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无机磷酸盐(inorganic phosphates, Pi)的消耗是影响全球植物生长的严重问题[1]。所有生物体的生命都依赖于脂质双层细胞膜的存在,该膜将细胞内部与环境分开,单乳糖基和二乳糖基二酰基甘油(分别为MGDG和DGDG)构成植物叶绿体中膜脂质的大部分[2]。膜脂质重塑是植物用来在Pi耗尽条件下生存的防御机制[3]。在Pi饥饿期间,磷脂被降解为Pi提供其他必需的生物过程,而质体中的半乳糖脂合成通过单半乳糖基二酰基甘油合酶3(MGD3)的转录激活上调[4]。在拟南芥Arabidopsis thaliana中,已经鉴定出3种功能性MGD合成酶(MGD1,MGD2和MGD3),并根据其氨基酸身份将其分为A型(MGD1)和B型(MGD2和MGD3)酶[5−6]。A型和B型酶在特异性、亚细胞定位和基因表达谱方面存在一些差异,A型酶定位于质体的内膜,而B型酶定位于质体外膜。在这三者中,MGD1是叶绿体中最丰富的亚型。MGD1的表达在光合组织中广泛存在,而MGD2和MGD3的表达在根等非光合组织中特异性检测到,在绿色组织中很少检测到[7]。2种类型的MGD酶对于植物在低磷酸盐条件下的生存至关重要,但尚未报道对MGD基因分歧的详细分析。这些基因对于植物适应磷素缺乏症可能是必不可少的。
棉花Gossypium是一种油籽和纤维作物,在全球70多个国家种植,在全球经济中发挥着重要作用[8-10]。然而,棉花的生长和生产力受到非生物和生物胁迫[11]。磷是核酸的主要组成部分,在植物生长发育和代谢过程中极为重要,是细胞分裂和根系生长不可缺少的,低磷胁迫不利于作物生长发育[12-16]。因此,研究低磷胁迫的分子适应机制和加强抗逆性对棉花生产至关重要。张学昕等[17]通过田间试验对不同施磷处理下的棉花各时期取样进行养分和产量分析表明:当其他条件一定时,随着施磷量的递增,棉株的单株铃数以及单铃质量也会随之增加,从而实现增产的目标。王刚等[18]研究发现:棉株地上和地下两部分的干物质都随有效磷含量的增加而增加,根冠比则随其增加而降低。通过有效磷含量影响糖类物质的合成转化以及棉株叶绿素含量,进而作用于整个棉株的生长。刘耘华等[19]研究表明:施用有机肥能够增加土壤有效磷含量,除了有机肥中有一部分磷素之外,还可以促进有效磷的转化。磷素与有机肥混合施用对土壤磷库、棉花产量和磷素吸收量都会产生积极影响。
本研究以前期研究筛选出的磷高效棉花品种陆地棉‘新陆早19’Gossypium hirsutum‘Xinluzao 19’为材料,克隆了GhMGD3基因,采用生物信息学工具分析其编码蛋白理化性质,并对其进行表达特性分析,旨在为深入解析棉花GhMGD3基因的生物学功能提供科学参考,并为培育磷高效利用的棉花新品种提供基因资源。
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陆地棉‘新陆早19’种植在河南科技大学农学院大田,不施加磷肥。选取长势一致的植株,采集根、茎、叶、花,用于分析GhMGD3基因在植株4个组织中的表达状况。
将‘新陆早19’种子播种于含干净湿润细沙的塑料盆内,28 ℃恒温培养箱,光照14 h/黑暗10 h,培养至棉苗三叶期,选择长势良好且一致的幼苗移至水培盆中,用1/2 Hoagland 营养液培养1周后分为2个处理水平,即适磷处理(SP,1.00 mmol·L−1)和低磷处理(LP,0.01 mmol·L−1),磷源采用KH2PO4,为保证K+的浓度一致,以1.0 mmol·L−1为标准,低磷营养液中以KCl补齐K+,其他营养成分含有2 mmol·L−1 Ca(NO3)2·4H2O、2.5 mmol·L−1 KNO3、0.5 mmol·L−1 NH4NO3、1.4 mmol·L−1 MgSO4·7H2O、1.0×10−3 mmol·L−1ZnSO4·7H2O、1.0×10−3 mmol·L−1 MnSO4·H2O、0.1×10−3 mmol·L−1 CuSO4·5H2O、0.01 mmol·L−1 H3BO3、0.05×10−4 mmol·L−1 (NH4)6MO7O24·4H2O、0.1 mmol·L−1 EDTA-FeNa[20]。分别处理0、4、12、24、72 h后,选取3株生长一致的棉花植株,并混合取其根部组织,然后迅速置于液氮中,−80 ℃保存备用。每日调节营养液pH 6.5,3 d更换1次营养液。
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根据前期陆地棉根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达基因序列进行分析,在美国国家生物信息中心(NCBI)网站的EST数据库中检索差异表达基因序列,得到该基因的相似序列,将所得相似性序列(覆盖率>50%,相似度>90%)使用DNASTAR的Seqman进行拼接得到重叠群,将所得序列继续检索与拼接直至没有新的相似序列出现,所得即为结果序列conting,利用ORFfinder在线平台查找开放阅读框,进行目标基因GhMGD3的克隆与分析。根据ORFfinder在线平台查找的开放阅读框,使用Primer 5.0设计引物,由生工生物工程有限公司合成,见表1。
表 1 引物信息
Table 1. Primers used in the study
