留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

拟南芥磷脂酸荧光探针的构建及应用

马疏言 郑月萍 郑志富

马疏言, 郑月萍, 郑志富. 拟南芥磷脂酸荧光探针的构建及应用[J]. 浙江农林大学学报, 2024, 41(1): 104-112. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
引用本文: 马疏言, 郑月萍, 郑志富. 拟南芥磷脂酸荧光探针的构建及应用[J]. 浙江农林大学学报, 2024, 41(1): 104-112. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
MA Shuyan, ZHENG Yueping, ZHENG Zhifu. Generation and application of a fluorescent probe for phosphatidic acid in Arabidopsis thaliana[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2024, 41(1): 104-112. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
Citation: MA Shuyan, ZHENG Yueping, ZHENG Zhifu. Generation and application of a fluorescent probe for phosphatidic acid in Arabidopsis thaliana[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2024, 41(1): 104-112. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355

拟南芥磷脂酸荧光探针的构建及应用

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
基金项目: 国家自然科学基金青年基金资助项目(32100209);浙江省自然科学基金青年基金资助项目(Q21C020003);国家自然科学基金面上基金资助项目(31871660)
详细信息
    作者简介: 马疏言(ORCID: 0009-0007-5802-6691),从事植物生理生化与代谢调控研究。E-mail: 1531861619@qq.com
    通信作者: 郑志富(ORCID: 0000-0002-8247-5629),教授,从事植物生化和代谢研究。E-mail: zzheng@zafu.edu.cn
  • 中图分类号: Q946.5

Generation and application of a fluorescent probe for phosphatidic acid in Arabidopsis thaliana

  • 摘要:   目的  磷脂酸(PA)是甘油脂生物合成的前体,又是参与植物生长发育调节和各种逆境响应的重要信使物质,然而目前对植物细胞中PA含量动态变化的了解十分有限。本研究试图构建一种能有效监测植物细胞PA含量变化的荧光探针,并用之测定盐碱胁迫过程中胞内PA含量的变化。  方法  将Spo20p蛋白中高度专一的PA结合域相对应的核苷酸序列与绿色荧光蛋白基因融合,经遗传转化获得携带该融合基因的转基因拟南芥Arabidopsis thaliana株系,其表达受组成型启动子UBQ10驱动,产生的融合蛋白成为专一结合PA的荧光探针。随后,运用该荧光探针监测盐碱胁迫下胞内PA含量的变化。  结果  构建获得7个不同的纯合、单插入位点转基因拟南芥株系。实时荧光定量PCR (RT-qPCR)分析显示:不同株系中融合基因的表达量存在差异。不同浓度外源PA处理试验显示:随着表达量的升高,PA探针可有效监测到2 μmol·L−1 PA处理根尖10 min后细胞中PA含量的变化;而当PA探针表达量较低时,对PA监测灵敏度显著下降,表明在一定程度上荧光探针对PA监测的灵敏度与其表达量相关联。运用PA荧光探针发现:盐碱胁迫处理根尖5 min即可诱导质膜上或胞内PA的积累,暗示PA在植物早期盐碱胁迫响应中可能产生重要作用。  结论  本研究构建了一种可对细胞内PA含量进行有效监测的荧光探针,该探针可用于监测植物盐碱胁迫早期响应过程中胞内PA水平的变化,从而为早期逆境响应研究提供新工具。图7表1参36
  • 图  1  pSY06-GFP-PABD载体图

    Figure  1  Vector diagram of pSY06-GFP-PABD

    图  2  不同转基因拟南芥株系中GFP-PABD融合基因的相对表达量

    Figure  2  Relative expression level of the GFP-PABD fusion gene in transgenic A. thaliana lines

    图  3  野生型拟南芥与3个PA荧光探针转基因株系的表型比较

    Figure  3  Phenotypic comparison between wild type and three transgenic lines of A. thaliana bearing PA fluorescent probe

    图  4  无外源PA处理下PA探针在野生型和2个转基因拟南芥株系根尖中荧光强度的差异分析

    Figure  4  Analysis of discrepancy in fluorescent intensity of PA probe between wild type and two transgenic lines of A. thaliana

    图  5  外源PA(2 μmol·L−1)处理下PA荧光探针对PA监测灵敏度的分析

    Figure  5  Sensitivity analysis of PA fluorescent probe monitoring PA under treatment with 2 μmol·L−1 exogenous PA

    图  6  外源PA (10 μmol·L−1)处理下PA荧光探针对PA监测灵敏度的分析

    Figure  6  Sensitivity analysis of PA fluorescent probe monitoring PA under treatment with 10 μmol·L−1 exogenous PA

    图  7  单独或混合盐碱胁迫下PA在转基因拟南芥根尖分生组织中的分布

    Figure  7  Distribution of PA in the root tip meristem of a transgenic A. thaliana line bearing PA sensor under saline and alkaline stresses, alone or in combination

