,通过启动子序列分析、载体构建和瞬时表达分析,初步明确了其功能,为揭示OfCCD1基因调控花色花香代谢机制奠定基础。

    • 供试材料为6~8年生地栽丹桂品种‘堰虹桂’‘Yanhong Gui’,栽植于浙江农林大学桂花资源圃。

    • Taq聚合酶、限制酶(DraⅠ,EcoRⅤ,PvuⅡ,StuⅠ),质粒载体PMD18-T,大肠埃希菌Escherichia coli DH5α,胶回收试剂盒,DNA片段纯化试剂盒和无缝连接试剂盒均购自Takara公司(大连)。

    • 参照十六烷基三甲基溴化铵法(CTAB)提取‘堰虹桂’基因组DNA[13]

    • 根据‘堰虹桂’转录组数据库中的CCD1序列(GenBank登录号MG138152)[14]和BALDERMANN等发表的OfCCD1(GenBank登录号AB526197.1)序列[9],用Primer Primer 5.0设计下游特异性引物1(GSP1),特异性引物2(GSP2)和特异性引物4(GSP4);利用上述2段序列的重复序列设计特异性引物3(GSP3);利用接头引物1(AP1)与GSP1,接头引物2(AP2)与GSP2经2轮聚合酶链式反应(PCR)获得的启动子片段设计特异性引物5(GSP5)。利用pBI121质粒上的β-葡萄糖苷酸酶(β-Glucosidase,GUS)基因序列设计上游引物GUS-F和下游引物GUS-R。引物及接头均由上海生工合成(表 1)。

      表 1  OfCCD1启动子克隆所用引物

      Table 1.  Primer sequences used in the cloning of OfCCD1 promoters

      引物名 称序列(5'→3')
      GSP1 CTTCACAAACAGCCATTCCAACCAGTCTAT
      GSP2 TCGGGCTTTACTGCCACCACACCATTTTC
      GSP3 GAGGAGGAGTCTCATCAACTGGAGCAAAAT
      GSP4 GCATCATTTTCACAAACAGCCATTCCAAC
      GSP5 AGCCTCAAGTTTTGTCCTATTGCCAC
      AP1 GTAATACGACTCACTATAGGGC
      AP2 ACTATAGGGCACGCGTGGT
      GWA GTAATACGACTCACTATAGGGCACGCGTGGTCGACGGCCCGGGCTGGT
      CCD1P-L-F TGATTACGCCAAGCTAAAGGAAGAGTATTCACTTTTGGC
      CCD1P-L-R CCGGGGATCCTCTAGCTGTTGATCCTAATTGAACTCTCAC
      CCD1P-S-F TGATTACGCCAAGCTGAAGCACATGTCTCCCA
      CCD1P-S-R CCGGGGATCCTCTAGCTCTTGGTTCTGAATTGA
      GUS-F TGATTACGCCAAGCTGATCAGTTCGCCGATGCAG
      GUS-R CCGGGGATCCTCTAGAAGTGCGCTTGCTG
    • ① DNA文库的构建。分别用Dra Ⅰ,EcoR Ⅴ,Pvu Ⅱ,Stu Ⅰ 4种限制性内切酶对提取到的DNA进行酶切。酶切体系为基因组DNA 25.0 μL(100 mg·L-1),限制内切酶8.0 μL,10×限制酶buffer 10.0 μL,灭菌水57.0 μL,总体积100.0 μL,37 ℃过夜。取5.0 μl酶切产物用质量分数0.6%琼脂糖进行检测。按照DNA纯化试剂盒的说明书对酶切产物进行纯化后加接头。分别取4组酶切纯化的DNA各4.8 μL,染色体步移接头GWA 1.9 μL,10×连接缓冲液0.8 μL,T4 DNA连接酶0.5 μL,16.0 ℃过夜;70.0 ℃水浴5 min,加入32.0 μL去离子水。②聚合酶链式反应(PCR)扩增。取AP1,引物GSP1/GSP3,模板各1.0 μL,预混合Taq酶10.0 μL,去离子水补至20.0 μL进行第1轮PCR。扩增程序为94.0 ℃ 5 min;94.0 ℃ 25 s,72.0 ℃ 3 min,7循环;94.0 ℃ 25 s,65.0 ℃ 3 min,32循环;67.0 ℃ 7 min。取第1轮产物1.0 μL并稀释50倍作为第2轮PCR的模板。第2轮PCR体系为:AP2,GSP2/GSP4/GSP5,模板各1.0 μL,预混合Taq酶10.0 μL,去离子水补至20.0 μL。扩增程序为94.0 ℃ 5 min;94.0 ℃ 25 s,72.0 ℃ 3 min,5循环;94.0 ℃ 25 s,65.0 ℃ 3 min,20循环;67.0 ℃ 7 min。取GUS-F,GUS-R和pBI121质粒各1.0 μL,预混合Taq酶10.0 μL,去离子水补至20.0 μL进行GUS序列扩增。扩增程序为95.0 ℃ 5 min;95.0 ℃ 30 s,69.8 ℃ 30 s,72.0 ℃ 1 min,35循环;72.0 ℃ 10 min;4.0 ℃ 10 min。质量分数为1.2%的琼脂糖凝胶电泳检测。