引物名称 引物序列(5′→3′) 上游引物 GGGTTCTTTGTCTTTCTTG 下游引物 ACCTGGATTTGGGACTCTT M13F TGTAAAACGACGGCCAGT M13R CAGGAAACAGCTATGACC GhACTIN-F ATCCTCCGTCTTGACCTTG GhACTIN-R TGTCCGTCAGGCAACTCAT GhMGD3-F CTTGTTTTCTTTTCTTCTTGGTGGA GhMGD3-R TGATAATAATAGCCGTTGTTGTTGA -
取液氮速冻整株植株后在研钵中迅速研磨成粉末转移至离心管,利用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取基因组DNA,向其中添加200 μL的TE缓冲液溶解后置于−20 ℃保存备用。
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以基因组DNA为模板设计PCR扩增反应体系(20 μL),冰上操作:2×M5 蓝色染料高保真Taq酶10.0 μL,上游引物(10 μmol·L−1) 0.5 μL,下游引物(10 μmol·L−1) 0.5 μL,模板 DNA 0.5 μL,无核酸酶ddH2O 8.5 μL。反应程序为:95 ℃ 3 min;94 ℃ 25 s,53 ℃ 25 s,72 ℃ 40 s,32个循环;72 ℃ 5 min;4 ℃低温保存。120 V,25 min,质量浓度为1%琼脂糖凝胶电泳检测。将目的DNA片段进行胶回收纯化后连接pTOPO-T载体,具体体系为(10 μL):M5 HiPer pTOPO-TA Vector 1.0 μL,10×增强剂 1.0 μL,纯化后的PCR产物 3.9 μL,灭菌水 4.1 μL。取5.0 μL连接产物转化50.0 μL大肠埃希菌Escherichia coli DH5ɑ 感受态细胞,将菌液涂布在含氨苄青霉素的LB固体培养基上,37 ℃培养过夜。随机挑取单菌落,扩大培养4 h。以所得菌液作模板进行菌液PCR反应,体系如下(20 μL):2×M5 蓝色染料高保真Taq酶10.0 μL,通用引物M13F 0.5 μL,通用引物M13R 0.5 μL,模板DNA 0.5 μL,无核酸酶ddH2O 8.5 μL。反应程序与以基因组DNA为模板PCR扩增反应体系相同。检测符合后送至生工生物工程有限公司测序。
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取液氮速冻整株‘新陆早19’植株后在研钵中迅速充分研磨成粉末,后续步骤依照RNAprep Pure多糖多酚植物总RNA提取试剂盒说明书提取RNA,150 V,15 min,质量浓度为1%琼脂糖凝胶电泳检测。参考HiScript® cDNA一链合成试剂盒说明书完成cDNA一链的合成,−20 ℃保存备用。
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以‘新陆早19’的cDNA为模板设计PCR扩增反应体系(20 μL),冰上操作:2×M5蓝色染料高保真Taq酶10.0 μL,上游引物(10 μmol·L−1) 0.5 μL,下游引物(10 μmol·L−1) 0.5 μL,cDNA 1.0 μL,无核酸酶 ddH2O 8.0 μL。PCR反应程序为:95 ℃ 3 min;94 ℃ 25 s,56 ℃ 25 s,72 ℃ 35 s,35个循环;72 ℃ 5 min;4 ℃低温保存。120 V,25 min,质量浓度为1%琼脂糖凝胶电泳检测。将目的DNA片段进行胶回收纯化后连接pTOPO-T载体,体系(5 μL)如下:M5 HiPer pTOPO-TA Vector 0.5 μL,10×增强剂 0.5 μL,纯化后的PCR产物1.5 μL,灭菌水2.5 μL。取5 μL连接产物转化50 μL大肠埃希菌DH5ɑ感受态细胞,培养后随机挑取单菌落扩大培养后进行菌液PCR反应,电泳检测符合后送至生工生物工程有限公司进行测序。
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使用在线平台及软件对基因进行生物信息学分析,预测分析基因的结构、性质等。
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利用半定量RT-PCR技术,分析GhMGD3基因在根、茎、叶、花中的表达状况。以各组织的cDNA为模板,GhACTIN作内参基因,所用引物见表1。设计PCR扩增反应体系(20 μL),冰上操作:2×M5蓝色染料高保真Taq酶10.0 μL,GhMGD3-F(10 μmol·L−1) 0.5 μL,GhMGD3-R(10 μmol·L−1) 0.5 μL,cDNA 1.0 μL,无核酸酶ddH2O 8.0 μL。PCR反应程序为:95 ℃ 3 min;94 ℃ 25 s,60 ℃ 25 s,72 ℃ 10 s,35个循环;72 ℃ 5 min;4 ℃低温保存。120 V,25 min,质量浓度为1%琼脂糖凝胶电泳检测。
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采用实时荧光定量PCR (RT-qPCR)技术检测GhMGD3基因在不同组织中及低磷胁迫处理下的表达模式。以GhACTIN作为内参基因,所用引物见表1。采用SYBR® Green Pro Taq HS预混型qPCR试剂盒进行荧光定量,使用的荧光定量PCR仪器型号是CFX96,数据分析采用
$2^{{-\Delta \Delta C}_{t}}$ 法,用Origin 9.0对数据进行统计分析并作图。 -