    表  1  相关引物序列

    Table  1.   Sequence of related primers

    用途引物名称引物序列(5′→3′)
    PABD基因合成 ZYP301 CCTGCTAATTTCAAGGCTAATTCATTGCTGTTCGCTCGAGATCTGAGTCCGGACTGCAGGTTGGATCCGGTACCGAGCT
    ZYP302 GAAGACGTGATAGGCTACATGTGAAGCTTAAATCCTTGAGGAATAAAATCCACAAACAACTTCACCCAAA
    ZYP303 TGCTTCCTGAACAATTGTCCATTCTAGATTCTGTCTTGTTGATATCAAGACCTGCTAATTTCAAGGCTAA
    ZYP304 GTACCCAAGCTTCACATGTAGCCTATCACGTCTTCTGCTTCCTGAACAATTGTCC
    ZYP305 CACAAACAACTTCACCCAAACTGTCGGTTCGATGACGCCACTAAGACTAGTTAAGGTACCGGCGTAATCATGGTC
    PABD基因克隆 ZYP308 TCCGGACTCAGATCTCGAGC
    ZYP309 AGCTATAGTTCTAGATCTAGATTAACTAGTCTTAGTGGCGTC
    GFP基因克隆 ZYP306 TATCGATGGCGCCAGCTGAGGATGGTGAGCAAGGGCGA
    ZYP307 AGATCTGAGTCCGGACTTGTACAGCTCGTCCATCCGGACTCAGATCTCGAGC
    转基因拟南芥鉴定 MSY01 TGGTGTTAGTTTCTAGTTTGTGCG
    MSY02 TCATCATGACAGATCTGCGC
    表达量分析 ZYP389 GACCACTACCAGCAGAACACC
    ZYP390 CTTGTACAGCTCGTCCATGC
    下载: 导出CSV
  • [1] ZHUKOVSKY M A, FILOGRANA A, LUINI A, et al. Phosphatidic acid in membrane rearrangements [J]. Febs Letters, 2019, 593(17): 2428 − 2451.
    [2] CONNERTH M, TATSUTA T, HAAG M, et al. Intramitochondrial transport of phosphatidic acid in yeast by a lipid transfer protein [J]. Science, 2012, 338(6108): 815 − 818.
    [3] WANG Ziqing, ZHANG Feng, HE Jingquan, et al. Binding of PLD2-generated phosphatidic acid to KIF5B promotes MT1-MMP surface trafficking and lung metastasis of mouse breast cancer cells [J]. Developmental Cell, 2017, 43(2): 186 − 197.
    [4] CRADDOCK C P, ADAMS N, BRYANT F M, et al. PHOSPHATIDIC ACID PHOSPHOHYDROLASE regulates phosphatidylcholine biosynthesis in Arabidopsis by phosphatidic acid-mediated activation of CTP: PHOSPHOCHOLINE CYTIDYLYLTRANSFERASE activity [J]. The Plant Cell, 2015, 27(4): 1251 − 1264.
    [5] ATHENSTAEDT K. Phosphatidic acid biosynthesis in the model organism yeast Saccharomyces cerevisiae-a survey [J/OL]. Biochimica et Biophysica Acta-Molecular and Cell Biology of Lipids, 2021, 1866(6): 158907[2023-05-30]. doi:10.1016/j.bbalip.2021.158907.
    [6] WANG Xuemin, DEVAIAH S P, ZHANG Wenhua, et al. Signaling functions of phosphatidic acid [J]. Progress in Lipid Research, 2006, 45(3): 250 − 278.
    [7] SELVY P E, LAVIERI R R, LINDSLEY C W, et al. Phospholipase D: enzymology, functionality, and chemical modulation [J]. Chemical Reviews, 2011, 111(10): 6064 − 6119.
    [8] TAN Weijuan, YANG Yicong, ZHOU Ying, et al. DIACYLGLYCEROL ACYLTRANSFERASE and DIACYLGLYCEROL KINASE modulate triacylglycerol and phosphatidic acid production in the plant response to freezing stress [J]. Plant Physiology, 2018, 177(3): 1303 − 1318.
    [9] XING Jingjing, ZHANG Liang, DUAN Zhikun, et al. Coordination of phospholipid-based signaling and membrane trafficking in plant immunity [J]. Trends in Plant Science, 2021, 26(4): 407 − 420.
    [10] ARISZ S A, TESTERINK C, MUNNIK T. Plant PA signaling via diacylglycerol kinase [J]. Biochimica et Biophysica Acta-Molecular and Cell Biology of Lipids, 2009, 1791(9): 869 − 875.
    [11] de JONG C F, LAXALT A M, BARGMANN B O, et al. Phosphatidic acid accumulation is an early response in the Cf-4/Avr4 interaction [J]. The Plant Journal, 2004, 39(1): 1 − 12.
    [12] KOOIJMAN E E, TIELEMAN D P, TESTERINK C, et al. An electrostatic/hydrogen bond switch as the basis for the specific interaction of phosphatidic acid with proteins [J]. Journal of Biological Chemistry, 2007, 282(15): 11356 − 11364.
    [13] ZHANG Wenhua, QIN Chunbo, ZHAO Jian, et al. Phospholipase Dα1-derived phosphatidic acid interacts with ABI1 phosphatase 2C and regulates abscisic acid signaling [J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2004, 101(25): 9508 − 9513.
    [14] YAO Hongyan, WANG Geliang, GUO Liang, et al. Phosphatidic acid interacts with a MYB transcription factor and regulates its nuclear localization and function in Arabidopsis [J]. The Plant Cell, 2013, 25(12): 5030 − 5042.