    • 切胶回收按照MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.4.0(TaKaRa,大连)的说明书进行。载体连接按照PMD18-T载体说明书(Takara,大连)进行,连接后的重组质粒导人大肠埃希菌DH5α感受态细胞中,在50 mg·L-1氨苄青霉素的固体LB培养基上进行蓝白斑筛选,挑取白色单菌落菌液PCR检测后将阳性克隆送公司测序。序列初步分析采用DNAMAN软件进行。启动子序列作用元件分析采用在线网站PlantCARE(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)进行。

    • 根据获得的OfCCD1的启动子序列,利用Takara(http://www.clontech.com)无缝连接引物设计软件设计3对无缝连接引物CCD1P-S-F和CCD1P-S-R,CCD1P-L-F和CCD1P-L-R,GUS-F和GUS-R。具体操作步骤按照Takara无缝连接试剂盒的说明书进行。将重组好的表达载体利用冻融法转入农杆菌Agrobacterium tumefaciens GV3101感受态。随后将烟草Nicotiana tabacum叶片剪切成0.5 cm × 0.5 cm的叶块,在农杆菌菌液吸光度D(600)为0.6的侵染液中浸染10 min;无菌滤纸吸干叶片表面的菌液,将侵染的外植体移至于无菌水浸润的滤纸上培养24 h并进行GUS染色,37 ℃下保温16~24 h。V(乙酸):V(乙醇)=3:1的混合液脱色后取出,对染色结果进行拍照。

      图  1  OfCCD1启动子克隆电泳图

      Figure 1.  PCR products of OfCCD1 promoters

    • 以‘堰虹桂’DNA为模板,分别利用引物GSP1和GSP2,接头引物AP1和AP2进行2轮PCR,在EcoR文库扩增得到条带;经比对和拼接得到长度为511 bp的序列(图 1A)。利用引物GSP3和GSP4,接头引物AP1和AP2经过2轮PCR,在DraⅠ文库中得到约2 000 bp的条带(图 1B)。测序后,经比对和拼接得到长度为2 747 bp的条带,命名为OfCCD1P-L图 2)。利用GSP3和GSP5经过2轮PCR后在Pvu Ⅱ文库中得到750 bp左右的条带(图 1B),经过拼接比对得到OfCCD1上游981 bp的启动子序列,命名为OfCCD1P-S图 3)。

      图  2  OfCCD1P-L序列

      Figure 2.  Sequence of OfCCD1P-L

      图  3  OfCCD1P-S序列

      Figure 3.  Sequence of OfCCD1P-S

    • 利用PlantCARE网站对启动子序列进行序列分析发现,OfCCD1P-L有TATA-box和CAAT-box等基本作用元件,同时有7个响应元件,响应茉莉酸甲酯、赤霉素、水杨酸、乙烯的元件,以及热激元件,鸟类成髓细胞性白血病病毒癌基因同源物(MYB)结合位点,并有4个响应脱落酸(ABA)的核心序列ACGT(表 2)。OfCCD1P-S中含有TATA-box和CAAT-box等基本作用元件,同时有3个光响应元件,1个热激响应元件以及1个ABA响应元件(表 3),并有4个ABA响应元件(ABRE)核心序列ACGT。

      表 2  OfCCD1P-L中顺式作用元件

      Table 2.  Cis-acting elements in OfCCD1P-L

      顺式作用元件名称 位置 序列(5′→3′) 功能
      G-Box -326, -664, -2 584 CACGTA 光响应元件
      GA-motif -257, -2 738 AAAGATGA 光响应元件的一部分
      ATCT-motif -2 564 AATCTAATCT 参与光响应的部分保守DNA序列
      Box I -429, -l 649 TTTCAAA 光响应元件
      AE-box -737 AGAAACAT 光响应元件的一部分
      Box 4 -733 ATTAAT 参与光响应的部分保守DNA序列
      GAG-motif -300 AGAGATG 光响应元件的一部分
      CAAT-box -ll5, -569 CAAT 一般元件
      CAT-box -l 839 GCCACT 与分生组织相关的顺式元件
      CGTCA-motif -2 580 CGTCA 茉莉酸甲酯响应元件
      TGACG-motif -486 TGACG 茉莉酸甲酯响应元件
      HSE -2 066 AAAAAATTTC 热激响应元件
      LTR -l 4ll CCGAAA 低温响应元件
      MBS -96l, -l 256 TAACTG MYB结合位点
      P-box -2 002 CCTTTTG 赤霉素响应元件
      Skn-l_motif -968, -l 3l0, -l 544, -2 33l GTCAT 胚乳中表达的必备元件
      TATA-box -268, -356, -879, -894, -909 TATA 一般元件
      TC-rich repeats -l l49, -2 5l9 ATTTTCATCA 参与防御和胁迫的元件
      TCA-element -42l, -l 340 TCAGAAGAGGA 水杨酸响应元件
      GCN4_motif -402 TGTGTCA 胚乳中表达的必备元件
      ERE -428 ATTTCAAA 乙烯响应元件
      GCN4_motif -402 TGTGTCA 胚乳中表达的必备元件