利用前期低磷胁迫差异表达序列为探针,共检索发现并下载了8条相似序列,利用DNASTAR将所得序列全部进行拼接,得到了一个新的conting重叠群,序列长度为1 276 bp。
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根据GhMGD3基因的编码序列(coding sequence,CDS)设计特异性引物,以植株的DNA和cDNA为模板,克隆得到GhMGD3基因的CDS (图1),其条带符合目的条带大小。通过无缝克隆连接到pTOPO-T载体上,挑选阳性克隆测序。获得DNA序列1 040 bp左右(泳道1)与conting序列的一致性较高,为93.14%。获得cDNA序列780 bp左右(泳道2)与conting序列比对一致性为99.43%。开放阅读框为长度为681 bp,共编码226个氨基酸。该基因GhMGD3是MGD家族成员。
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将DNA测序结果序列与cDNA测序结果的最大开放阅读框序列导入Gene Structure Display Server 2.0对该基因组序列与编码序列进行分析,表明该基因编码序列包含5′与3′端非编码序列,含有3个内含子,4个外显子(图2)。
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将基因编码蛋白导入ExPASy-ProtParam tool在线软件,分析可知GhMGD3共编码了226个氨基酸,编码蛋白的分子式是C1201H1832N328O333S13,脂肪族氨基酸指数是76.28,分子量是26 610.54 Da,等电点为8.74,属于碱性蛋白。其中缬氨酸的质量分数占比最大,为8.4%,共19个。在该蛋白中带正电荷的氨基酸有30个,另外有26个带负电荷。氨基酸组分会直接影响蛋白的亲疏水性,总亲水性平均系数为−0.471,不稳定系数是37.83,是亲水性稳定蛋白。ProtScale analysis在线软件显示此蛋白中精氨酸亲水性最强,亲水指数为−4.500,异亮氨酸疏水性最强,亲水指数为+4.500。
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在NPS@:SOPMA secondary structure prediction网站预测该蛋白二级结构,其中占比最大的无规则卷曲占39.38%,包含89个氨基酸,其次是α-螺旋,占比为34.96%,包含79个氨基酸;此外此蛋白还含有延伸链(extended strand)和β-转角(beta turn),其中延伸链占比相比较多,占比21.24%,有48个氨基酸,β-转角仅有10个氨基酸,占比4.42%,是最少的。表明此蛋白的二级结构由α-螺旋和无规则卷曲占据主体地位所组成。由于无规则卷曲占比较多,预测其结构比较复杂。运用TMHMM-2.0分析该基因所编码蛋白不含有跨膜结构域,属于非跨膜蛋白,226个氨基酸并未形成跨膜螺旋区。通过SignalP-5.0进行信号肽分析可知:此基因编码蛋白有信号肽的概率是0.001 6,其他的可能性则高达0.998 4。226位氨基酸中并未出现典型的信号肽趋势,即该蛋白不存在信号肽。在线网站内输入基因编码序列进行基因编码蛋白的亚细胞定位预测,预测定位在叶绿体,该蛋白可能在叶绿体发挥作用。
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通过SWISS-MODEL Interactive Workspace进行同源建模,预测蛋白三级结构。如图3所示:QMEAN值为0.60,GMQE值为0.12,预测其结构与单半乳糖基二酰基甘油合酶相似,与拟南芥半乳糖脂合酶MGD1的结构类似。蛋白的三级结构与二级结构分析结果一致,均以α螺旋和无规则卷曲为主体。
将获得的基因编码序列提交到STRING 11.0在线网站预测该基因可能的互作网络,分析结果显示:此基因编码蛋白能够预测到蛋白的相互作用网络,因此预测该基因可能是通过多个蛋白互作进行调控。糖基化对蛋白稳定及功用均会产生极其重要的影响。将获得的基因编码序列提交到NetNGlyc 1.0在线软件可知:该蛋白不存在N-糖基化位点。磷酸化位点与蛋白的功能、结构都有很大的关系,通过NetPhos 3.1在线网站分析:此蛋白中占比最大的是丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点,而酪氨酸占比较少。它除了可以调控蛋白的活性以外,在细胞的信号转导中也占据了重要的位置。
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使用NCBI的保守结构域数据库(CDD-search)查找此氨基酸序列的保守结构域,结果显示:该基因所编码蛋白匹配所属的超家族是PLN02605,是一类包含多个结构域的模型。经与其他物种MGD家族同源蛋白进行多序列比对(图4),该基因存在1个MGD家族特有的保守结构域(图4红框所示),说明该基因属于陆地棉MGD家族成员。在NCBI数据库利用BLASTp检索氨基酸序列的同源序列,下载了11条不同物种的蛋白序列:雷公藤Tripterygium wilfordii、拟南芥、可可树Theobroma cacao、芒果Mangifera indica、千金榆Carpinus fangiana、木槿Hibiscus syriacus、榴莲Durio zibethinues、核桃Juglans regia、橡胶树Hevea brasiliensis、开心果Pistacia vera、杨梅Morella rubra。通过软件MEGA5构建系统进化树(图5),棉花蛋白序列与木槿亲缘关系最近,其次是榴莲、可可树,与其余物种的亲缘关系较远。