    [15] SAGARAM U S, EL-MOUNADI K, BUCHKO G W, et al. Structural and functional studies of a phosphatidic acid-binding antifungal plant defensin MtDef4: identification of an RGFRRR motif governing fungal cell entry [J/OL]. PLoS One, 2013, 8(12): e82485[2023-05-30]. doi:10.1371/journal.pone.0082485.
    [16] CAO Chunyan, WANG Peipei, SONG Hongdi, et al. Phosphatidic acid binds to and regulates guanine nucleotide exchange factor 8 (GEF8) activity in Arabidopsis [J]. Functional Plant Biology, 2017, 44(10): 1029 − 1038.
    [17] CHOUDHURY S R, PANDEY S. Phosphatidic acid binding inhibits RGS 1 activity to affect specific signaling pathways in Arabidopsis [J]. The Plant Journal, 2017, 90(3): 466 − 477.
    [18] KOOIJMAN E E, CHUPIN V, de KRUIJFF B, et al. Modulation of membrane curvature by phosphatidic acid and lysophosphatidic acid [J]. Traffic, 2003, 4(3): 162 − 174.
    [19] TESTERINK C, MUNNIK T. Molecular, cellular, and physiological responses to phosphatidic acid formation in plants [J]. Journal of Experimental Botany, 2011, 62(7): 2349 − 2361.
    [20] LIN Feng, ZHENG Junming, XIE Yanhua, et al. Emerging roles of phosphoinositide-associated membrane trafficking in plant stress responses [J]. Journal of Genetics and Genomics, 2022, 49(8): 726 − 734.
    [21] ZHOU Xueyan, LI Jianfang, WANG Yiqiao, et al. The classical SOS pathway confers natural variation of salt tolerance in maize [J]. New Phytologist, 2022, 236(2): 479 − 494.
    [22] LI Wenyu, SONG Tengzhao, WALLRAD L, et al. Tissue-specific accumulation of pH-sensing phosphatidic acid determines plant stress tolerance [J]. Nature Plants, 2019, 5(9): 1012 − 1021.
    [23] RUSTEN T E, STENMARK H. Analyzing phosphoinositides and their interacting proteins [J]. Nature Methods, 2006, 3(4): 251 − 258.
    [24] IVANOVA P T, MILNE S B, MYERS D S, et al. Lipidomics: a mass spectrometry based systems level analysis of cellular lipids [J]. Current Opinion in Chemical Biology, 2009, 13(5/6): 526 − 531.
    [25] OLIVEIRA T G, CHAN R B, TIAN Huasong, et al. Phospholipase D2 ablation ameliorates Alzheimer’s disease-linked synaptic dysfunction and cognitive deficits [J]. Journal of Neuroscience, 2010, 30(49): 16419 − 16428.
    [26] CARMAN G M, HAN G S. Regulation of phospholipid synthesis in the yeast Saccharomyces cerevisiae [J]. Annual Review of Biochemistry, 2011, 80: 859 − 883.
    [27] ATHENSTAEDT K, DAUM G. Phosphatidic acid, a key intermediate in lipid metabolism [J]. European Journal of Biochemistry, 1999, 266(1): 1 − 16.
    [28] BOHDANOWICZ M, SCHLAM D, HERMANSSON M, et al. Phosphatidic acid is required for the constitutive ruffling and macropinocytosis of phagocytes [J]. Molecular Biology of the Cell, 2013, 24(11): 1700 − 1712.
    [29] KASSAS N, TRYOEN-TÓTH P, CORROTTE M, et al. Genetically encoded probes for phosphatidic acid [J]. Methods in Cell Biology, 2012, 108: 445 − 459.
    [30] JULKOWSKA M M, MCLOUGHLIN F, GALVAN-AMPUDIA C S, et al. Identification and functional characterization of the Arabidopsis Snf 1-related protein kinase SnRK 2.4 phosphatidic acid‐binding domain [J]. Plant,Cell &Environment, 2015, 38(3): 614 − 624.
    [31] FERRAZ-NOGUEIRA J P, DÍEZ-GUERRA F J, LLOPIS J. Visualization of phosphatidic acid fluctuations in the plasma membrane of living cells [J/OL]. PLoS One, 2014, 9(7): e102526[2023-05-30]. doi:10.1371/journal.pone.0102526.
    [32] KASSAS N, TANGUY E, THAHOULY T, et al. Comparative characterization of phosphatidic acid sensors and their localization during frustrated phagocytosis [J]. The Journal of Biological Chemistry, 2017, 292(10): 4266 − 4279.
    [33] NAKANISHI H, de LOS SANTOS P, NEIMAN A M. Positive and negative regulation of a SNARE protein by control of intracellular localization [J]. Molecular Biology of the Cell, 2004, 15(4): 1802 − 1815.
