我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化

顾翠花; 王守先; 张启翔

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我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化

顾翠花 , 王守先 , 张启翔

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顾翠花, 王守先, 张启翔. 我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 298-303.

引用本文:

顾翠花, 王守先, 张启翔. 我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 298-303.

GU Cui-hua, WANG Shou-xian, ZHANG Qi-xiang. Optimization of AFLP molecular marker system in Lagerstroemia plants in China[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2008, 25(3): 298-303.

Citation:

GU Cui-hua, WANG Shou-xian, ZHANG Qi-xiang. Optimization of AFLP molecular marker system in Lagerstroemia plants in China[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2008, 25(3): 298-303.

我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化

1.
北京林业大学园林学院, 北京 100083;
2.
浙江林学院信息工程学院, 浙江临安 311300;
3.
北京林业大学国家花卉工程技术中心, 北京 100083

基金项目:

“十一五”国家科技攻关计划项目(2004BA525B11)

详细信息

作者简介: 顾翠花,博士研究生,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:gchwsx11@126.com。

通信作者: 张启翔,教授,博士生导师,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:zqx@bjfu.edu.cn

中图分类号: S718.4

Optimization of AFLP molecular marker system in Lagerstroemia plants in China

1.
College of Landscape Architecture, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China;
2.
School of Information Engineering, Zhejiang Forestry College, Lin'an 311300, Zhejiang, China;
3.
State Flower Engineering Center, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China

摘要: 以采自广西、云南和河南等地的紫薇属Lagerstroemia植物紫薇L. indica,南紫薇L. subcostata,福建紫薇L. limii和桂林紫薇L. guilinensis叶片为材料,利用改良CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法提取叶片基因组DNA,获得了高质量的紫薇叶片DNA,并以其基因组DNA为模板进行了酶切连接,利用酶切连接的产物稀释一定倍数作为预扩增的模板,最后以稀释一定倍数的预扩增产物进行选择性扩增,进行紫薇和南紫薇的AFLP(扩增片段长度多态性)银染反应体系的优化。AFLP体系中每一步反应都设置了不同的反应体系,采用了160对引物作为初选引物,筛选出了10对适合紫薇基因组扩增的引物。结果表明,适宜紫薇基因组扩增的最佳酶切、预扩增和选择性扩增体系为:酶切连接体系1;预扩体系3;选扩体系3,反应体系中Mg2+质量浓度为1.2×10-6 kg·L-1时扩增效果较好。
- 植物学 /
- 紫薇 /
- DNA提取 /
- AFLP /
- 分子标记
Abstract: This study dealt with optimization of amplified fragment length polymorphism(AFLP) analysis based on the high quality DNA extracted by the improved cetyl trimethyl ammonium bromide (CTAB) method from the leaves of Lagerstroemia indica,L.subcostata, L. limii and L. guilinensis which were gathered in Guangxi, Yunnan and Henan Province. And their DNA were used as the template to carry on restriction-ligase reaction, then the product was diluted the certain multiple as template to take pre-amplification, finally the product was diluted and used as template to carry on selective amplification, and the best system of restriction-ligase reaction, pre-amplication and silver staining suit for L.indica had been optimized. In the AFLP system each step of response had established different reacting system. The 10 pairs of primer suit for L.indica were selected from 160 pairs of elementary primer. The result indicated that, the best systems suitable for the Lagerstroemia gene group were as follows: restriction-ligase reaction system 1; pre-amplification system 3; selective amplification system 3, in reacting system the best Mg2+ concentration was 1.2×10-6 kg·L-1.
- botany /
- Lagerstroemia /
- DNA extraction /
- amplified fragment length polymorphism(AFLP) /
- molecular marker