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以棉花的GhACTIN为内参基因,通过半定量RT-PCR技术对GhMGD3基因在‘新陆早19’的4个组织中的表达情况进行分析。从图6可知:该基因高表达于根,微量表达于叶和花,中量表达于茎。利用qPCR检测GhMGD3基因在陆地棉‘新陆早19’植株的根、茎、叶、花等4个组织中的表达结果(图7A)同半定量RT-PCR一致。由图7B可以看出:在低磷胁迫下4~24 h,表达量逐渐下调,但是与适磷处理相比,其表达量都相对较高,且在低磷处理72 h时表达量达到最高,其中12和72 h时低磷处理比适磷处理显著表达(P<0.05),说明该基因在受到低磷胁迫的刺激后,能够对低磷胁迫作出应答反应。
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大部分脂质由非磷且不带电荷的半乳糖甘油脂类单半乳糖基二酰基甘油(MGDG)和二半乳糖基二酰基甘油(DGDG)组成,它们占总脂质的80%。单半乳糖基二酰基甘油是质体的生物活动以及光合活性所需的主要和必需的植物脂质,这需要富含半乳糖脂的环境。MGDG也是二半乳糖基二酰基甘油(DGDG)的关键前体,它在磷酸盐胁迫下转移到质体膜外。因此,MGDG的合成对植物至关重要。大部分MGDG是由位于质体膜上的MGDG合酶合成的[21]。尽管植物组织中磷含量之间的平衡可能对植物生长很重要,但细节仍然未知。
拟南芥mgd3和mgd2mgd3突变体在磷胁迫下植物会出现严重的生长迟缓和DGDG含量降低,清楚地表明MGD3介导的MGDG合成在磷稀缺时对生存具有重要作用[22]。史中惠等[23]将OsMGD基因转入烟草Nicotiana tobacum植株得到了超表达OsMGD基因烟草植株,通过低磷胁迫下各生理生化指标变化情况的分析表明:该基因可以提高磷脂与半乳糖脂的含量,进一步增强植株耐低磷的特性。MGDG仅存在于质体中,但DGDG可以存在于非质体膜中,在特定条件下,例如磷胁迫下,它可以替代磷脂[24]。半乳糖脂被认为在种子萌发过程中原层体向类囊体膜的光依赖性转化以及响应光变化的高度堆叠的颗粒膜和光合机制的动态组织中发挥重要作用[25]。MGDG和DGDG还可以稳定叶绿体中的光系统蛋白复合物[26-27]。在磷胁迫的条件下,植物激活体内相关的机制,以应对细胞对环境条件变化的需求。
本研究所得基因序列与拟南芥中的MGD家族中的单半乳糖基二酰基甘油合酶同源性较高,从陆地棉‘新陆早19’中克隆得到了1个MGD3类似基因,并将其命名为GhMGD3,该基因属于MGD超家族成员。该基因存在3个内含子,GhMGD3蛋白相对分子质量为26 610.54 Da,等电点为8.74,是碱性蛋白,具备稳定性与亲水性。此蛋白的二级结构由α-螺旋和无规则卷曲占据主体地位所组成,通过同源建模可知该基因三级结构预测其结构与拟南芥半乳糖脂合酶MGD1结构相似。该基因编码蛋白不存在信号肽和跨膜结构域。该蛋白不存在潜在的N-糖基化位点,但含有多个酸化位点。亚细胞定位结果显示该基因编码蛋白在叶绿体中,预测其能够通过蛋白质的相互作用参与调控。基因表达分析结果表明:该基因在棉花根中的表达量是最大的,中量表达于茎,微量表达于叶和花,在低磷胁迫72 h时其相对表达量达到最高值。GhMGD3基因可能在根系发挥作用,在棉花的磷高效利用信号调控过程中具有重要的作用。
Cloning and expression of phosphorus efficient gene GhMGD3 in Gossypium hirsutum
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摘要:
目的 基于前期陆地棉Gossypium hirsutum根部低磷胁迫基因表达谱芯片差异表达序列数据分析,挖掘相关基因,并对其克隆与表达分析。 方法 克隆GhMGD3基因并进行基因组DNA与cDNA测序分析,借助生物信息学方法分析GhMGD3的基因结构和进化关系;采用半定量RT-PCR技术与实时荧光定量PCR (RT-qPCR)的方法检测该基因在根、茎、叶、花4个组织中的基因表达量的变化以及低磷胁迫下的表达模式。 结果 成功克隆了陆地棉GhMGD3基因。GhMGD3基因的编码序列全长为681 bp,共编码226个氨基酸,存在3个内含子,分子量是26 610.54 Da,等电点为8.74,是稳定的亲水碱性蛋白。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主。该蛋白不存在信号肽、跨膜结构域、N-糖基化位点,但含有多个磷酸化位点。亚细胞定位结果显示:该基因编码的蛋白定位于叶绿体。GhMGD3蛋白与木槿Hibiscus syriacus氨基酸序列相似性较高,其亲缘关系最近。半定量RT-PCR和RT-qPCR试验结果均表示:GhMGD3基因主要表达于根,中量表达于茎,微量表达于叶和花,在低磷胁迫72 h时其相对表达量达到最高值。 结论 首次成功克隆到了陆地棉GhMGD3基因,获得了GhMGD3基因的组织表达以及低磷胁迫下的表达模式,GhMGD3基因在棉花磷高效利用信号调控中具有重要作用。