云南尼泊尔桤木遗传多样性研究

李洁; 熊智; 张成刚

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云南尼泊尔桤木遗传多样性研究

李洁 , 熊智 , 张成刚

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李洁, 熊智, 张成刚. 云南尼泊尔桤木遗传多样性研究[J]. 浙江农林大学学报, 2008, 25(1): 16-21.

引用本文:

李洁, 熊智, 张成刚. 云南尼泊尔桤木遗传多样性研究[J]. 浙江农林大学学报, 2008, 25(1): 16-21.

LI Jie, XIONG Zhi, ZHANG Cheng-gang. Genetic diversity of Alnus nepalensis in Yunnan revealed by RAPD-PCR[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2008, 25(1): 16-21.

Citation:

LI Jie, XIONG Zhi, ZHANG Cheng-gang. Genetic diversity of Alnus nepalensis in Yunnan revealed by RAPD-PCR[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2008, 25(1): 16-21.

云南尼泊尔桤木遗传多样性研究

李洁¹,
熊智^1, ,,
张成刚²

1.
西南林学院资源学院, 云南昆明 650224;
2.
中国科学院沈阳应用生态研究所, 辽宁沈阳 110015

基金项目:

国家重点基础研究发展计划(“973”计划)资助项目(001CB1089)

详细信息

作者简介: 李洁,硕士研究生,从事植物生物技术研究。E-mail:lijietaren@163.com。

通信作者: 熊智,副教授,从事植物生物技术和微生物生态学研究。E-mail:Zhix@swfc.edu.cn

中图分类号: S792.14

Genetic diversity of Alnus nepalensis in Yunnan revealed by RAPD-PCR

1.
Resources Faculty, Southwest Forestry College, Kunming 650224, Yunnan, China;
2.
Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Science, Shenyang 110015, Liaoning, China

摘要: 分别在云南省来凤山、高黎贡山、鸡足山、苍山和无量山,采集58个尼泊尔桤木Alnus nepalensis叶样品,提取总DNA,对它们进行RAPD-PCR分析。3个随机引物共扫描到DNA位点85个,其中多态性位点64个,样品内的多态性为75.30%;用非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立尼泊尔桤木分子聚类树状图,以相似系数0.68为标准分为6类;用POPGENE软件分析Nei's遗传多样性指数和Shannon遗传多样性指数。结果表明:云南尼泊尔桤木遗传多样性丰富,其中,鸡足山尼泊尔桤木居群多样性指数最高,无量山居群中,分布在南坡的尼泊尔桤木多样性指数高于分布于北坡的样品。尼泊尔桤木的分布及遗传结构与环境区域有密切的关系,区域特点是决定尼泊尔桤木遗传多样性水平的重要因子之一。该结果对于研究尼泊尔桤木遗传多样性以及它与共生固氮弗兰克氏菌Frankia的协同进化有一定的利用价值。
- 林木遗传育种学 /
- 尼泊尔桤木 /
- 遗传多样性 /
- 随机扩增多态DNA(RAPD)
Abstract: Alnus nepalensis is the oldest species of Betulaceae, mainly distributed in Yunnan Province, which can fix nitrogen. The objective is to study its genetic diversity and assess its resources. In Yunnan Province 58 naturally occurring samples of A.nepalensis were collected from Laifeng, Gaoligong, Jizu, Cang, and Wuliang Mountains. The genomic DNA of A.nepalensis was as extracted by the cetyltrimethylammonium bromide(CTAB) method,and their DNA polymorphism was analyzed by random amplification of polymorphic DNA(RAPD)-polymerase chain reaction(PCR) with 3 optimum primers. A total of 85 DNA bands were amplified, and a DNA molecular UPGMA(unweighted pair group method using arithmetic averages) dendrogram was established. Also, for the samples,Nei's gene diversity and Shannon's information index were computed by POPGENE software Numerical Taxonomy SYStem(NTSYS) software. Results indicated that 64 of the 85 DNA bands(75.3%) were polymorphic, and with the dendrogram A.nepalensis samples were placed into 6 groups with a standard similarity coefficient of 0.68. A.nepalensis possessed abundant genetic diversity with the highest diversity found in the Jizu Mountains. In the Wuliang Mountains genetic diversity of A.nepalensis was richer along the southern slope than the northern. Also, a close relationship between the genetic structure of A.nepalensis and the environment was shown with genetic diversity.
- forest breeding /
- Alnus nepalensis /
- genetic diversity /
- random amplification of polymorphic DNA(RAPD)