    [34] PLATRE M P, NOACK L C, DOUMANE M, et al. A combinatorial lipid code shapes the electrostatic landscape of plant endomembranes [J]. Developmental Cell, 2018, 45(4): 465 − 480.
    [35] LI Teng, XIAO Xingkai, LIU Qingyun, et al. Dynamic responses of PA to environmental stimuli imaged by a genetically encoded mobilizable fluorescent sensor [J/OL]. Plant Communications, 2022, 4(3): 100500[2023-05-30]. doi: 10.1016/j.xplc.2022.100500.
    [36] MUNNIK T, MEIJER H J G, TER RIET B, et al. Hyperosmotic stress stimulates phospholipase D activity and elevates the levels of phosphatidic acid and diacylglycerol pyrophosphate [J]. The Plant Journal, 2000, 22(2): 147 − 154.
  • [1] 冯蕊, 周琪, 吴令上, 朱玉球, 高燕会.  PEG 6000模拟干旱胁迫对铁皮石斛幼苗生理和叶绿素荧光特性的影响 . 浙江农林大学学报, 2024, 41(1): 132-144. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230301
    [2] 叶潇铃, 赵宇虹, 姜楠, 张敏, 张迟.  ‘无子瓯柑’E3泛素连接酶基因CsRNF217对转基因烟草育性的影响 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(6): 1181-1187. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220710
    [3] 林怡馨, 陈丹丹, 刘宏波, 柯星星, 郑月萍, 郑志富.  拟南芥和油菜3-磷酸甘油酰基转移酶的关键活性位点鉴定 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(4): 695-706. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220764
    [4] 柯星星, 刘亚坤, 徐雪珍, 林怡馨, 郑志富, 郑月萍.  功能丧失突变透示ATS1对拟南芥种子发育的非必需作用 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(4): 707-713. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220738
    [5] 李丹丹, 林蓉, 李新国, 郑月萍.  AtJAR1基因在拟南芥耐盐性中的功能分析 . 浙江农林大学学报, 2022, 39(5): 998-1009. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210742
    [6] 叶碧欢, 陈友吾, 舒金平, 张威, 张亚波, 李海波, 宋其岩.  竹林金针虫实时荧光定量PCR内参基因的筛选与应用 . 浙江农林大学学报, 2021, 38(3): 644-651. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20200492
    [7] 金迪, 张明如, 王佳佳, 高磊, 侯平.  遮光与水分胁迫对盆栽芒萁光合与叶绿素荧光参数的影响 . 浙江农林大学学报, 2020, 37(6): 1054-1063. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20190666
    [8] 王倩颖, 常鹏杰, 申亚梅, 张超, 董彬, 时宝柱.  景宁木兰热胁迫下实时荧光定量PCR内参基因的筛选 . 浙江农林大学学报, 2019, 36(5): 935-942. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2019.05.012
    [9] 石林, 吴瑗, 巴少波, 刘正奎, 陈琳, 王磊, 邵春艳, 孙静, 周莹姗, 王晓杜, 宋厚辉.  猪圆环病毒2型Taqman探针法实时荧光定量PCR检测方法的建立 . 浙江农林大学学报, 2018, 35(6): 1133-1138. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2018.06.018
    [10] 王金平, 张金池, 岳健敏, 尤炎煌, 张亮.  油菜素内酯对氯化钠胁迫下樟树幼苗光合色素和叶绿素荧光参数的影响 . 浙江农林大学学报, 2017, 34(1): 20-27. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.01.004
    [11] 李迎春, 郭子武, 杨清平, 岳永德, 陈双林.  河竹叶片叶绿素荧光和能量耗散对持续淹水胁迫的响应 . 浙江农林大学学报, 2017, 34(5): 878-886. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.05.015
    [12] 李国栋, 田曼青, 沈仁芳.  拟南芥独脚金内酯突变体叶绿素荧光特性分析 . 浙江农林大学学报, 2017, 34(1): 36-41. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.01.006
    [13] 付建新, 张超, 王艺光, 赵宏波.  桂花组织基因表达中荧光定量PCR内参基因的筛选 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(5): 727-733. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.05.001
    [14] 张丽清, 陈霞, 胡海超, 张俊艇, 官慧谦, 刘庆坡.  miR3979在水稻砷耐受性中的作用 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(4): 571-580. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.04.004
    [15] 施泉, 陈晓沛, 林新春, 徐永汉, 徐英武.  雷竹和拟南芥SOC1多聚体差异性分析 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(2): 183-190. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.02.001
    [16] 周佳平, 林新春, 徐英武.  拟南芥SEPALLATA3蛋白质原核表达与纯化 . 浙江农林大学学报, 2014, 31(1): 14-18. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.01.003
    [17] 刘志梅, 蒋文伟, 杨广远, 黄建荣.  干旱胁迫对3种金银花叶绿素荧光参数的影响 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(4): 533-539. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.04.008
    [18] 乔桂荣, 栾维江, 潘红伟, 卓仁英.  利用农杆菌介导法获得RNAi转基因枫香的研究 . 浙江农林大学学报, 2007, 24(2): 140-144.
    [19] 哀建国, 杨勇.  RNA 介导的植物基因沉默作用及其应用 . 浙江农林大学学报, 2005, 22(1): 123-128.
    [20] 温国胜, 王林和, 张国盛.  干旱胁迫条件下臭柏的气体交换与荧光特征 . 浙江农林大学学报, 2004, 21(4): 361-365.
  • 加载中
  • 链接本文:

    https://zlxb.zafu.edu.cn/article/doi/10.11833/j.issn.2095-0756.20230355

    https://zlxb.zafu.edu.cn/article/zjnldxxb/2024/1/104

图(7) / 表(1)
计量
  • 文章访问数:  175
  • HTML全文浏览量:  31
  • PDF下载量:  12
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2023-06-08
  • 修回日期:  2023-07-27
  • 录用日期:  2023-07-28
  • 网络出版日期:  2024-01-19
  • 刊出日期:  2024-02-20

拟南芥磷脂酸荧光探针的构建及应用

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
    基金项目:  国家自然科学基金青年基金资助项目(32100209);浙江省自然科学基金青年基金资助项目(Q21C020003);国家自然科学基金面上基金资助项目(31871660)
    作者简介:

    马疏言(ORCID: 0009-0007-5802-6691),从事植物生理生化与代谢调控研究。E-mail: 1531861619@qq.com

    通信作者: 郑志富(ORCID: 0000-0002-8247-5629),教授,从事植物生化和代谢研究。E-mail: zzheng@zafu.edu.cn
  • 中图分类号: Q946.5

摘要:   目的  磷脂酸(PA)是甘油脂生物合成的前体,又是参与植物生长发育调节和各种逆境响应的重要信使物质,然而目前对植物细胞中PA含量动态变化的了解十分有限。本研究试图构建一种能有效监测植物细胞PA含量变化的荧光探针,并用之测定盐碱胁迫过程中胞内PA含量的变化。  方法  将Spo20p蛋白中高度专一的PA结合域相对应的核苷酸序列与绿色荧光蛋白基因融合,经遗传转化获得携带该融合基因的转基因拟南芥Arabidopsis thaliana株系,其表达受组成型启动子UBQ10驱动,产生的融合蛋白成为专一结合PA的荧光探针。随后,运用该荧光探针监测盐碱胁迫下胞内PA含量的变化。  结果  构建获得7个不同的纯合、单插入位点转基因拟南芥株系。实时荧光定量PCR (RT-qPCR)分析显示:不同株系中融合基因的表达量存在差异。不同浓度外源PA处理试验显示:随着表达量的升高,PA探针可有效监测到2 μmol·L−1 PA处理根尖10 min后细胞中PA含量的变化;而当PA探针表达量较低时,对PA监测灵敏度显著下降,表明在一定程度上荧光探针对PA监测的灵敏度与其表达量相关联。运用PA荧光探针发现:盐碱胁迫处理根尖5 min即可诱导质膜上或胞内PA的积累,暗示PA在植物早期盐碱胁迫响应中可能产生重要作用。  结论  本研究构建了一种可对细胞内PA含量进行有效监测的荧光探针,该探针可用于监测植物盐碱胁迫早期响应过程中胞内PA水平的变化,从而为早期逆境响应研究提供新工具。图7表1参36

English Abstract

马疏言, 郑月萍, 郑志富. 拟南芥磷脂酸荧光探针的构建及应用[J]. 浙江农林大学学报, 2024, 41(1): 104-112. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
引用本文: 马疏言, 郑月萍, 郑志富. 拟南芥磷脂酸荧光探针的构建及应用[J]. 浙江农林大学学报, 2024, 41(1): 104-112. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
MA Shuyan, ZHENG Yueping, ZHENG Zhifu. Generation and application of a fluorescent probe for phosphatidic acid in Arabidopsis thaliana[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2024, 41(1): 104-112. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
Citation: MA Shuyan, ZHENG Yueping, ZHENG Zhifu. Generation and application of a fluorescent probe for phosphatidic acid in Arabidopsis thaliana[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2024, 41(1): 104-112. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230355
  • 磷脂酸(phosphatidic acid,PA)是一种常见的细胞甘油磷脂,也是最简单的膜脂之一[1]。几乎所有生物体内都会产生PA,包括酵母[2]、动物[3]和植物[4]等。在植物中PA的合成主要包括2种方式:第1种是从头合成途径,3-磷酸甘油先后在3-磷酸甘油酰基转移酶和溶血磷脂酸脂酰基转移酶的作用下发生连续2步酰化反应生成PA,这也是PA合成的主要途径[5];第2种是磷脂的降解途径,磷脂降解又可分为2种,一种是磷脂酶D通过水解某些结构磷脂直接生成PA[69],另一种是磷脂酶C通过水解磷脂酰肌醇生成二脂酰甘油[10],继而经二脂酰甘油激酶磷酸化生成PA[11]。PA作为一种结构膜脂,磷酸基团头部能够以“静电/氢键开关模型”的方式与蛋白质结合[12]。在该模型中,PA结合蛋白中带正电荷的碱性氨基酸残基[1317],可以吸引磷脂双分子层上的负电荷,并通过静电作用影响膜环境,继而与PA头部的磷酸基团形成氢键,产生一个稳定的蛋白质结合位点。PA这种携带负电荷并且在生理条件下呈圆锥体的独特分子构型[18],使得PA结合蛋白的结构域能够特异性的与其结合,保证了生物膜结构的稳定和功能的发挥。除了作为膜脂的一个结构成分以及甘油脂合成的前体物质,PA还是一个关键信号分子,在多种生物学过程中发挥重要作用。正常条件下,行使信号功能的PA含量甚微;在植物应答各种生物与非生物胁迫过程中PA水平则会迅速升高,但这种积累往往是短暂的。这说明生物体拥有一套严格控制信号分子PA含量的机制,这对调节PA信号传递强度、维持细胞物质与能量代谢的动态平衡至关重要[1922]