图7表1参27 Abstract:Objective Based on the genome-wide expression profile of cotton seedlings under low phosphorus stress in the early stage of our research group, related genes were excavated and their preliminary expression analysis was conducted. Method Genomic DNA and cDNA sequence of the gene were cloned and analyzed by bioinformatics method. Semi-quantitative RT-PCR and fluorescence quantitative PCR (RT-qPCR) were used to detect the changes of gene expression in root, stem, leaf and flower tissues. The expression patterns of GhMGD3 under low phosphorus stress were analyzed by RT-qPCR technology. Result GhMGD3 gene was cloned. The coding sequence of GhMGD3 was 681 bp, encoding 226 amino acids and containing 3 introns. The molecular weight is 26 610.54 Da, isoelectric point is 8.74, it is a stable hydrophilic alkaline protein. The secondary structure is dominated by α-helix and random crimp. The protein does not have signal peptide, transmembrane domain and N-glycosylation site, but contains multiple acidification sites. Subcellular localization showed that the gene encoded a protein in chloroplast. GhMGD3 protein and Hibiscus syriacus protein amino acid sequence similarity is high, the most recent genetic relationship. The results of semi-quantitative RT-PCR and RT-qPCR showed that GhMGD3 gene was mainly expressed in root, medium expression in stem, and trace expression in leaf and flower, and its expression level reached the highest value at 72 h of low phosphorus stress. Conclusion The GhMGD3 gene was preliminarily obtained. The expression patterns of GhMGD3 in different tissues and under low phosphorus stress were analyzed. GhMGD3 gene has an important function in regulation of the efficient utilization of phosphorus in cotton. [Ch, 7 fig. 1 tab. 27 ref.] -
Key words:
- Gossypium hirsutum /
- low phosphorus stress /
- gene cloning /
- expression analysis
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杨树Populus作为速生用材树种,具有广泛的用途,尤其是在制浆造纸、人造纤维和纤维板制造业中占有重要地位。木材纤维是杨树木材的主要组成部分,也是制浆及纤维制造业的主要原料,纤维性状的优劣直接决定着杨树纤维材的开发利用与发展[1]。然而,纤维形态特征及纤维含量对不同品种或无性系而言均存在着差异,即使同一树种的不同个体或同株不同部位亦有明显差异[2]。Jr FARMER等[3]利用美洲黑杨Populus deltoids无性系幼林作为试验材料,开展了木材纤维长度性状变异研究,证明了纤维性状在无性系间也呈较大差异。王明庥等[4]对杂种无性系的材性变异研究表明:纤维相关性状呈株内变异特点,且各性状间的变异具有独立性。查朝生等[5]对杨树无性系人工林的木材纤维形态特征进行了研究,表明纤维长、纤维宽以及纤维长宽比随着生长轮的增加,呈增大趋势。MANSFIELD等[6]对不同产地15个山杨Populus davidiana无性系的木材纤维性状进行研究发现:纤维性状在不同品种及林分间均呈显著变异。刘玉鑫等[7]研究表明:美洲黑杨无性系纤维性状存在遗传变异,且变异受遗传的影响大于受环境的影响。综上可知,杨树无论是品种间、林分间、无性系间或是单株的不同部位都存在变异的可能,因此,分析与评价杨树不同无性系间纤维性状差异性,不仅能够为选育适用于木材工业化生产及大规模加工利用高附加值的杨树优良新品种提供参考,而且对促进杨树人工林及杨树相关产业的可持续发展具有重要意义。鉴于此,本研究选择树干通直圆满,生长量大,且在长江流域及洞庭湖区分布广、适生性较强的7个杨树无性系为材料,对纤维素形态特征及含量差异进行了研究,综合评价了各无性系纤维性状指标,旨在为杨树无性系选择纤维材优良品系提供科学依据。
