紫竹不同栽培类型<em>PPO</em>基因片段克隆及其SNP分析

肖国辉; 王弋; 娄永峰; 林新春; 郭小勤; 方伟

doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

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紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

肖国辉 , 王弋 , 娄永峰 , 林新春 , 郭小勤 , 方伟

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肖国辉, 王弋, 娄永峰, 林新春, 郭小勤, 方伟. 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(4): 511-516. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

引用本文:

肖国辉, 王弋, 娄永峰, 林新春, 郭小勤, 方伟. 紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析[J]. 浙江农林大学学报, 2013, 30(4): 511-516. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

XIAO Guohui, WANG Yi, LOU Yongfeng, LIN Xinchun, GUO Xiaoqin, FANG Wei. Cloning and SNP analysis of PPO genes with cultivars of Phyllostachys nigra[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(4): 511-516. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

Citation:

XIAO Guohui, WANG Yi, LOU Yongfeng, LIN Xinchun, GUO Xiaoqin, FANG Wei. Cloning and SNP analysis of PPO genes with cultivars of Phyllostachys nigra[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2013, 30(4): 511-516. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

1.
浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江临安 311300

详细信息

通信作者: 郭小勤

Cloning and SNP analysis of PPO genes with cultivars of Phyllostachys nigra

1.
The Nurturing Station for the State Key Laboratory of Subtropical Silviculture，Zhejiang A & F University，Lin’an 311300，Zhejiang，China

More Information

Corresponding author: GUO Xiaoqin

摘要: 根据已报道的禾本科Poaceae植物PPO基因的保守序列（CuA和CuB区）设计1对引物，分别从紫竹Phyllostachys nigra 9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。序列分析显示：9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%，氨基酸水平上的一致性达到81.83%。在某些栽培类型，一年紫和沟槽紫，该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的单核苷酸多态性（SNP）位点，多数位点引起非同义突变。根据所测得的序列对紫竹不同栽培类型的亲缘关系进行了遗传多样性分析。图2表3参20
- 植物学 /
- 紫竹 /
- PPO基因 /
- 单核苷酸多态性（SNP） /
- 遗传多样性
Abstract: Polyphenol oxidase（PPO） fragments were cloned from cultivars of Phyllostachys nigra using a pair of primers designed according to a conserved region（CuA and CuB） of a PPO gene sequence in Poaceae family and analyzed with a sequence analysis. The genetic relationship of cultivars was also analyzed based on these fragments using DNAMAN software. Results of the sequence analysis showed that identity was 92.35% in nucleotide acid and 81.83% in amino acid. A truncated protein of the gene was found in some cultivars of P. nigra，such asOne-year-purpleandPurple Groove. Single?鄄nucleotide polymorphism（SNP） sites were also found among these sequences. This could lead to non-synonymous mutations.［Ch，2 fig. 3 tab. 20 ref.］
- botany /
- Phyllostachys nigra /
- polyphenol oxidase（PPO）gene /
- single-nucleotide polymorphism （SNP） /
- genetic relationship

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[2]	黄锦春, 万思琦, 陈扬, 李丽红, 张自力, 朱建军, 吴梅, 邢丙聪, 邵清松, 陆晨飞. 利用ISSR与SRAP分子标记分析金线莲种质资源遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(1): 22-29. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220473
[3]	李亚萍, 戴惠明, 姜武, 陈家栋, 段晓婧, 陶正明. 基于SRAP标记的不同产区黄精的遗传多样性 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(3): 658-664. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20220436
[4]	王洁, 朱锡彭, 王腾斐, 朱建军, 李文俊, 邢丙聪, 郑颖. 白及种质资源遗传多样性分析 . 浙江农林大学学报, 2023, 40(2): 321-329. doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.20210690
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链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/doi/10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

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紫竹不同栽培类型PPO基因片段克隆及其SNP分析

doi: 10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.008

1. 浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培育基地，浙江临安 311300

通信作者: 郭小勤

收稿日期: 2012-08-02
修回日期: 2012-10-17
刊出日期: 2013-08-20

关键词:

摘要: 根据已报道的禾本科Poaceae植物PPO基因的保守序列（CuA和CuB区）设计1对引物，分别从紫竹Phyllostachys nigra 9个不同栽培变型中克隆到PPO基因片段。序列分析显示：9个序列彼此间核苷酸水平上一致性达到92.35%，氨基酸水平上的一致性达到81.83%。在某些栽培类型，一年紫和沟槽紫，该基因存在提前终止的现象。所获得的9条序列间存在明显的单核苷酸多态性（SNP）位点，多数位点引起非同义突变。根据所测得的序列对紫竹不同栽培类型的亲缘关系进行了遗传多样性分析。图2表3参20