      表 3  OfCCD1P-S中顺式作用元件

      Table 3.  Cis-acting elements in OfCCD1P-S

      顺式作用元件名称 位置 序列(5'→3') 功能
      3-AF1 binding site -911 AAGAGATATTT 光响应元件
      GATA-motif -102 AAGATAAGATT 光响应元件的一部分
      ACE -316 ACGTGGA 光响应元件
      AAGAA-motif -443 GAAAGAA
      ABRE -324 ACGT 脱落酸响应元件
      CAAT-box -12, -267, -530, -547, -566, -659, -723 CAAT(T) 一般元件
      HSE -901 AAAAAATTTC 热激响应元件
      Skn-1_motif -278, -503 GTCAT 在胚乳中表达所必须的元件
      TATA-box -54, -158, -472, -623 TAATA/TATA 基本元件
      TC-rich repeats -673 ATTTTCTTCA 参与防御和胁迫的元件
    • 将克隆得到的启动子和GUS片段分别与pBI121质粒进行重组(图 4),以含GUS::GUS表达载体的菌株为阴性对照(ck1),以含pBI 121载体菌株为阳性对照(ck2),对构建的OfCCD1P-L::GUS和OfCCD1P-S::GUS表达载体进行瞬时表达分析(图 5)。从图 5可以看出,阴性对照没有着色,阳性对照着色范围和程度最好,OfCCD1P-L::GUS表达载体和OfCCD1P-S::GUS表达载体均有着色,但着色都比阳性对照要弱。

      图  4  OfCCD1的2个启动子重组质粒图

      Figure 4.  Recombinant vectors of two OfCCD1

      图  5  瞬时表达检测

      Figure 5.  Detection of transient expression

    • 桂花OfCCD1基因有2个拷贝[14]。在启动子克隆过程中,第1次步移并未得到足够长的序列。目前,已报道的OfCCD1序列有2个:ZHANG等[14]发现的CCD1序列(GenBank登录号MG138152)和BALDERMANN发表的OfCCD1序列(GenBank登录号AB526197.1)[9]。本研究利用上述2个序列的重复序列设计了引物GSP3,并在GSP3 5′上游设计了GSP4,利用已获得的部分OfCCD1启动子序列设计了引物GSP5,分别步移从而获得了OfCCD1P-SOfCCD1P-L的启动子序列。其中OfCCD1P-L长度为2 747 bp,OfCCD1P-S长度为981 bp。原因是OfCCD1启动子区域的2个拷贝所含酶切位点不同,构建文库时OfCCD1P-L启动子区域被内切酶截断的区域短,步移得到的启动子就较长;而OfCCD1P-S启动子区域大部分被截断,所得的启动子序列就较短。类似地,已报道的CCD家族其他成员的启动子长度也有差异,如拟南芥Arabidopsis thalianaAtCCD7[10]AtNCED2[15],花生Arachis hypogaeaAhNCED1[16]启动子都有2 000 bp左右,而菊花Chrysanthemum morifoliumCmCCD4a-5[17]和桂花的OfCCD4[18]启动子则分别为1 094 bp和1 337 bp。上述文献中进行启动子克隆所用方法不尽相同,这也是造成获得启动子长度不一的因素。

      本研究所获得的2个OfCCD1启动子所含元件种类是具有一致性的,都含有光响应元件、热激响应元件和ABA响应元件,其中较多的是光响应元件。在桂花中,OfCCD1的表达受光照影响[9],证实了OfCCD1启动子中的光响应元件的存在。同一个亚家族的其他成员,如CCD4[19]CCD2[20]的启动子中也发现了光响应元件。这表明光响应元件在CCD家族的启动子中可能是普遍存在的。不过功能上可能有差异,因为在藏红花Crocus sativus中,CsCCD2的表达是受光抑制的[20]

      此外,克隆得到的2个启动子中含有4个ACGT序列[21]。ACGT是启动子中一个重要的顺式作用元件,该序列可以响应水杨酸(salicylic acid,SA),紫外线,ABA和茉莉酸(jasmonic acid,JA)[22]的处理。有研究表明:响应ABA至少需要2个ACGT序列,且2个ACGT之间的碱基数不同,响应的激素种类也不同。MEHROTRA等[23]的研究发现:当2个ACGT序列之间的距离是5 bp时,这段序列响应SA的处理;当距离是25 bp时,该序列响应ABA处理。在碱蓬Suaeda salsa[24]和大豆Glycine max[25]中ABA处理会使CCD1的表达量升高,因此,桂花中OfCCD1的表达极有可能响应ABA的诱导,具体的响应机制还需要进一步研究。

参考文献 (25)

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