1. 研究区概况
研究区在湖南省岳阳市君山区(39°46ʹ01″N,116°25ʹ53″E)。该区光照充足,年平均气温为16.8 ℃,年平均降水量为1 135.3~1 237.9 mm,无霜期为260 d,雨热同期,为典型的亚热带湿润季风气候[8-10]。林地海拔为28~35 m,土壤多为江湖冲积而成的潮土,土壤肥沃[11]。
2. 材料与方法
2.1 材料
试验林于2009年造林,林分株行距为4 m×6 m。林内共18个杨树无性系,各无性系按完全随机区组试验排列,每个无性系10株,3次重复。试验林造林后3~4 a,每年浅耕1~2次,林下间种南瓜Cucurbita moschato;造林后2~6 a,于每年的4月下旬至5月上旬采用环状沟施肥法施尿素或复合肥(250~500 g·株−1) 1次;造林后第3年、第5年以及第7年,每年12月修枝1次,3次修枝强度(修枝高度与树高比)分别为35%、40%和40%;其他管理措施为常规管理。
选取试验林中树干圆满且通直,生长较快的杨树XL-80、XL-86、XL-83、XL-58、XL-75、ZH-17、I-69(对照)等7个无性系作为材料,每个无性系选取3株标准木测定树高及胸径,伐倒后作为生物量测定和纤维性状取样对象。在伐倒样株胸径处取一个厚5 cm的圆盘作为木材纤维形态测定试样。
2.2 方法
各无性系样木伐倒后,将地上部分分成干、枝、叶,树干每2 m分为一段,分别称各部位的鲜质量,然后各部位在105 ℃下烘干并称量,最后根据样品干质量和湿质量的比例,换算单株生物量干质量[12]。单株纤维素质量的估算:单株纤维素质量=单株生物量干质量×纤维素质量分数。采集的样品经处理后,纤维素质量分数测定采用硝酸-乙醇法,木材纤维长和纤维宽采用刘超逸等[13]的测定方法。
2.3 数据处理
运用Excel、SPSS等软件进行不同无性系间的数据统计和方差分析。各无性系间生长性状及纤维形态及含量综合评价采用加权综合得分法。
3. 结果与分析
3.1 杨树无性系的性状变异分析
由表1可以看出:树体性状和木材纤维性状变异幅度较大,为2.66%~21.76%,其中生物量(21.76%)和单株纤维素(21.35%)的变异系数较大,均超过21%,树高和纤维宽的变异系数较小,为2.0%~3.2%,表明杨树各性状间变异的差异较大,可选择利用的空间广阔。
表 1 杨树无性系性状变异Table 1 Character variation of poplar clones性状 胸径/cm 树高/m 生物量/(kg·株−1) 纤维长/mm 纤维宽/mm 纤维长宽比 纤维素质量分数/% 单株纤维素/(kg·株−1) 平均值 31.28 25.22 301.81 1.04 0.02 52.03 57.78 175.46 标准差 3.08 0.81 65.68 0.05 0.00 1.82 2.31 37.47 变异系数/% 9.84 3.19 21.76 4.99 2.66 3.50 3.99 21.35 3.2 木材纤维形态差异
从表2可知:7个杨树无性系的纤维长为0.95~1.12 mm,纤维宽为0.019~0.021 mm,纤维长宽比为49.1~54.6。其中,无性系XL-83的纤维长最小,为0.95 mm,与其他无性系纤维长呈极显著差异(P<0.01);除无性系XL-83外,其他无性系的纤维长差异均不显著(P>0.05),且无性系XL-58、XL-86以及XL-80纤维长均达1.05 mm以上。无性系之间纤维宽差异均不显著(P>0.05)。无性系的纤维长宽比从大到小依次为I-69、XL-58、XL-86、XL-75、ZH-17、XL-80、XL-83。各无性系间的纤维长宽比存在一定差异,其中无性系XL-83与I-69、XL-58、XL-86均呈显著差异(P<0.05)。
表 2 杨树无性系纤维特征Table 2 Fiber characteristics of poplar clones无性系 纤维长/mm 纤维宽/mm 纤维长宽比 XL-80 1.06±0.05 Ab 0.021±0.001 a 50.93±0.91 ac XL-86 1.07±0.05 Ab 0.021±0.001 a 52.52±2.50 a XL-83 0.95±0.03 Bc 0.019±0.001 a 49.09±9.19 bc XL-58 1.12±0.10 Aa 0.021±0.000 a 53.84±3.81 a XL-75 1.02±0.03 Ab 0.020±0.001 a 51.91±2.00 ac ZH-17 1.04±0.07 Ab 0.020±0.001 a 51.81±1.80 ac I-69 1.08±0.05 Ab 0.020±0.001 a 54.62±4.70 a 说明:数值为平均值±标准差;同列不同大写字母表示同 一指标在不同无性系之间差异极显著(P<0.01);同 列不同小写字母表示同一指标在不同无性系之间差 异显著(P<0.05) 3.3 生物量及木材纤维素差异