[1]	邓莉丽, 刘青华, 周志春, 高凯, 骆定会. 抗松材线虫病马尾松种质资源遗传多样性分析及核心种质构建 . 浙江农林大学学报, 2024, 41(1): 67-78. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230333
[2]	黄锦春, 万思琦, 陈扬, 李丽红, 张自力, 朱建军, 吴梅, 邢丙聪, 邵清松, 陆晨飞. 利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(1): 22-29. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220473
[3]	李亚萍, 戴惠明, 姜武, 陈家栋, 段晓婧, 陶正明. 基于SRAP标记的不同产区黄精的遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(3): 658-664. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220436
[4]	王洁, 朱锡彭, 王腾斐, 朱建军, 李文俊, 邢丙聪, 郑颖. 白及种质资源遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(2): 321-329. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210690
[5]	郑刘辉, 詹利云, 侯宇, 喻卫武, 曾燕如, 戴文圣. 雄性榧树遗传多样性的SSR荧光标记分析 . 浙江农林大学学报, 2022, 39(2): 329-337. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210279
[6]	王黎, 徐郝, 俞云栋, 张海珍, 高燕会, 沈笑, 金晨莺, 陈轶敏. 基于SCoT标记的朱顶红品种遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2020, 37(5): 930-938. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20190614
[7]	王罗云, 何彩云, 罗红梅, 张建国, 段爱国, 曾艳飞. 沙棘7个亚种与26个重要品种的遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2019, 36(4): 670-677. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2019.04.006
[8]	柴晓娟, 郭玮龙, 陈慧, 王俊荣, 谢德志, 金水虎. 蔺草种质资源遗传多样性的ISSR分析 . 浙江农林大学学报, 2017, 34(3): 552-558. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.03.022
[9]	刘跃钧, 张媛, 蒋燕锋, 刘京晶. 黄精种质资源遗传多样性研究 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(6): 1085-1091. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.06.023
[10]	毕志宏, 魏敏静, 刘莹莹, 杨传平, 魏志刚. 样本数量对白桦群体遗传参数估算的影响 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(4): 564-570. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.04.003
[11]	徐沂春, 胡绍庆, 赵宏波. 基于AFLP分子标记的不同类型野生桂花种群遗传结构分析 . 浙江农林大学学报, 2014, 31(2): 217-223. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.02.009
[12]	吴月燕, 陶巧静, 李波, 许丹叶. 西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
[13]	张振, 张含国, 张磊, 朱航勇, 李雪峰. 兴安落叶松基本群体与育种群体RAPD多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(1): 130-136. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.022
[14]	高燕会, 樊民亮, 骆文坚, 黄华宏, 童再康. 濒危树种金钱松RAPD体系的建立和遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2011, 28(5): 815-822. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.05.023
[15]	范繁荣. 濒危植物白桂木的遗传多样性研究 . 浙江农林大学学报, 2010, 27(2): 266-271. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.02.017
[16]	王祖良, 丁丽霞, 赵明水, 程晓渊, 沈乾. 濒危植物天目铁木遗传多样性的RAPD分析 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 304-308.
[17]	曹福亮, 花喆斌, 汪贵斌, 张往祥. 野生银杏资源群体遗传多样性的RAPD分析 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(1): 22-27.
[18]	付顺华, 董汝湘, 吴隆高, 冯建民, 刘伟宏, 华朝晖, 孙鸿有. 杉木种子园子代性状相关性研究 . 浙江农林大学学报, 2007, 24(3): 272-278.
[19]	骆文坚, 金国庆, 徐高福, 丰炳财, 冯建民, 罗小华. 柏木无性系种子园遗传增益及优良家系评选 . 浙江农林大学学报, 2006, 23(3): 259-264.
[20]	唐娟娟, 范义荣, 朱睦元. 黄山松群体遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2003, 20(1): 23-26.

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https://zlxb.zafu.edu.cn/article/id/2814

https://zlxb.zafu.edu.cn/article/zjnldxxb/2008/1/16

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云南尼泊尔桤木遗传多样性研究

1. 西南林学院资源学院, 云南昆明 650224;

2. 中国科学院沈阳应用生态研究所, 辽宁沈阳 110015

基金项目:

国家重点基础研究发展计划(“973”计划)资助项目(001CB1089)

作者简介:
李洁,硕士研究生,从事植物生物技术研究。E-mail:lijietaren@163.com。

通信作者: 熊智,副教授,从事植物生物技术和微生物生态学研究。E-mail:Zhix@swfc.edu.cn

收稿日期: 2007-01-05
修回日期: 2007-04-18
刊出日期: 2008-02-10

中图分类号: S792.14

关键词:

摘要: 分别在云南省来凤山、高黎贡山、鸡足山、苍山和无量山,采集58个尼泊尔桤木Alnus nepalensis叶样品,提取总DNA,对它们进行RAPD-PCR分析。3个随机引物共扫描到DNA位点85个,其中多态性位点64个,样品内的多态性为75.30%;用非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立尼泊尔桤木分子聚类树状图,以相似系数0.68为标准分为6类;用POPGENE软件分析Nei's遗传多样性指数和Shannon遗传多样性指数。结果表明:云南尼泊尔桤木遗传多样性丰富,其中,鸡足山尼泊尔桤木居群多样性指数最高,无量山居群中,分布在南坡的尼泊尔桤木多样性指数高于分布于北坡的样品。尼泊尔桤木的分布及遗传结构与环境区域有密切的关系,区域特点是决定尼泊尔桤木遗传多样性水平的重要因子之一。该结果对于研究尼泊尔桤木遗传多样性以及它与共生固氮弗兰克氏菌Frankia的协同进化有一定的利用价值。

English Abstract

Genetic diversity of Alnus nepalensis in Yunnan revealed by RAPD-PCR

1. Resources Faculty, Southwest Forestry College, Kunming 650224, Yunnan, China;

2. Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Science, Shenyang 110015, Liaoning, China

Received Date: 2007-01-05
Rev Recd Date: 2007-04-18
Publish Date: 2008-02-10

Keywords:

forest breeding /
Alnus nepalensis /
genetic diversity /
random amplification of polymorphic DNA(RAPD)

Abstract: Alnus nepalensis is the oldest species of Betulaceae, mainly distributed in Yunnan Province, which can fix nitrogen. The objective is to study its genetic diversity and assess its resources. In Yunnan Province 58 naturally occurring samples of A.nepalensis were collected from Laifeng, Gaoligong, Jizu, Cang, and Wuliang Mountains. The genomic DNA of A.nepalensis was as extracted by the cetyltrimethylammonium bromide(CTAB) method,and their DNA polymorphism was analyzed by random amplification of polymorphic DNA(RAPD)-polymerase chain reaction(PCR) with 3 optimum primers. A total of 85 DNA bands were amplified, and a DNA molecular UPGMA(unweighted pair group method using arithmetic averages) dendrogram was established. Also, for the samples,Nei's gene diversity and Shannon's information index were computed by POPGENE software Numerical Taxonomy SYStem(NTSYS) software. Results indicated that 64 of the 85 DNA bands(75.3%) were polymorphic, and with the dendrogram A.nepalensis samples were placed into 6 groups with a standard similarity coefficient of 0.68. A.nepalensis possessed abundant genetic diversity with the highest diversity found in the Jizu Mountains. In the Wuliang Mountains genetic diversity of A.nepalensis was richer along the southern slope than the northern. Also, a close relationship between the genetic structure of A.nepalensis and the environment was shown with genetic diversity.

李洁, 熊智, 张成刚. 云南尼泊尔桤木遗传多样性研究[J]. 浙江农林大学学报, 2008, 25(1): 16-21.

引用本文:

李洁, 熊智, 张成刚. 云南尼泊尔桤木遗传多样性研究[J]. 浙江农林大学学报, 2008, 25(1): 16-21.

LI Jie, XIONG Zhi, ZHANG Cheng-gang. Genetic diversity of Alnus nepalensis in Yunnan revealed by RAPD-PCR[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2008, 25(1): 16-21.

Citation:

LI Jie, XIONG Zhi, ZHANG Cheng-gang. Genetic diversity of Alnus nepalensis in Yunnan revealed by RAPD-PCR[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2008, 25(1): 16-21.

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云南尼泊尔桤木遗传多样性研究

作者简介: 李洁,硕士研究生,从事植物生物技术研究。E-mail:lijietaren@163.com。

通信作者: 熊智,副教授,从事植物生物技术和微生物生态学研究。E-mail:Zhix@swfc.edu.cn

Genetic diversity of Alnus nepalensis in Yunnan revealed by RAPD-PCR

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云南尼泊尔桤木遗传多样性研究

1. 西南林学院资源学院, 云南昆明 650224; 2. 中国科学院沈阳应用生态研究所, 辽宁沈阳 110015

作者简介: 李洁,硕士研究生,从事植物生物技术研究。E-mail:lijietaren@163.com。

通信作者: 熊智,副教授,从事植物生物技术和微生物生态学研究。E-mail:Zhix@swfc.edu.cn

English Abstract

Genetic diversity of Alnus nepalensis in Yunnan revealed by RAPD-PCR

1. Resources Faculty, Southwest Forestry College, Kunming 650224, Yunnan, China; 2. Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Science, Shenyang 110015, Liaoning, China

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1. 西南林学院资源学院, 云南昆明 650224;

2. 中国科学院沈阳应用生态研究所, 辽宁沈阳 110015

作者简介:
李洁,硕士研究生,从事植物生物技术研究。E-mail:lijietaren@163.com。

1. Resources Faculty, Southwest Forestry College, Kunming 650224, Yunnan, China;

2. Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Science, Shenyang 110015, Liaoning, China