    尽管PA拥有多种功能,但目前对于细胞内PA含量的动态变化仍知之甚少,这主要受PA检测手段的限制。过去主要采用诸如薄层层析、高效液相色谱和放射性同位素标记等理化手段对其含量进行测定[23]。近年来,质谱分析技术的应用使得对包括PA在内的各种脂质的测定更准确和高效[2425]。然而,这些理化手段都只能对组织器官中PA总量与种类进行定量或定性分析,无法捕捉细胞内PA的动态与瞬时变化信息。通常认为,内质网上的PA含量相对较高,这有助于促进磷脂和三酰甘油的合成[2627];而质膜和细胞器中行使信号功能的PA含量甚微。显然,采用理化测定会掩盖胞内PA的真实变化。因此,亟需开发一种能可视化分析细胞内PA的工具。

    大量研究表明:生物体中PA结合蛋白种类繁多,这些蛋白中的PA结合域(phosphatidic acid binding domains,PABD)结构亦存在差异。其中一些PABD因与PA结合专一性强,被用来开发多种PA探针 [2833]。酵母蛋白Spo20p中的PA结合域已被证实具有极强的专一性[33],只结合PA而不结合其他磷脂。目前基于这一PABD所开发的PA探针在医学研究中应用广泛,但在植物中的应用却有限[34]。因此,本研究旨在构建基于Spo20p中的PABD的植物PA荧光探针,为剖析植物早期应答逆境胁迫的细胞分子机制提供新工具。

    • 将拟南芥Arabidopsis thaliana种子置于含有湿润滤纸的培养皿中,4 ℃冰箱内避光放置3 d后将其点播在湿润的土壤基质上(V营养土V蛭石V珍珠岩=3∶1∶1)。将播种后的盆栽用透明塑料盖覆盖,置于24~25 ℃室温、50%~60%湿度、14 h光照/10 h黑暗的植物培养箱中培养,7 d后揭去塑料盖间苗。

    • 将拟南芥种子进行消毒,加入适量灭菌过的蒸馏水,在4 ℃冰箱内避光放置3 d,点播在1/2 MS培养基上,置于植物培养间中培养。

    • 酵母蛋白Spo20p中存在一个高度专一的PA结构域(PABD),该PABD由40个氨基酸残基构成,只结合PA而不结合其他磷脂[3334],因此,本研究选择该PABD与荧光蛋白融合,构建PA荧光探针。根据PAPD核苷酸序列[33]设计引物(表1)进行PCR扩增,获得与该PABD相对应的DNA片段;同时PCR扩增获得GFP基因编码区序列。随后,利用无缝克隆试剂盒(生工),将GFPPABD片段克隆至植物表达载体pSY06的限制性内切酶位点Kpn I和Pst I之间,获得重组质粒pSY06-GFP-PABDPABD连接至GFP基因编码区的3′端,构成GFP-PABD融合基因,该融合基因的表达由组成型启动子UBQ10驱动。重组质粒中的插入片段经菌落PCR、Kpn I和Pst I双酶切以及测序验证正确后,采用热激法将质粒转化至农杆菌Agrobacterium tumefaciens GV3101,用于后续拟南芥遗传转化。

      表 1  相关引物序列

      Table 1.  Sequence of related primers

      用途引物名称引物序列(5′→3′)
      PABD基因合成 ZYP301 CCTGCTAATTTCAAGGCTAATTCATTGCTGTTCGCTCGAGATCTGAGTCCGGACTGCAGGTTGGATCCGGTACCGAGCT
      ZYP302 GAAGACGTGATAGGCTACATGTGAAGCTTAAATCCTTGAGGAATAAAATCCACAAACAACTTCACCCAAA
      ZYP303 TGCTTCCTGAACAATTGTCCATTCTAGATTCTGTCTTGTTGATATCAAGACCTGCTAATTTCAAGGCTAA
      ZYP304 GTACCCAAGCTTCACATGTAGCCTATCACGTCTTCTGCTTCCTGAACAATTGTCC
      ZYP305 CACAAACAACTTCACCCAAACTGTCGGTTCGATGACGCCACTAAGACTAGTTAAGGTACCGGCGTAATCATGGTC
      PABD基因克隆 ZYP308 TCCGGACTCAGATCTCGAGC
      ZYP309 AGCTATAGTTCTAGATCTAGATTAACTAGTCTTAGTGGCGTC
      GFP基因克隆 ZYP306 TATCGATGGCGCCAGCTGAGGATGGTGAGCAAGGGCGA
      ZYP307 AGATCTGAGTCCGGACTTGTACAGCTCGTCCATCCGGACTCAGATCTCGAGC
      转基因拟南芥鉴定 MSY01 TGGTGTTAGTTTCTAGTTTGTGCG
      MSY02 TCATCATGACAGATCTGCGC
      表达量分析 ZYP389 GACCACTACCAGCAGAACACC
      ZYP390 CTTGTACAGCTCGTCCATGC
    • 以哥伦比亚野生型拟南芥(WT)为植物材料,利用农杆菌花序侵染法转化拟南芥。将获得的T1代拟南芥种子进行表面消毒,均匀铺在含有草铵膦(10 mg·L−1)和特美汀(50 mg·L−1)的1/2 MS筛选培养基上进行筛选。将具有除草剂抗性的阳性苗移栽到土壤中继续培养,3周后提取叶片DNA并设计引物(表1)进行PCR鉴定,对T2和T3代转基因株系进行除草剂抗性的遗传分析,最终筛选得到纯合单插入位点转基因株系。