[1]	黄锦春, 万思琦, 陈扬, 李丽红, 张自力, 朱建军, 吴梅, 邢丙聪, 邵清松, 陆晨飞. 利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(1): 22-29. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220473
[2]	尚林雪, 王群, 张国哲, 赵雨, 顾翠花. 紫薇LiCMB1基因的克隆及表达特性分析 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(2): 330-337. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220333
[3]	吴砚农, 郑伟尉, 陆伟杰, 臧运祥. 十字花科植物黄化突变特性及其分子机制研究进展 . 浙江农林大学学报, 2021, 38(2): 412-419. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20200132
[4]	魏玮, 李俊敏, 孙丽英, 戎均康, 周伟. 小麦黄花叶病抗性鉴定及抗性亲本简单重复序列 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(1): 71-79. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.010
[5]	徐沂春, 胡绍庆, 赵宏波. 基于AFLP分子标记的不同类型野生桂花种群遗传结构分析 . 浙江农林大学学报, 2014, 31(2): 217-223. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.02.009
[6]	伏建国, 刘金良, 杨晓军, 安榆林, 骆嘉言. 分子生物学技术应用于木材识别的研究进展 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(3): 438-443. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.03.022
[7]	伏建国, 刘金良, 杨晓军, 安榆林, 骆嘉言. 进口黄檀属木材DNA提取与分子鉴定方法初步研究 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(4): 627-632. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.025
[8]	周生财, 黄华宏, 童再康, 吴小林. 4种楠木AFLP反应体系优化建立 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(5): 789-796. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.05.024
[9]	何勇清, 方佳, 余敏芬, 方仲相, 江波, 潘寅辉, 郑炳松. 植物质膜内在水通道蛋白PIPs的分子生物学研究进展 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(3): 446-452. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.03.020
[10]	蒋燕锋, 斯金平, 黄华宏, 程龙军. 厚朴AFLP分子标记体系的建立 . 浙江农林大学学报, 2010, 27(2): 304-309. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.02.024
[11]	顾翠花, 王守先, 田苗. 紫薇品种数量分类研究 . 浙江农林大学学报, 2010, 27(6): 903-907. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.06.016
[12]	何沙娥, 张智俊. 适用于竹林土壤PCR-DGGE分析用的微生物总DNA提取及纯化方法 . 浙江农林大学学报, 2009, 26(2): 164-168.
[13]	张文婷, 谢福春, 王华田, 于文胜, 迟炳庆, 杜军, 宋黎, 姜成平. 3种园林灌木幼苗对干旱胁迫的生理响应 . 浙江农林大学学报, 2009, 26(2): 182-187.
[14]	郭金剑, 池伟, 赵鑫珠, 王丽, 曾燕如, 张秋月. 山核桃AFLP实验技术体系的建立 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(4): 532-537.
[15]	谢一青, 李志真, 黄儒珠, 肖祥希, 王志洁. 光皮桦基因组DNA 提取方法比较 . 浙江农林大学学报, 2006, 23(6): 664-668.
[16]	杨毅, 周祖基, 张立钦, 马良进, 林新春, 高洁. 寄生松墨天牛的球孢白僵菌不同菌株DNA多态性的RAPD 分析 . 浙江农林大学学报, 2005, 22(3): 306-309.
[17]	卓仁英. 竹子生物技术育种研究进展 . 浙江农林大学学报, 2003, 20(4): 424-428.
[18]	张立钦, 林新春, 毛胜凤. 绿僵菌不同菌株DNA 多态性的RAPD 分析 . 浙江农林大学学报, 2001, 18(3): 281-285.
[19]	方伟, 何祯祥, 黄坚钦, 史钱均, 林新春. 雷竹不同栽培类型RAPD 分子标记的研究 . 浙江农林大学学报, 2001, 18(1): 1-5.
[20]	何祯祥, 施季森, 邱进清, 肖石海. 林木遗传图谱构建的技术与策略 . 浙江农林大学学报, 1998, 15(2): 151-157.

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https://zlxb.zafu.edu.cn/article/id/2843

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我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化

1. 北京林业大学园林学院, 北京 100083;

2. 浙江林学院信息工程学院, 浙江临安 311300;

3. 北京林业大学国家花卉工程技术中心, 北京 100083

基金项目:

“十一五”国家科技攻关计划项目(2004BA525B11)

作者简介:
顾翠花,博士研究生,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:gchwsx11@126.com。

通信作者: 张启翔,教授,博士生导师,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:zqx@bjfu.edu.cn

收稿日期: 2007-04-09
修回日期: 2007-10-09
刊出日期: 2008-06-10

中图分类号: S718.4

关键词:

植物学 /
紫薇 /
DNA提取 /
AFLP /
分子标记

摘要: 以采自广西、云南和河南等地的紫薇属Lagerstroemia植物紫薇L. indica,南紫薇L. subcostata,福建紫薇L. limii和桂林紫薇L. guilinensis叶片为材料,利用改良CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)法提取叶片基因组DNA,获得了高质量的紫薇叶片DNA,并以其基因组DNA为模板进行了酶切连接,利用酶切连接的产物稀释一定倍数作为预扩增的模板,最后以稀释一定倍数的预扩增产物进行选择性扩增,进行紫薇和南紫薇的AFLP(扩增片段长度多态性)银染反应体系的优化。AFLP体系中每一步反应都设置了不同的反应体系,采用了160对引物作为初选引物,筛选出了10对适合紫薇基因组扩增的引物。结果表明,适宜紫薇基因组扩增的最佳酶切、预扩增和选择性扩增体系为:酶切连接体系1;预扩体系3;选扩体系3,反应体系中Mg2+质量浓度为1.2×10-6 kg·L-1时扩增效果较好。

English Abstract

Optimization of AFLP molecular marker system in Lagerstroemia plants in China

1. College of Landscape Architecture, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China;

2. School of Information Engineering, Zhejiang Forestry College, Lin'an 311300, Zhejiang, China;

3. State Flower Engineering Center, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China

Received Date: 2007-04-09
Rev Recd Date: 2007-10-09
Publish Date: 2008-06-10

Keywords:

botany /
Lagerstroemia /
DNA extraction /
amplified fragment length polymorphism(AFLP) /
molecular marker

Abstract: This study dealt with optimization of amplified fragment length polymorphism(AFLP) analysis based on the high quality DNA extracted by the improved cetyl trimethyl ammonium bromide (CTAB) method from the leaves of Lagerstroemia indica,L.subcostata, L. limii and L. guilinensis which were gathered in Guangxi, Yunnan and Henan Province. And their DNA were used as the template to carry on restriction-ligase reaction, then the product was diluted the certain multiple as template to take pre-amplification, finally the product was diluted and used as template to carry on selective amplification, and the best system of restriction-ligase reaction, pre-amplication and silver staining suit for L.indica had been optimized. In the AFLP system each step of response had established different reacting system. The 10 pairs of primer suit for L.indica were selected from 160 pairs of elementary primer. The result indicated that, the best systems suitable for the Lagerstroemia gene group were as follows: restriction-ligase reaction system 1; pre-amplification system 3; selective amplification system 3, in reacting system the best Mg2+ concentration was 1.2×10-6 kg·L-1.

顾翠花, 王守先, 张启翔. 我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 298-303.

引用本文:

顾翠花, 王守先, 张启翔. 我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 298-303.

GU Cui-hua, WANG Shou-xian, ZHANG Qi-xiang. Optimization of AFLP molecular marker system in Lagerstroemia plants in China[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2008, 25(3): 298-303.

Citation:

GU Cui-hua, WANG Shou-xian, ZHANG Qi-xiang. Optimization of AFLP molecular marker system in Lagerstroemia plants in China[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2008, 25(3): 298-303.

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我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化

作者简介: 顾翠花,博士研究生,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:gchwsx11@126.com。

通信作者: 张启翔,教授,博士生导师,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:zqx@bjfu.edu.cn

Optimization of AFLP molecular marker system in Lagerstroemia plants in China

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出版历程

我国紫薇属植物AFLP分子标记体系的优化

1. 北京林业大学园林学院, 北京 100083; 2. 浙江林学院信息工程学院, 浙江临安 311300; 3. 北京林业大学国家花卉工程技术中心, 北京 100083

作者简介: 顾翠花,博士研究生,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:gchwsx11@126.com。

通信作者: 张启翔,教授,博士生导师,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:zqx@bjfu.edu.cn

English Abstract

Optimization of AFLP molecular marker system in Lagerstroemia plants in China

1. College of Landscape Architecture, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China; 2. School of Information Engineering, Zhejiang Forestry College, Lin'an 311300, Zhejiang, China; 3. State Flower Engineering Center, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China

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1. 北京林业大学园林学院, 北京 100083;

2. 浙江林学院信息工程学院, 浙江临安 311300;

3. 北京林业大学国家花卉工程技术中心, 北京 100083

作者简介:
顾翠花,博士研究生,从事园林植物遗传育种研究。E-mail:gchwsx11@126.com。

1. College of Landscape Architecture, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China;

2. School of Information Engineering, Zhejiang Forestry College, Lin'an 311300, Zhejiang, China;

3. State Flower Engineering Center, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China