从表3可以看出:无性系生物量间差异显著(P<0.05),生物量为194.27~401.73 kg·株−1,其中生物量最大的无性系为XL-80 (401.73 kg·株−1),最小的无性系为对照I-69 (194.27 kg·株−1)。各无性系间纤维素质量分数存在一定差异,除无性系XL-83与其他无性系的纤维素质量分数呈显著差异(P<0.05)外,其他无性系间纤维素质量分数差异不显著(P>0.05)。无性系纤维素质量分数为53.06%~59.66%,均高出造纸所需纤维素质量分数的基本要求(40%)。无性系单株纤维素为114.04~233.81 kg·株−1,其中最高的无性系为XL-80 (233.81 kg·株−1),对照I-69单株纤维素仍为最小,仅114.04 kg·株−1。无性系单株纤维素呈不同程度的差异,其中无性系XL-80与XL-86单株纤维素呈显著差异(P<0.05),与其他无性系均呈极显著差异(P<0.01);无性系I-69与供试的其他无性系均呈极显著差异(P<0.01),无性系XL-75与ZH-17差异不显著(P>0.05)。
表 3 杨树无性系生物量及木材纤维素差异Table 3 Differences in biomass and wood cellulose content of poplar clones无性系 生物量/
(kg·株−1)纤维素质量
分数/%单株纤维素/
(kg·株−1)XL-80 401.73±12.09 Aa 58.22±0.40 a 233.81±5.43 Aa XL-86 335.98±10.90 Bb 59.66±0.23 a 200.58±7.18 Ab XL-83 329.23±9.34 Cc 53.06±0.41 b 174.82±3.64 Bb XL-58 320.14±1.62 Dd 58.55±0.50 a 187.60±2.55 Bc XL-75 268.67±1.96 Ef 59.17±0.94 a 159.05±3.58 BCe ZH-17 270.31±0.96 Ee 59.66±0.53 a 161.38±0.78 BCe I-69 194.27±3.76 Fg 58.66±0.10 a 114.04±2.01 Df 说明:数值为平均值±标准差;同列不同大写字母表示同 一指标在不同无性系之间差异极显著(P<0.01);同 列不同小写字母表示同一指标在不同无性系之间差 异显著(P<0.05) 3.4 生长性状及木材纤维性状相关性分析
木材纤维性状与生长性状间的相关分析结果(表4)表明:生长性状树高、胸径、生物量以及单株纤维素之间呈极显著正相关(P<0.01)。纤维长与纤维宽、纤维长宽比以及纤维素质量分数呈显著正相关(P<0.05),纤维长宽比与纤维素质量分数呈显著正相关(P<0.05)。木材纤维性状与生长性状之间相关性各异,纤维宽与树高、胸径、生物量呈正相关但不显著(P>0.05),纤维长、纤维长宽比及纤维素质量分数分别与胸径、树高及生物量均呈负相关,且均不显著(P>0.05),表现出独立遗传特性。
表 4 无性系生长性状与木材纤维性状的相关性Table 4 Correlation between clonal growth traits and wood fiber traits项目 胸径 树高 生物量 纤维长 纤维宽 纤维长宽比 纤维素质量分数 单株纤维素 胸径 1 树高 0.926** 1 生物量 0.995** 0.903** 1 纤维长 −0.146 −0.178 −0.111 1 纤维宽 0.520 0.366 0.556 0.734* 1 纤维长宽比 −0.598 −0.534 −0.572 0.863* 0.293 1 纤维素质量分数 −0.258 −0.210 −0.237 0.716* 0.467 0.682* 1 单株纤维素 0.972** 0.887* 0.981** 0.032 0.667* −0.448 −0.043 1 说明:*表示相关显著(P<0.05);**表示相关极显著(P<0.01) 3.5 不同无性系木材纤维综合评价
纤维材培育的最终目标是尽可能多地提供优质的纤维。因林木的生长量与木材产量呈正相关,木材的纤维形态又直接关系到林木纤维的产量和质量,因此,纤维材的产量以及纤维形态和含量是评价和选择该材种优劣的重要依据。本研究通过主成分分析(表5)得出:决定第1主成分的主要是生物量、纤维素质量分数和单株纤维素;决定第2主成分的主要是纤维长和纤维宽,前2个主成分已经能够解释原有各性状的大部分信息,故可以选择前2个主成分进行综合评分。根据所选主成分的贡献率对主成分得分进行加权平均,求得主成分综合得分(表6)。由表6可以看出:供试7个无性系综合得分由大到小依次为XL-80、XL-58、XL-86、ZH-17、XL-83、XL-75、I-69,该综合得分排序与各无性系的生物量、纤维长、纤维宽、纤维长宽比及纤维素质量分数排序具有一定的一致性。通过综合评比,入选的前5个杨树无性系综合了各性状的优良水平,也突出了联合选择在纤维材良种选育中的重要性。
表 5 主要性状的特征向量Table 5 Feature vectors of main characters性状 主成分 1 2 生物量 0.875 −0.028 纤维长 −0.018 0.435 纤维宽 −0.201 0.365 纤维素质量分数 0.236 0.099 单株纤维素 0.935 0.035 表 6 各无性系综合评价得分Table 6 Comprehensive evaluation score of each clone无性系 第1主成分得分 第2主成分得分 综合得分 排序 XL-80 2.489 2.547 2.510 1 XL-86 0.952 0.982 0.963 3 XL-83 −0.944 −0.907 −0.931 5 XL-58 1.252 1.110 1.202 2 XL-75 −1.204 −1.117 −1.173 6 ZH-17 −0.522 −0.438 −0.493 4 I-69 −2.024 −2.177 −2.078 7 4. 讨论与结论