    • 以在1/2 MS培养基中生长7 d的转基因拟南芥根系作为测定材料,使用高纯度RNA提取试剂盒(全式金)提取RNA并对其进行纯度检测和浓度测定。取等量RNA,使用反转录试剂盒(翌圣)进行单链cDNA的合成。选择拟南芥肌动蛋白基因Actin为内参基因,设计引物(表1)进行实时荧光定量PCR (RT-qPCR),并对数据采用2−∆∆Ct法进行分析。

    • 将野生型和转基因株系种子点播在1/2 MS方形培养基上,竖直培养6 d后,挑选长势均匀一致的幼苗(每个基因型,20株),分别转移至含有0和50 mmol·L−1 NaCl的1/2 MS固体培养基中继续竖直培养,7 d后观察表型。

    • 将在1/2 MS方形培养基上竖直培养6 d的幼苗分别浸泡在含有0、2和10 μmol·L−1 PA的1/2 MS液体培养基中,依次处理5、10、15和20 min后,利用荧光显微镜(ZEISS,Axio Imager 2)对拟南芥根尖分生区PA的分布进行观察并拍照。

    • 将含PA荧光探针的拟南芥转基因株系种子点播在1/2 MS方形培养基上,竖直培养6 d,选择均匀一致的幼苗分别浸泡在含有100 mmol·L−1 NaCl、10 mmol·L−1 NaHCO3和兼含两者的1/2 MS液体培养基中,处理5、10和15 min后用荧光显微镜观察根尖分生区PA的分布。

    • 图1所示:该载体以pSY06为骨架,由35S 启动子驱动植物选择标记基因——草铵膦抗性基因(bar)的表达,而GFP-PABD融合基因的表达则由UBQ10启动子驱动。

      图  1  pSY06-GFP-PABD载体图

      Figure 1.  Vector diagram of pSY06-GFP-PABD

      采用农杆菌花序侵染法将GFP-PABD融合基因转入拟南芥,获得T1代转基因种子。对T1代幼苗进行草铵膦(10 mg·L−1)抗性筛选与PCR鉴定,获得56个含融合基因的独立转基因株系。随后,对相应株系的T2代幼苗(每个株系约300株)继续进行草铵膦除草剂抗性筛选。卡方测验显示:符合3(阳性苗数)∶1(阴性苗数)分离规律的株系共8个,这些株系为含单插入位点的转基因株系。再对T2代各个株系不同植株的自交后代(T3代)进行除草剂抗性筛选,最终获得7个纯合、单插入位点转基因拟南芥株系,分别为8-1、11-1、13-12、25-5、42-4、48-1和53-1。

    • 为了明确不同转基因株系PA荧光探针表达量的差异,对上述7个转基因株系进行了目的基因的表达量测定。RT-qPCR结果(图2)显示:当将转基因株系8-1中融合基因的相对表达量设为参考值“1”,其余6个株系(11-1、13-12、25-5、42-4、48-1和53-1)的相对表达量分别为1.74、15.91、0.72、1.06、1.69和1.52。株系13-12的PA探针的表达量最高,是其他株系的9~22倍,为PA探针高表达转基因株系;相应地,将株系48-1作为PA探针低表达材料。

      图  2  不同转基因拟南芥株系中GFP-PABD融合基因的相对表达量

      Figure 2.  Relative expression level of the GFP-PABD fusion gene in transgenic A. thaliana lines

    • 为了明确PA荧光探针的表达是否会对植物生长发育产生影响,比较分析了野生型拟南芥和不同转基因株系在整个生长发育周期的表型差异。土培生长实验显示:野生型与转基因拟南芥株系的叶片生长无明显差异,高表达转基因株系(13-12)与低表达转基因株系(48-1)之间亦无可见表型差异(图3A)。另外,在含有0和50 mmol·L−1 NaCl的1/2 MS培养基中生长时,野生型与不同转基因株系之间也未表现出生长速率的差异(图3B)。这些结果说明:在一定范围内PA荧光探针的表达不会影响拟南芥的正常生长发育,这一特性有助于合理解释特定条件下胞内PA变化对植物生长发育产生的影响。

      图  3  野生型拟南芥与3个PA荧光探针转基因株系的表型比较

      Figure 3.  Phenotypic comparison between wild type and three transgenic lines of A. thaliana bearing PA fluorescent probe

