紫竹不同栽培类型<em>PPO</em>基因片段克隆及其SNP分析

肖国辉; 王弋; 娄永峰; 林新春; 郭小勤; 方伟

doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

肖国辉 , 王弋 , 娄永峰 , 林新春 , 郭小勤 , 方伟

文章导航 > 浙江农林大学学报 > 2013 > 30(4): 511-516

肖国辉, 王弋, 娄永峰, 林新春, 郭小勤, 方伟. 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(4): 511-516. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

引用本文:

肖国辉, 王弋, 娄永峰, 林新春, 郭小勤, 方伟. 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(4): 511-516. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

XIAO Guohui, WANG Yi, LOU Yongfeng, LIN Xinchun, GUO Xiaoqin, FANG Wei. Cloning and SNP analysis of PPO genes with cultivars of Phyllostachys nigra[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(4): 511-516. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

Citation:

XIAO Guohui, WANG Yi, LOU Yongfeng, LIN Xinchun, GUO Xiaoqin, FANG Wei. Cloning and SNP analysis of PPO genes with cultivars of Phyllostachys nigra[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(4): 511-516. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

1.
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江临安 311300

详细信息

通信作者: 郭小勤

Cloning and SNP analysis of PPO genes with cultivars of Phyllostachys nigra

1.
The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture，Zhejiang A & F University，Lin’an 311300，Zhejiang，China

More Information

Corresponding author: GUO Xiaoqin

摘要: 根据已报道的禾本科Poaceae植物PPO基因的保守序列（CuA和CuB区）设计1对引物，分别从紫竹Phyllostachys nigra 9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。序列分析显示：9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%，氨基酸水平上的一致性达到81.83%。在某些栽培类型，一年紫和沟槽紫，该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的单核苷酸多态性（SNP）位点，多数位点引起非同义突变。根据所测得的序列对紫竹不同栽培类型的亲缘关系进行了遗传多样性分析。图2表3参20
- 植物学 /
- 紫竹 /
- PPO基因 /
- 单核苷酸多态性（SNP） /
- 遗传多样性
Abstract: Polyphenol oxidase（PPO） fragments were cloned from cultivars of Phyllostachys nigra using a pair of primers designed according to a conserved region（CuA and CuB） of a PPO gene sequence in Poaceae family and analyzed with a sequence analysis. The genetic relationship of cultivars was also analyzed based on these fragments using DNAMAN software. Results of the sequence analysis showed that identity was 92.35% in nucleotide acid and 81.83% in amino acid. A truncated protein of the gene was found in some cultivars of P. nigra，such asOne-year-purpleandPurple Groove. Single?鄄nucleotide polymorphism（SNP） sites were also found among these sequences. This could lead to non-synonymous mutations.［Ch，2 fig. 3 tab. 20 ref.］
- botany /
- Phyllostachys nigra /
- polyphenol oxidase（PPO）gene /
- single-nucleotide polymorphism （SNP） /
- genetic relationship