4.1 讨论
木材纤维占阔叶树木材总体积的50%以上,木材纤维的形态指标直接影响着木材的硬度、强度以及制浆造纸性能,与木材物理力学性能以木材的开发利用息息相关[14-15]。曾广植[16]研究得出:纤维长与纸张强度呈线性正相关;张平冬等[17]认为:纤维长宽比越大,越能增加纤维之间交织次数,提升结合能力,从而增强纸张的强固性和割裂性[7];汪殿蓓等[18]研究表明:纤维长宽比大于56是优良的造纸原料。本研究杨树无性系的纤维长以及纤维长宽比最小分别为0.95 mm和49.09,均达到或超出国际木材解剖学中所规定的中级长度纤维(0.91~1.60 mm)以及长宽比不低于35~45的标准[4],其中纤维长与刘玉鑫等[7]、查朝生等[5]的测定结果相当,但纤维长宽比均高于以上测定结果,且主成分综合得分排名中,前5个无性系的纤维长宽比均在58.2以上。进一步表明本研究杨树无性系的纤维性状均较优,其中主成分分析评价得分较高的前5个无性系更适合用于纸浆或纤维用材。
性状间遗传变异差异较大,要开展多性状选择就需要探明各性状间相互关系。而杨树作为速生树种,其生长性状在进行良种选择时是必须考虑的指标,材性性状无论是作为结构材还是纤维用材都是综合评价的关键因子,因此,生长性状、材性性状以及生长性状与材性性状间的相关性是杨树遗传改良的重要依据。黄家华[19]以鹅掌楸Liriodendron chinenese等14个种源作为研究材料,发现生长性状与纤维宽及纤维长宽比均呈负相关;覃敏[20]评价了6年生米老排Mytilaria laosensis子代测定林,发现除纤维宽外,生长性状与木材性状的改良具有相对独立性;黄寿先[21]选取12个杉木Cunninghamia lanceolata无性系对制浆造纸性能的变异及其与生长、材性的相关性进行了研究,得出胸径、树高与管胞长度、宽度、管胞长宽比等呈不显著到显著的遗传负相关;李开隆等[22]通过对山杨材性与生长性状的相关性分析得出:纤维长、纤维宽及纤维长宽比均与树高、胸径等生长性状相关不显著。以上研究表明:纤维性状与生长性状呈一定的相关性,但相关性均不显著,说明纤维性状与生长性状间具有一定的独立性,在进行林木选育时可实现生长与材性同步选择。本研究分析了供试杨树无性系的生长性状与纤维性状间的相关性,发现纤维宽与树高、胸径及生物量呈正相关,但不显著,纤维长、纤维长宽比及纤维素质量分数分别与胸径、树高及生物量呈负相关性,且均不显著。该结论与以上研究结论[19-22]具有一定的相似性。杨树生长性状与纤维性状间存在着负相关或相关性不显著,说明这2个性状在遗传机制中是相互独立的,可开展杨树生长性状与纤维性状的联合改良。
多性状综合评价选择法能够在相关性复杂的多性状之间权衡取舍,使目标性状得到进一步改良,同时又能够保留其他优良性状。本研究利用主成分分析加权综合得分法对杨树无性系进行综合评价,初步筛选出XL-80、XL-58、XL-86、ZH-17、XL-83等5个优良无性系,无性系XL-58的纤维长度最长,高出群体均值7.25%;无性系XL-80的生物量最大,高出群体均值33.11%;无性系XL-86和ZH-17的纤维素含量最高,高出群体均值3.32%;无性系XL-83各性状虽没有最突出的,但各性状在供试无性系评比中排序都是靠前的,也均达到了优良纤维材的整体水平[23-24]。综上所述,评价筛选的5个优良纤维材无性系综合了各性状的优良特性,既考虑到了生长性状又兼顾了纤维性状对林木选优的影响,能够最大程度地实现物尽其用,达到杨树无性系资源利用的最大化,同时也为杨树多目标育种提供了更丰富的遗传资源与选育途径。
4.2 结论
本研究表明:7个杨树无性系生物量、木材纤维长及单株纤维素差异显著,纤维素质量分数存在一定的差异,各性状变异幅度较大,这些为杨树资源的良种选育及性状改良提供了遗传基础与参考依据;主成分分析表明:生物量、纤维素质量分数和单株纤维素代表了杨树无性系各性状的综合水平,是杨树纤维材评选的主导因子。综合评价选出木材纤维性状综合表现较优的5个无性系(XL-80、XL-58、XL-86、ZH-17、XL-83),这些无性系除生长性状表现优良外,木材纤维各项指标均达到了造纸所需原料的中优水平。
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表 1 引物信息
Table 1. Primers used in the study
引物名称 引物序列(5′→3′) 上游引物 GGGTTCTTTGTCTTTCTTG 下游引物 ACCTGGATTTGGGACTCTT M13F TGTAAAACGACGGCCAGT M13R CAGGAAACAGCTATGACC GhACTIN-F ATCCTCCGTCTTGACCTTG GhACTIN-R TGTCCGTCAGGCAACTCAT GhMGD3-F CTTGTTTTCTTTTCTTCTTGGTGGA GhMGD3-R TGATAATAATAGCCGTTGTTGTTGA -
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