    • 随着荧光探针表达量的增加,细胞内的荧光强度也会增强,这会导致PA检测的信噪比下降;相反,荧光探针表达量过低则会影响PA检测的灵敏度。为了获得检测灵敏度和信噪比都较高的PA荧光探针,用不同浓度的外源PA处理荧光探针表达量存在差异的转基因株系,进而在荧光显微镜下观察根尖PA的积累情况。结果(图4~6)显示:野生型拟南芥在有、无外源PA处理下,根尖细胞自发荧光的强度无明显差别。另外,在不同浓度外源PA处理下,荧光探针低表达的转基因株系(48-1)的根尖分生区的PA含量变化未能被捕捉到。相反,对于荧光探针高表达的转基因株系(13-12),2和10 μmol·L−1 PA分别处理10 和5 min后,其根尖分生区细胞的胞内或质膜上的PA积累清晰可见(图5)。当外源PA浓度低时,随着处理时间延长,细胞中PA积累减少(图5),这很可能是因为作为甘油脂合成前体物质的PA已被转化为其他物质。而当外源PA浓度升至10 μmol·L−1时,处理10、20 min后依然可见细胞中的PA呈点状分布(图6)。这些结果说明:荧光探针表达量较高的转基因株系(13-12)可被用于监测细胞中PA含量的变化。

      图  4  无外源PA处理下PA探针在野生型和2个转基因拟南芥株系根尖中荧光强度的差异分析

      Figure 4.  Analysis of discrepancy in fluorescent intensity of PA probe between wild type and two transgenic lines of A. thaliana

      图  5  外源PA(2 μmol·L−1)处理下PA荧光探针对PA监测灵敏度的分析

      Figure 5.  Sensitivity analysis of PA fluorescent probe monitoring PA under treatment with 2 μmol·L−1 exogenous PA

      图  6  外源PA (10 μmol·L−1)处理下PA荧光探针对PA监测灵敏度的分析

      Figure 6.  Sensitivity analysis of PA fluorescent probe monitoring PA under treatment with 10 μmol·L−1 exogenous PA

    • 为了进一步验证 PA荧光探针的实用性,利用荧光探针表达量较高的转基因株系(13-12)检测盐碱胁迫条件下根尖细胞中PA含量的变化。结果显示:盐、碱单独或混合处理转基因株系,5 min后即可在根尖分生区细胞中观察到PA的点状分布(图7)。因此推断,本研究构建的PA荧光探针可用于监测逆境条件下植物细胞中PA含量的变化。另外,盐碱胁迫可快速诱导PA积累这一现象表明在植物早期逆境响应中PA发挥某种重要作用。

      图  7  单独或混合盐碱胁迫下PA在转基因拟南芥根尖分生组织中的分布

      Figure 7.  Distribution of PA in the root tip meristem of a transgenic A. thaliana line bearing PA sensor under saline and alkaline stresses, alone or in combination

    • 已知PA在植物生长发育与逆境响应过程中发挥重要作用,但由于缺乏PA的可视化分析工具,对细胞中PA含量动态变化的了解十分有限。这一方面限制了PA作用机制的研究,另一方面给评估基因工程手段操控植物细胞PA含量变化所产生的实际应用效果带来困难。因此,本研究将酵母蛋白Spo20p中对PA高度专一的结合域与荧光蛋白融合,成功构建了可对细胞内PA进行可视化检测的荧光探针。

      为了使荧光探针适用于监测整个生长周期不同组织细胞中的PA水平,选择组成型表达启动子UBQ10驱动GFP-PABD融合基因的表达。研究发现:植物细胞中PA的检测灵敏度与PA荧光探针的表达量密切相关,表达量较高的荧光探针可有效检测到外源PA处理带来的胞内PA水平的变化,而表达量较低的探针检测效果则相反。如13-12株系中PA荧光探针的表达量高于其他株系,该株系经2 μmol·L−1外源PA处理10 min,其根尖细胞中PA的点状分布即可被观察到,这也说明外源PA能够被拟南芥根尖快速吸收,继而与PA荧光探针结合。鉴于已有研究中常用浓度高于10 μmol·L−1的外源PA检测PA探针的灵敏度[35],本研究中构建的荧光探针可有效监测到2 μmol·L−1外源PA处理所带来的细胞内PA含量的变化,推测基于13-12转基因株系的PA荧光探针具有较高的PA检测灵敏度。

      需要指出的是,PA荧光探针使用过程中,样品处理时间的延长和观察光源的增强均会使植物细胞造成某种损伤,导致细胞产生自发荧光,从而降低PA检测的信噪比。因此在实验过程中,需尽量缩短植物样本的制片时间及荧光观察的时间,以提高观察结果的真实性。

      盐碱地中盐和碱是2种共存但不同的非生物胁迫,共同影响植物的正常生长发育。利用本研究构建的PA荧光探针发现:盐胁迫处理5 min就会造成PA在细胞中的积累,这与已有的研究结果一致[22, 36]。同时,碱胁迫和盐碱混合胁迫也会快速诱导PA的积累。因此,为了全面了解植物早期逆境响应机制,有必要监测早期细胞中PA含量的动态变化。本研究开发的PA荧光探针为这些方面的研究提供了重要技术支撑。

    • 本研究成功构建了一种基于酵母蛋白Spo20p中PA结合域的荧光探针,可有效监测植物细胞中PA含量变化。应用该探针发现盐碱胁迫可快速诱导拟南芥根尖细胞质膜上和胞内PA的积累,这一结果表明PA在植物对盐碱胁迫早期应答过程中发挥重要作用。

参考文献 (36)

目录

    /

    返回文章
    返回