[1]	邓莉丽, 刘青华, 周志春, 高凯, 骆定会. 抗松材线虫病马尾松种质资源遗传多样性分析及核心种质构建 . 浙江农林大学学报, 2024, 41(1): 67-78. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20230333
[2]	黄锦春, 万思琦, 陈扬, 李丽红, 张自力, 朱建军, 吴梅, 邢丙聪, 邵清松, 陆晨飞. 利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(1): 22-29. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220473
[3]	李亚萍, 戴惠明, 姜武, 陈家栋, 段晓婧, 陶正明. 基于SRAP标记的不同产区黄精的遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(3): 658-664. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220436
[4]	王洁, 朱锡彭, 王腾斐, 朱建军, 李文俊, 邢丙聪, 郑颖. 白及种质资源遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(2): 321-329. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210690
[5]	郑刘辉, 詹利云, 侯宇, 喻卫武, 曾燕如, 戴文圣. 雄性榧树遗传多样性的SSR荧光标记分析 . 浙江农林大学学报, 2022, 39(2): 329-337. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210279
[6]	王黎, 徐郝, 俞云栋, 张海珍, 高燕会, 沈笑, 金晨莺, 陈轶敏. 基于SCoT标记的朱顶红品种遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2020, 37(5): 930-938. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20190614
[7]	王罗云, 何彩云, 罗红梅, 张建国, 段爱国, 曾艳飞. 沙棘7个亚种与26个重要品种的遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2019, 36(4): 670-677. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2019.04.006
[8]	柴晓娟, 郭玮龙, 陈慧, 王俊荣, 谢德志, 金水虎. 蔺草种质资源遗传多样性的ISSR分析 . 浙江农林大学学报, 2017, 34(3): 552-558. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2017.03.022
[9]	许在恩, 俞瑜, 李兵娟, 陈虹君, 郭小勤. 倭竹族14-3-3非ε类基因编码区单核苷酸多态性 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(1): 80-87. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.01.011
[10]	刘跃钧, 张媛, 蒋燕锋, 刘京晶. 黄精种质资源遗传多样性研究 . 浙江农林大学学报, 2016, 33(6): 1085-1091. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2016.06.023
[11]	徐沂春, 胡绍庆, 赵宏波. 基于AFLP分子标记的不同类型野生桂花种群遗传结构分析 . 浙江农林大学学报, 2014, 31(2): 217-223. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2014.02.009
[12]	吴月燕, 陶巧静, 李波, 许丹叶. 西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 844-851. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
[13]	张振, 张含国, 张磊, 朱航勇, 李雪峰. 兴安落叶松基本群体与育种群体RAPD多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2012, 29(1): 130-136. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2012.01.022
[14]	高燕会, 樊民亮, 骆文坚, 黄华宏, 童再康. 濒危树种金钱松RAPD体系的建立和遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2011, 28(5): 815-822. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2011.05.023
[15]	范繁荣. 濒危植物白桂木的遗传多样性研究 . 浙江农林大学学报, 2010, 27(2): 266-271. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.02.017
[16]	王弋, 郭小勤, 娄永峰, 杨海芸, 林新春, 方伟. 紫竹多酚氧化酶基因克隆及其表达 . 浙江农林大学学报, 2010, 27(5): 781-785. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2010.05.023
[17]	曹福亮, 花喆斌, 汪贵斌, 张往祥. 野生银杏资源群体遗传多样性的RAPD分析 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(1): 22-27.
[18]	李洁, 熊智, 张成刚. 云南尼泊尔桤木遗传多样性研究 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(1): 16-21.
[19]	王祖良, 丁丽霞, 赵明水, 程晓渊, 沈乾. 濒危植物天目铁木遗传多样性的RAPD分析 . 浙江农林大学学报, 2008, 25(3): 304-308.
[20]	唐娟娟, 范义荣, 朱睦元. 黄山松群体遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2003, 20(1): 23-26.

链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/doi/10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

https://zlxb.zafu.edu.cn/article/zjnldxxb/2013/4/511

点击查看大图

计量

文章访问数: 3347
HTML全文浏览量: 459
PDF下载量: 907
被引次数: 0

紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

1. 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江临安 311300

通信作者: 郭小勤

收稿日期: 2012-08-02
修回日期: 2012-10-17
刊出日期: 2013-08-20

关键词:

摘要: 根据已报道的禾本科Poaceae植物PPO基因的保守序列（CuA和CuB区）设计1对引物，分别从紫竹Phyllostachys nigra 9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。序列分析显示：9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%，氨基酸水平上的一致性达到81.83%。在某些栽培类型，一年紫和沟槽紫，该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的单核苷酸多态性（SNP）位点，多数位点引起非同义突变。根据所测得的序列对紫竹不同栽培类型的亲缘关系进行了遗传多样性分析。图2表3参20